ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| PRPF3 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | PRPF3、プレmRNA処理因子3、HPRP3、HPRP3P、PRP3、Prp3p、RP18、SNRNP90 |
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| 外部ID | オミム:607301; MGI : 1918017;ホモロジーン: 3447;ジーンカード:PRPF3; OMA :PRPF3 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体3(マウス)[2] |
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| | バンド | 3|3 F2.1 | 始める | 95,737,436 bp [2] |
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| 終わり | 95,763,197 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 腓骨神経
- 右子宮管
- 左卵巣
- 右卵巣
- 甲状腺の左葉
- 甲状腺の右葉
- 下垂体前葉
- 小脳半球
- 小脳の右半球
- 子宮体部
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| | トップの表現 | - 胎児の尾
- 性器結節
- 原始的な線
- 心室帯
- 胚葉上層
- 網膜の神経層
- 耳小胞
- 卵黄嚢
- 耳板
- 一次卵母細胞
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 |
- カハールボディ
- U4/U6 x U5 トリスnRNP複合体
- スプライソソーム複合体
- 核
- 核質
- 細胞質
- 核の粒
- タンパク質含有複合体
- U2型プレ触媒スプライソソーム
| | 生物学的プロセス |
- エステル交換反応によるRNAスプライシング
- スプライソソームを介したmRNAスプライシング
- mRNA処理
- スプライソソームトリ-snRNP複合体の組み立て
- RNAスプライシング
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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U4/U6小核リボ核タンパク質Prp3は、ヒトではPRPF3遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5]
関数
核内プレmRNAからのイントロンの除去は、4つの小さな核内リボ核タンパク質(snRNP)粒子と不特定数の一時的に結合したスプライシング因子からなるスプライソソームと呼ばれる複合体で起こる。PRPF3は、U4およびU6 snRNPと結合するいくつかのタンパク質の1つである。[OMIM提供] [5]
インタラクション
PRPF3はDVL3と相互作用することが示されている。[6]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000117360 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000015748 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ ab "Entrez Gene: PRPF3 PRP3 pre-mRNAプロセシング因子3ホモログ(S. cerevisiae)".
- ^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, et al. (2005年10月). 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」. Nature . 437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
さらに読む
- Maruyama K, Sugano S (1994年1月). 「オリゴキャッピング: 真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」. Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Xu SY、Schwartz M、 Rosenberg T、Gal A (1996 年 8 月)。「常染色体優性網膜色素変性症の 9 番目の遺伝子座 (RP18) は、染色体 1 のセントロメア周辺領域に位置している」。 ヒト分子遺伝学。5 (8): 1193–7。doi : 10.1093/hmg/5.8.1193。PMID 8842740。
- Wang A、Forman-Kay J、Luo Y、Luo M、Chow YH、Plumb J、Friesen JD、Tsui LC、Heng HH、Woolford JL、Hu J (1997 年 11 月)。「スプライソソームの相互作用成分である Hprp3p および Hprp4p をコードするヒト遺伝子の同定と特性評価」。ヒト分子 遺伝学。6 (12): 2117–26。doi : 10.1093/hmg/6.12.2117。PMID 9328476。
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997年10月). 「全長濃縮cDNAライブラリーおよび5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Horowitz DS 、Kobayashi R、Krainer AR (1997 年 12 月)。 「新しいシクロフィリンと酵母 Prp3 および Prp4 のヒト相同体が U4/U6 snRNP と結合した複合体を形成する」。RNA。3 ( 12 ): 1374–87。PMC 1369579。PMID 9404889 。
- Heng HH、Wang A、Hu J (1998 年 3 月)。「U4/U6 関連スプライシング因子をコードするヒト HPRP3 および HPRP4 遺伝子の染色体 1q21.1 および 9q31-q33 へのマッピング」。Genomics . 48 ( 2): 273–5. doi :10.1006/geno.1997.5181. PMID 9521884。
- Xu SY、Rosenberg T 、Gal A ( 1998 年 4 月)。「常染色体優性網膜色素変性症遺伝子座 RP18 の精密遺伝子マッピングにより、染色体 1q の D1S442 と D1S2858 間の重要な領域が 2 cM に縮小されました」。Human Genetics。102 ( 4 ): 493–4。doi :10.1007/s004390050728。PMID 9600251。S2CID 39815355 。
- Reidt U、Reuter K、Achsel T、Ingelfinger D、Lührmann R、Ficner R (2000 年 3 月)。「ヒト U4/U6 小型核リボ核タンパク質粒子特異的 SnuCyp-20 (核シクロフィリン) の結晶構造」( PDF ) 。The Journal of Biological Chemistry。275 ( 11): 7439–42。doi : 10.1074 /jbc.275.11.7439。PMID 10713041。S2CID 20261807 。
- Chakarova CF、Hims MM、Bolz H、Abu-Safieh L、Patel RJ、Papaioannou MG、Inglehearn CF、Keen TJ、Willis C、Moore AT、Rosenberg T、Webster AR、Bird AC、Gal A、Hunt D、Vithana EN、Bhattacharya SS (2002 年 1 月)。「常染色体優性網膜色素変性症に関与する、プレ mRNA スプライシング因子遺伝子の 3 番目のメンバーである HPRP3 の変異」。ヒト分子 遺伝学。11 (1): 87–92。doi : 10.1093/hmg/11.1.87。PMID 11773002。
- Horowitz DS、Lee EJ、Mabon SA 、Misteli T (2002 年 2 月)。「シクロフィリンはプレ mRNA スプライシングで機能する」。EMBO ジャーナル。21 ( 3): 470–80。doi :10.1093/ emboj /21.3.470。PMC 125845。PMID 11823439。
- Gonzalez-Santos JM、Wang A、Jones J、Ushida C、Liu J、Hu J (2002 年 6 月)。「ヒトスプライシング因子 Hprp3p の中心領域は Hprp4p と相互作用する」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 26): 23764–72。doi : 10.1074/ jbc.M111461200。PMID 11971898。
- Nottrott S、Urlaub H、 Lührmann R (2002 年 10 月)。「U4/U6 snRNA との階層的かつクラスター化されたタンパク質相互作用: U4/U6 タンパク質の生化学的役割」。EMBOジャーナル。21 ( 20): 5527–38。doi :10.1093 / emboj/cdf544。PMC 129076。PMID 12374753。
- Ajuh P、Chusainow J、Ryder U、Lamond AI (2002 年 12 月)。「単純ヘルペスウイルス感染に必要な宿主タンパク質であるヒト因子 C1 (HCF-1) の pre-mRNA スプライシングにおける新しい機能」。EMBOジャーナル。21 ( 23 ) : 6590–602。doi :10.1093/emboj/cdf652。PMC 136956。PMID 12456665。
- マルティネス=ヒメノ M、ガムンディ MJ、エルナン I、マセラス M、ミラ E、アユソ C、ガルシア=サンドバル B、ベネート M、ビレラ C、ベゲット M、アンティニョロ G、カルバロ M (2003 年 5 月)。 「常染色体優性網膜色素変性症のスペイン人家族におけるプレmRNAスプライシング因子遺伝子PRPF3、PRPF8、およびPRPF31の変異」。調査眼科学と視覚科学。44 (5): 2171–7。土井: 10.1167/iovs.02-0871。PMID 12714658。
- Reidt U、Wahl MC、Fasshauer D、 Horowitz DS、Lührmann R、Ficner R (2003 年 8 月)。「ヒトスプライソソームシクロフィリン H と U4/U6 snRNP-60K ペプチドの複合体の結晶構造」。Journal of Molecular Biology。331 ( 1): 45–56。doi :10.1016/S0022-2836(03)00684-3。hdl : 11858/00-001M-0000-0012-F238- B。PMID 12875835 。
- 和田 裕、板橋 哲、佐藤 英、玉井 正 (2004 年 11 月)。 「HPRP3遺伝子のThr494Met変異に関連する常染色体優性網膜色素変性症の日本人家族の臨床的特徴」。Graefe の臨床および実験眼科アーカイブ = Albrecht von Graefes Archiv für Klinische und Experimentelle Ocularmologie。242 (11): 956–61。土井:10.1007/s00417-004-0923-x。PMID 15085354。S2CID 22773384 。
- Stanĕk D、Neugebauer KM (2004 年 9 月) 。「蛍光共鳴エネルギー移動によるカハール体における snRNP アセンブリ中間体の検出」。The Journal of Cell Biology。166 ( 7): 1015–25。doi : 10.1083 /jcb.200405160。PMC 2172029。PMID 15452143。
- 蒔田 裕、北浦 裕、有賀 裕、井口・有賀 SM (2005 年 1 月)。 「tri-snRNP複合体における優性網膜色素変性症の原因遺伝子産物であるPAP-1とPrp3pの関連」。実験細胞研究。302 (1): 61-8.土井:10.1016/j.yexcr.2004.08.022。PMID 15541726。
外部リンク
- GeneReviews/NIH/NCBI/UW の網膜色素変性症に関するエントリーの概要