海洋生物多様性情報システム

海洋生物多様性情報システム（OBIS）（旧称：海洋生物地理情報システム）は、海洋に生息する生物種の分布と個体数に関する情報へのウェブベースのアクセスポイントです。これは、10年ごとの海洋生物センサス（CoML）（2001～2010年）の情報管理コンポーネントとして開発されましたが、CoML由来のデータに限定されず、各データ管理者がオープンアクセスベースで提供する可能性のあるすべての海洋生物多様性データの統合ビューを提供することを目指しています。2018年7月時点のウェブサイトによると、OBISは「科学、保全、持続可能な開発のための海洋生物多様性に関するグローバルなオープンアクセスデータおよび情報クリアリングハウス」です。OBISサイトには8つの具体的な目標が記載されており、その中で最も重要な項目は「すべての海洋生物の多様性、分布、個体数に関する世界最大の科学的知識ベースを統合的かつ標準化された形式で提供する」ことです。^{[ 1 ]}

OBIS の最初のアイデアは、1997 年 10 月に底生海洋生物に関する CoML 会議で開発されました。このワークショップの勧告により、1998 年にラトガース大学で Web サイト ( http://marine.rutgers.edu/OBIS 2006 年 10 月 24 日にWayback Machineにアーカイブ) が作成され、OBIS の初期コンセプトが示されました。^{[ 2 ]} 1999 年 11 月 3 ～ 4 日にワシントン DC で最初の OBIS 国際ワークショップが開催され、プロジェクトの範囲設定と潜在的なパートナーへの働きかけが行われ、選ばれた貢献がOceanography誌の特別号に掲載されました。^{[ 3 ]}その中で、OBIS の創設者であるJF Grassle博士は、OBIS のビジョンを「多次元の地理的コンテキストで海洋生物データにアクセス、モデリング、マッピングするためのオンラインの世界的アトラス」と明確に述べました。^{[ 4 ]} 2000 年 5 月、米国政府機関は国立海洋学パートナーシップ プログラムとアルフレッド P. スローン財団とともに8 つの研究プロジェクトに資金を提供し、OBIS を開始しました。2001 年 5 月、米国国立科学財団は、 OBIS のグローバル ポータルを開発するためにラトガース大学に資金を提供しました。また、2001 年に OBIS 国際委員会が設立され、最初の会議が 2001 年 8 月に開催されました。^{[ 5 ]}

OBISポータルの製品版は、2002年にラトガース大学でウェブサイトhttp://www.iobis.orgとして公開され、FishBaseの魚類、CephBaseの頭足類、 Biogeoinformatics of Hexacoralsのサンゴ、 Indo-Pacific Mollusc Databaseの軟体動物など、8つのパートナーデータベースから43万件の種ベースの地理参照データレコードを提供しました。^{[ 6 ]} 2006年5月までに、OBISポータルは112のデータベースから59,000種の950万件のレコードにアクセスできるようになりました。^{[ 7 ]}また、2010年12月（海洋生物センサスの終了時）には、167,000の分類群名を表す2,770万件のレコードへのアクセスを提供しました。^{[ 8 ]} 2018年7月現在、OBISのウェブサイトによると、このシステムは56か国の500の機関からの貢献に基づき、約12万種の海洋生物の4500万件を超える観察記録へのアクセスを提供している（引用されている名前の数が少ないのは、同義語解決、つまり複数の名前で記録された分類群を単一の承認された名前に減らした結果である）。^{[ 9 ]}

2009年、OBISはユネスコ政府間海洋学委員会（IOC）の国際海洋データ情報交換（IODE）プログラムのプロジェクトとして採用され、2011年には、スローン財団からのラトガース大学を拠点とする事務局とポータルへの資金提供が終了したため、ベルギーのオステンドにあるフランダース海洋研究所（VLIZ）からのホスティングの申し出が受け入れられ、システムの長期ホストとなりました。また、OBIS事務局もラトガース大学からオステンドのIOC IODEプロジェクトオフィスに移転し、現在OBISはそこで維持管理され、追加開発が行われています。ウェブアドレスは変更され、OBISは現在、VLIZと同じ建物内のオステンドに拠点を置いています。VLIZは、海洋生物種世界登録簿と海洋および非海洋属暫定登録簿IRMNGという2つの分類データベースを管理しており、これらはOBISにおける種ベースの情報の表示を制御するために使用される分類学的決定に利用され、OBISコンテンツをナビゲートするための分類階層も提供しています。OBISは現在、IODEの運営下にあり、IODE OBIS運営グループ（SG-OBIS）からの助言を受けています。運用活動は、さまざまなOBISタスクチームと臨時のOBISプロジェクトチームの支援を受けて、OBIS執行委員会（OBIS-EC）によって指揮されています。 OBIS事務局は、ベルギーのオステンドにあるIODEのUNESCO/IOCプロジェクトオフィス内に設置されており、OBISプロジェクトマネージャーとデータマネージャーが所属し、OBISシステムの維持管理に加え、データ提供者へのトレーニングと技術支援、新しいデータ標準と技術開発の指導、ネットワークのグループ利益を促進するための国際協力の奨励も行っている。^{[ 10 ]}

OBISを通じて入手可能なデータは、海洋や汽水域の生息地と何らかの関連性を持つすべての生物群を対象としており、海岸線や海洋上空の大気も含まれています。例えば、海洋脊椎動物（魚類、海洋哺乳類、カメ、海鳥など）、海洋無脊椎動物（動物プランクトンを含む）、海洋細菌、海洋植物（植物プランクトン、海藻、マングローブなど）などが挙げられます。

利用可能なウェブ技術が発展するにつれて、OBIS ポータルは2002 年の創設以来、数多くの改良を重ねてきました。当初、システムはユーザーのクエリに応じてリアルタイムでリモートデータを取得し、KGS  Mapperを使用して結果を視覚化していました。2004 年に、メタデータの集中インデックス作成とキャッシュが導入され、より高速で信頼性の高い結果が得られるようになり、c-squares  mapper がデータ視覚化のオプションに追加されました。^{[ 11 ]} 2010 年に、完全なウェブ GISベースのシステムが初めて導入され、Web サイトの新バージョンも登場しました。これにより、検索結果の表示が大幅に詳細かつ柔軟になり、多数の新しい検索オプションが追加されました。^{[ 12 ]} 2018 年 4 月に、機能が向上した OBIS の新しい「2.0」バージョンの開発資金が発表され、^{[ 13 ]} 2019 年 1 月 29 日にリリースされました。^{[ 14 ]} Web サイトの URL は iobis.org から obis.org に変更されました。

2004年から現在にかけて、地域OBISノードの国際ネットワークも構築され、各地域のデータソースをマスターOBISデータネットワークに接続しやすくするとともに、それぞれの地域のユーザーに対してOBISデータの専門的なサービスやビューを提供するようになってきている。

• 南極OBIS

ベルギー生物多様性プラットフォーム（ブリュッセル）とフランダース海洋研究所（オステンド）が主催。ブルーノ・ダニスが運営。

• アルゼンチン

パタゴニコ国立公園 - (CENPAT) - CONICET が主催。マーサ・ルイスが管理

• オーストラリア

主催：オーストラリア連邦科学産業研究機構（CSIRO）海洋大気部門。管理：デイブ・ワッツ

• カナダ

海洋生物多様性センターとベッドフォード海洋研究所が主催。ボブ・ブラントンが運営。

• 中国

海洋学研究所主催。管理：孫暁霞

• ヨーロッパ

ヴラームス研究所が主催。ワード・アペルタンズが管理

• インド洋

国立化学研究所と国立海洋研究所が主催。ババ・インゴレが運営。

• 日本

国立環境研究所主催。管理：志村順子

• ニュージーランド／南西太平洋

国立水大気研究所主催。ドン・ロバートソン管理。

• サハラ以南のアフリカ

南アフリカ海洋学データセンターがホスト。マーテン・グルンドリングが管理。

• フィリピン

ASEAN生物多様性センター主催。クリスチャン・エロラン運営。

• 熱帯および亜熱帯の東南太平洋

コンセプシオン大学主催。ルーベン・エスクリバンド運営。

• 熱帯および亜熱帯の南大西洋西部

サンパウロ大学（USP）と環境情報リファレンスセンター（CRIA）が主催。ファビオ・ラング・ダ・シルベラが管理。

• アメリカ合衆国

米国地質調査所（USGS）が主催。アビー・ベンソンが管理。

• 海洋生物調査
• 世界海洋生物種登録簿（WoRMS）

• Grassle, JF および Stocks, KI、1999 年。海洋生物調査のためのグローバル海洋生物地理情報システム (OBIS)。海洋学12(3)、pp. 12-14。
• Grassle, JF 2000. 海洋生物地理情報システム（OBIS）：多次元地理的コンテキストで海洋生物データにアクセス、モデリング、マッピングするためのオンライン世界地図帳。Oceanography 13(3), pp. 5-7.
• Zhang, Y. および Grassle, JF 2003. 海洋生物地理情報システムのポータル。Oceanologica Acta 25(5), pp. 193-197.
• Mark J. Costello、J. Frederick Grassle、Yunqing Zhang、Karen Stocks、および Edward Vanden Berghe 2005。「何がどこにあり、何がどこにあるか？海洋生物種のオンラインマッピング」。MarBEFニュースレター。2005 年春号、20～22 ページ 。
• Wood JB、Zhang PY、Costello MJ、Grassle JF 2006。OBIS（www.iobis.org）の紹介。Miloslavich P.およびKlein E.編『カリブ海の海洋生物多様性：既知のものと未知のもの』所収。DEStech Publications Inc.、ペンシルベニア州ランカスター、米国、pp.  253–254。
• Costello MJ、Stocks K.、Zhang Y.、Grassle JF、Fautin DG 2007. 海洋生物地理情報システムについて。http: //hdl.handle.net/2292/5236より取得。
• Edward Vanden Berghe、Karen I. Stocks、J. Frederick Grassle。2010年。データ統合：海洋生物地理情報システム。Alasdair D. McIntyre編：世界の海洋における生命、Blackwell Publishing Ltd.の第17章（333-353ページ）。この章はhttp://www.comlmaps.org/mcintyre/ch17/data-integration-the-ocean-biogeographic-information-system でも閲覧可能。2017年5月7日にWayback Machineにアーカイブ済み。
• Vanden Berghe E、Halpin P、Lang da Silveira F、Stocks K、Grassle F. 2010. 海洋観測システムへの生物学的データの統合：OBISの将来の役割。Hall J、Harrison DE、Stammer D (編)『OceanObs'09 会議録：社会のための持続的な海洋観測と情報（第 2 巻）』所収。パリ、欧州宇宙機関出版物番号 WPP-306。
• Costello MJ、Vanhoorne B、Appeltans W. 2015. 分類学、データ公開、および協力的なインフラストラクチャを通じて生物多様性の保全を推進する。Conservation Biology 29 (4)、1094–1099。