PVC上門

PVC上門
クラミジア・トラコマティス
科学的分類 （一時的）
ドメイン：	細菌
クレード:	ハイドロバクテリア
上門:	PVC上門
門
クラミジオタ キリティマティエロタ レンティスファエ ロタ プランクトミセトータ ヴェルコミクロビオタ 「Ca. Hydrogenedentes」 「Ca. Aureabacteria」 「Ca. Omnitrophica」
同義語
プランクトバクテリアキャバリエ・スミス、1987 [1]

PVC上門は細菌の上門であり、その3つの重要なメンバーであるプランクトミセト門、ヴェルコミクロビオタ門、クラミジオタ門にちなんで名付けられました。^{[2] [3]}キャバリエ・スミスは、PVC細菌はおそらくペプチドグリカン細胞壁を2度失ったか減少したと仮定しました。^{[4] PVC系統群のメンバーが、最初の原始真}核細胞を生み出した共生イベントの宿主細胞であった可能性があるという仮説が立てられています。^{[5] [6]}

キャバリエ＝スミスはこのグループをプランクトバクテリアと呼び、門とみなしている。しかし、これは科学界全体では支持されていない。^[7]キャバリエ＝スミスの細菌大分類では、このグループは細菌のグラシリクテス亜界に属し、クラミジオタ門、レンティスファエロタ門、プランクトミセトタ門、ヴェルコミクロビオタ門から構成される。^{[4] [8]}

従来の分子系統学の見解では、プランクトミセトタ、ヴェルコミクロビオタ、クラミジオタは門とみなされ、候補門オムニトロフィカ^[12] (旧OP3) およびポリバクテリア [13] とともにPVC上門にクラスター化されています。ポリバクテリア[ ^{14]を除くPVCメンバーは、}保存されたシグネチャータンパク質の形で重要な分子マーカーを一貫して共有していることがわかりました。保存されたシグネチャータンパク質は、シナポモルフィック特性を表すマーカーであり、この細菌グループを区別する手段である可能性があります。2014年には、研究によりこのタンパク質が特徴付けられ、DNA / RNA結合において重要なハウスキーピング機能を果たすことが示されました。^[15] この観察は、PVC上門を区別する手段を提供するだけでなく、他の細菌とは異なるこのクレードが共有する進化的関係を強く支持しています。 [ ^{16 ]}

プランクトミセト門、ヴェルコミクロビオタ門、クラミジア門に特有の保存されたシグネチャーインデル（CSI）も発見されており、各門を互いに、また他の細菌と区別しています。^{[15] [17]} RNAポリメラーゼタンパク質RpoBの3つのアミノ酸の挿入は、配列が決定されているすべてのヴェルコミクロビア、クラミジア、およびレンティスファエラエ種に共通であることが発見されています。CSIは隣接するプランクトミセテスおよびポリバクテリアには存在せず、CSIが特異的なグループには共通の祖先があることを示唆しています。^[15]

この系統群の存在を示すさらなる証拠が発見されている。^{[18] [19]}これらには、膜コート様タンパク質、チューブリン、ステロール合成、凝縮DNAの存在などが含まれる。