PCDH20

PCDH20
識別子
エイリアス	PCDH20、PCDH13、プロトカドヘリン20
外部ID	オミム：614449; MGI : 2443376;ホモロジーン: 11277;ジーンカード：PCDH20; OMA :PCDH20 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体13（ヒト）
終わり	61,415,522 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	14番染色体（マウス）
終わり	88,708,832 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	上前頭回; ; 睾丸; ; 前頭前皮質; ; 海馬本体; ; 膝窩動脈; ; 脛骨動脈; ; アキレス腱; ; ブロードマン領域9; ; 前帯状皮質; ; 胸部大動脈下行;
	トップの表現
	卵形嚢; ; 前庭感覚上皮; ; 蝸牛管の前庭膜; ; 歯状回; ; 海馬歯状回顆粒細胞; ; 海馬本体; ; 脊髄の腰椎部分; ; 内リンパ管; ; 海馬のI領域; ; 乳頭体;
	参照表現データの詳細
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	カルシウムイオン結合; RNA結合;
細胞成分	膜の不可欠な構成要素; 細胞膜; 膜; 細胞膜の不可欠な構成要素;
生物学的プロセス	細胞接着; 細胞膜接着分子を介した同種親和性細胞接着;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	64881
	219257
	ENSG00000280165
	ENSMUSG00000050505
	翻訳:
	翻訳
	NM_022843
	NM_178685
	NP_073754
	NP_848800
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

プロトカドヘリン20は、ヒトではPCDH20遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]

この遺伝子は、カドヘリンスーパーファミリーのサブファミリーであるプロトカドヘリン遺伝子ファミリーに属します。この遺伝子は、6つの細胞外カドヘリンドメイン、膜貫通ドメイン、および古典的なカドヘリンとは異なる細胞質テールを含むタンパク質をコードします。その特定の機能は未解明ですが、カドヘリン関連神経受容体は、脳内の特定の細胞間接続の確立と機能に役割を果たしていると考えられています。^[5]

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000280165 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000050505 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ ab "Entrez Gene: PCDH20 プロトカドヘリン 20".

さらに読む

鈴木ST (2000). 「プロトカドヘリン研究の最近の進歩」. Exp. Cell Res . 261 (1): 13–8. doi :10.1006/excr.2000.5039. PMID 11082270.
Nollet F、Kools P、van Roy F (2000)。「カドヘリンスーパーファミリーの系統発生解析により、いくつかの単独メンバーに加えて 6 つの主要なサブファミリーを識別できるようになりました」。J . Mol. Biol . 299 (3): 551–72. doi :10.1006/jmbi.2000.3777. PMID 10835267。
Yagi T, Takeichi M (2000). 「カドヘリンスーパーファミリー遺伝子：機能、ゲノム構成、神経学的多様性」。Genes Dev . 14 (10): 1169–80. doi : 10.1101/gad.14.10.1169 . PMID 10817752. S2CID 44844497.
Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
太田孝文、鈴木勇、西川孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039. S2CID 21903526.
Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
Wu Q、Maniatis T (2000)。「複数のエクトドメインをコードする大きなエクソンは、プロトカドヘリン遺伝子の特徴である」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 97 (7): 3124–9. doi : 10.1073/pnas.060027397 . PMC 16203 . PMID 10716726。
Cross SH、Charlton JA、Nan X、Bird AP (1994)。「メチル化DNA結合カラムを用いたCpGアイランドの精製」。Nat . Genet . 6 (3): 236–44. doi :10.1038/ng0394-236. PMID 8012384. S2CID 12847618.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000280165 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000050505 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[entrez-5] "Entrez Gene: PCDH20 プロトカドヘリン 20".