ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
ポルク 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 1T94、2LSI、2OH2、2W7O、2W7P、3IN5、3PZP、4BA9、4GK5、4U6P、4U7C
識別子 エイリアス POLK 、DINB1、DINP、POLQ、ポリメラーゼ (DNA) カッパ、DNA ポリメラーゼ カッパ 外部ID オミム ：605650; MGI : 1349767; ホモロジーン ：32140; ジーンカード ：POLK; OMA :POLK - オルソログ RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 アキレス腱 脳梁 浅側頭動脈 結腸上皮 副鼻腔粘膜 ヒップの皮膚 海綿骨 単球 ランゲルハンス島 滑膜
参照表現データの詳細
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能
トランスフェラーゼ活性 損傷したDNA結合 DNA指向性DNAポリメラーゼ活性 DNA結合 ヌクレオチジルトランスフェラーゼ活性 金属イオン結合 タンパク質結合 細胞成分 生物学的プロセス
ヌクレオチド除去修復、DNAギャップ充填 DNA複製 トランスレジョン合成 転写連動ヌクレオチド除去修復 ヌクレオチド除去修復、DNA切断 DNAの生合成プロセス ヌクレオチド除去修復、DNA切断、5'-to損傷 DNA修復 DNA損傷刺激に対する細胞反応 紫外線に対する細胞反応 エラーを起こしやすいトランスレジョン合成 エラーのないトランスレジョン合成 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_016218 NM_001345921 NM_001345922
RefSeq (タンパク質) NP_001332850 NP_001332851 NP_057302 NP_057302.1
NP_001334531 NP_001334532 NP_001334533 NP_001334535 NP_036178
場所 (UCSC) 5 章: 75.51 – 75.6 Mb 該当なし PubMed 検索 [2] [3]
ウィキデータ
DNAポリメラーゼκ は、ヒトでは POLK 遺伝子によってコードされる DNAポリメラーゼ である。これは 、トランス損傷合成 に関与している 。 [4] [5] [6]
参考文献
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さらに読む
Bavoux C、Hoffmann JS、Cazaux C (2005)。「DNA 損傷への適応と遺伝的不安定性の刺激: 両刃の剣である哺乳類 DNA ポリメラーゼ カッパ」。Biochimie . 87 ( 7): 637–46. doi :10.1016/j.biochi.2005.02.007. PMID 15989980。 Ogi T, Kato T, Kato T, Ohmori H (2000). 「大腸菌変異誘発タンパク質dinBの哺乳類ホモログであるDINB1による変異増強」. Genes Cells . 4 (11): 607–18. doi : 10.1046/j.1365-2443.1999.00289.x . PMID 10620008. S2CID 6554870. Johnson RE、Prakash S、 Prakash L (2000)。「ヒト DINB1 遺伝子は DNA ポリメラーゼ Polθ をコードする」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 97 ( 8): 3838–43。Bibcode : 2000PNAS ...97.3838J。doi : 10.1073 / pnas.97.8.3838。PMC 18103。PMID 10760255 。 Gerlach VL、Feaver WJ、Fischhaber PL、Friedberg EC (2001)。「ヒト DINB1 遺伝子によってコードされる DNA ポリメラーゼ pol kappa の精製と特性評価」。J . Biol. Chem . 276 (1): 92–8. doi : 10.1074/jbc.M004413200 . PMID 11024016。 Haracska L, Unk I, Johnson RE, et al. (2002). 「PCNA によるヒト DNA ポリメラーゼ κ の DNA 合成活性の刺激」 Mol. Cell. Biol . 22 (3): 784–91. doi :10.1128/MCB.22.3.784-791.2002. PMC 133560. PMID 11784855 . Washington MT、Johnson RE、Prakash L、Prakash S (2002)。「ヒト DINB1 エンコード DNA ポリメラーゼ κ は、ミスペアプライマー末端の無差別エクステンダーである」。Proc . Natl . Acad. Sci. USA . 99 ( 4 ): 1910–4。Bibcode : 2002PNAS ...99.1910W。doi : 10.1073/pnas.032594399。PMC 122293。PMID 11842189 。 Suzuki N, Ohashi E, Kolbanovskiy A, et al. (2002). 「dG-(+)- または dG-(−)-anti-N(2)-BPDE (7,8-ジヒドロキシ-anti-9,10-エポキシ-7,8,9,10-テトラヒドロベンゾ[a]ピレン) の単一立体異性体を含む DNA テンプレート上のヒト DNA ポリメラーゼ カッパによるトランスレジョン合成」。 生化学 。41 ( 19 ): 6100–6。doi :10.1021/bi020049c。PMID 11994005 。 Fischhaber PL、Gerlach VL、Feaver WJ、他 (2002)。「ヒト DNA ポリメラーゼ カッパは、in vitro でのトランスレジョン合成中にチミングリコールをバイパスしてその先まで伸び、正しいヌクレオチドを優先的に取り込む」。J . Biol. Chem . 277 (40): 37604–11. doi : 10.1074/jbc.M206027200 . PMID 12145297。 Bergoglio V、Bavoux C、Verbiest V、et al. (2003)。「ヒト DNA ポリメラーゼ カッパの複製焦点への局在」。J . Cell Sci . 115 (Pt 23): 4413–8. doi :10.1242/jcs.00162. PMID 12414988. S2CID 84437951。 Haracska L、Prakash L、Prakash S (2003)。「トランスレジョン合成における伸長因子としてのヒト DNA ポリメラーゼ κ の役割」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (25): 16000–5. doi : 10.1073/pnas.252524999 . PMC 138554 . PMID 12444249。 Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932 。 Wolfle WT、Washington MT、Prakash L、Prakash S (2003)。「ヒト DNA ポリメラーゼ κ は、テンプレートとプライマーのミスアラインメントを、ミスペア末端を延長し、単一塩基の欠失を生成するための新しい手段として利用します」。Genes Dev . 17 (17): 2191–9. doi :10.1101/gad.1108603. PMC 196459 . PMID 12952891。 Haracska L、Prakash L、Prakash S (2003)。「低忠実度のヒトYファミリーDNAポリメラーゼを塩基除去修復から排除するメカニズム」。Genes Dev . 17 (22): 2777–85. doi :10.1101/gad.1146103. PMC 280626 . PMID 14630940。 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。 Suzuki N, Itoh S, Poon K, et al . (2004). 「ヒト DNA ポリメラーゼ η および κ によるエストロゲン由来 DNA 付加物の 通過 による損傷乗り越え合成」。 生化学。43 ( 20 ): 6304–11。doi :10.1021/bi0360298。PMID 15147214。 Ohashi E, Murakumo Y, Kanjo N, et al. (2005). 「hREV1 と 3 つのヒト Y ファミリー DNA ポリメラーゼとの相互作用」。Genes Cells . 9 (6): 523–31. doi :10.1111/j.1356-9597.2004.00747.x. PMID 15189446. S2CID 24470762. Washington MT、Minko IG、Johnson RE、他 (2004)。「ヒト DNA ポリメラーゼ ι および κ の連続作用による、マイナーグルーブ DNA 付加物を通過する効率的でエラーのない複製」。Mol . Cell. Biol . 24 (13): 5687–93. doi :10.1128/MCB.24.13.5687-5693.2004. PMC 480884. PMID 15199127 。 Uljon SN、Johnson RE、Edwards TA 、 他 (2005)。「ヒトDNAポリメラーゼκの触媒コアの結晶構造」。 構造 。12 ( 8): 1395–404。doi : 10.1016/j.str.2004.05.011。PMID 15296733 。
外部リンク
