イグニコッカス

イグニコッカス
	Ignicoccus Hospitalis (2 つの小型の共生Nanoarchaeum equitansを伴う)
科学的分類
ドメイン：	古細菌
門:	サーモプロテオタ
クラス：	熱タンパク質
注文：	デスルフォロコッカス
家族：	デスルフォロコッカス科
属:	イグニコッカス; フーバー、ブルクグラフ、マイヤー、ヴィシュコニー、レイチェル & ステッター 2000
タイプ種
	イグニコッカス・アイランドカス; フーバー＆ステッター 2000
種
	イヌタデ属; イロハモミジ; I. ホスピタリス;

イグニコッカスは海洋熱水噴出孔に生息する超好熱性古細菌の属である。 2000年にアイスランド北部のコルベインゼー海嶺と東太平洋海膨（北緯9度、西経104度）^{で採取されたサンプルから発見された。 [1]}

系統学

16S rRNA遺伝子の比較によると、イグニコッカスはデスルフォコッカス科の中で新しく、大きく分岐した系統を表しています。^[2]I. islandicus ^[1] 、I. pacificus ^[1]、I. hospitalis株KIN4Iの 3種が知られています。^[3]

細胞構造

イグニコッカス属の古細菌は、直径約2μmの小さな球状細胞を持ち、滑らかな表面と外膜を持ち、S層を持たない。^[4]

それらは、これまで知られていなかった細胞膜構造、すなわち細胞質膜、細胞周縁部空間（幅は20～400nmで、膜結合小胞を含む）、および外膜（幅は約10nmで、グラム陰性細菌の外膜に似ている）を持っている。後者には、多数の密集した不規則な単一粒子（直径約8nm）と直径24nmの孔があり、その周囲にはリング状に配置された小さな粒子（直径130nm）と、直径12nmの粒子が最大8個集まったクラスターがある。^[4]

これまで報告された2層の膜は、実際には細胞質突起からなる一種の内膜系である。I . hospitalisでは、これらの構造に共生古細菌Nanoarchaeum equitans が生息している。^[3]

生理

イグニコッカスは70～98℃の温度範囲（最適温度は90℃前後）で生息する。電子ドナーとして分子状水素を用いて元素硫黄を硫化水素に還元することでエネルギーを得る。^[2]ナノアーキウム・エクイタンスとの独特な共生（または寄生）も報告されている。^[2]

系統発生

現在受け入れられている分類法は、原核生物の命名法リスト（LPSN）^[5]と国立生物工学情報センター（NCBI）^{[6]に基づいています。}

参照

古細菌属の一覧

参考文献

^ abc Huber H、Burggraf S、Mayer T、Rachel R、Stetter KO (2000 年 11 月)。「Ignicoccus gen. nov. は、2 つの新種 Ignicoccus islandicus sp nov と Ignicoccus pacificus sp nov. によって表される、超好熱性、化学合成独立栄養性古細菌の新属です」。International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology。50 ( 6): 2093–2100。doi : 10.1099 /00207713-50-6-2093。PMID 11155984。
^ abc Huber H, Hohn MJ, Rachel R, Fuchs T, Wimmer VC, Stetter KO (2002 年 5 月 2 日). 「ナノサイズの超好熱性共生菌によって表される新門古細菌」 . Nature . 417 (6884): 63–67. Bibcode :2002Natur.417...63H. doi :10.1038/417063a. PMID 11986665. S2CID 4395094.
^ ab Heimerl T、Flechsler J、Pickl C、Heinz V、Salecker B、Zweck J、Wanner G、Geimer S、Samson RY、Bell SD、Huber H、Wirth R、Wurch L、Podar M、Rachel R (2017 年 6 月 13 日) ）。「ナノ古細菌エクイタンスによって利用される古細菌イグニコッカス病院の複雑な内膜システム」。微生物学のフロンティア。8 : 1072.土井: 10.3389/fmicb.2017.01072。PMC 5468417。PMID 28659892。
^ ab Rachel R, Wyschkony I, Riehl S, Huber H (2002 年 3 月). 「Ignicoccus の超微細構造: 古細菌における新しい外膜と細胞内小胞の出芽の証拠」Archaea . 1 (1): 9–18. doi : 10.1155/2002/307480 . PMC 685547 . PMID 15803654.
^ JP Euzéby. 「Ignicoccus」。命名法で定められた原核生物名のリスト（LPSN）。 2023年6月10日閲覧。
^ Sayers; et al. 「Ignicoccus」。国立生物工学情報センター(NCBI) 分類データベース。 2023年6月10日閲覧。
^ 「The LTP」。 2023年5月10日閲覧。
^ 「LTP_all tree in newick format」。2023年5月10日閲覧。
^ 「LTP_06_2022 リリースノート」(PDF) 。 2023年5月10日閲覧。
^ 「GTDBリリース08-RS214」。ゲノム分類データベース。 2023年5月10日閲覧。
^ "ar53_r214.sp_label".ゲノム分類データベース. 2023年5月10日閲覧。
^ 「分類の歴史」。ゲノム分類データベース。 2023年5月10日閲覧。

さらに読む

フーバー H、キューパー U、ダクサー S、レイチェル R (2012 年 8 月)。「超好熱性Crenarchaeon Ignicoccus Hospitalisの異常な細胞生物学」。アントニー・ファン・レーウェンフック。102 (2): 203–219。土井：10.1007/s10482-012-9748-5。PMID 22653377。S2CID 7732441 。
Nass B、Poll U、Langer JD、Kreuter L、Kuper U、Flechsler J、Heimer T、Rachel R、Huber H、Kletzin A (2014)。「超好熱性古細菌Ignicoccus hospitalis由来の3つのマルチヘムシトクロムc：精製、特性および局在」。微生物学。6（160）：1278–1289。doi ：10.1099/ mic.0.077792-0。PMID 24705227 。

外部リンク

BacDive の Ignicoccus - 細菌多様性メタデータ

[huber2000-1] Huber H、Burggraf S、Mayer T、Rachel R、Stetter KO (2000 年 11 月)。「Ignicoccus gen. nov. は、2 つの新種 Ignicoccus islandicus sp nov と Ignicoccus pacificus sp nov. によって表される、超好熱性、化学合成独立栄養性古細菌の新属です」。International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology。50 ( 6): 2093–2100。doi : 10.1099 /00207713-50-6-2093。PMID 11155984。

[huber2002-2] Huber H, Hohn MJ, Rachel R, Fuchs T, Wimmer VC, Stetter KO (2002 年 5 月 2 日). 「ナノサイズの超好熱性共生菌によって表される新門古細菌」 . Nature . 417 (6884): 63–67. Bibcode :2002Natur.417...63H. doi :10.1038/417063a. PMID 11986665. S2CID 4395094.

[heimerl2017-3] Heimerl T、Flechsler J、Pickl C、Heinz V、Salecker B、Zweck J、Wanner G、Geimer S、Samson RY、Bell SD、Huber H、Wirth R、Wurch L、Podar M、Rachel R (2017 年 6 月 13 日) ）。「ナノ古細菌エクイタンスによって利用される古細菌イグニコッカス病院の複雑な内膜システム」。微生物学のフロンティア。8 : 1072.土井: 10.3389/fmicb.2017.01072。PMC 5468417。PMID 28659892。

[rachel2002-4] Rachel R, Wyschkony I, Riehl S, Huber H (2002 年 3 月). 「Ignicoccus の超微細構造: 古細菌における新しい外膜と細胞内小胞の出芽の証拠」Archaea . 1 (1): 9–18. doi : 10.1155/2002/307480 . PMC 685547 . PMID 15803654.

[5] JP Euzéby. 「Ignicoccus」。命名法で定められた原核生物名のリスト（LPSN）。 2023年6月10日閲覧。

[NCBI-6] Sayers; et al. 「Ignicoccus」。国立生物工学情報センター(NCBI) 分類データベース。 2023年6月10日閲覧。

[7] 「The LTP」。 2023年5月10日閲覧。

[8] 「LTP_all tree in newick format」。2023年5月10日閲覧。

[9] 「LTP_06_2022 リリースノート」(PDF) 。 2023年5月10日閲覧。

[about-10] 「GTDBリリース08-RS214」。ゲノム分類データベース。 2023年5月10日閲覧。

[tree-11] "ar53_r214.sp_label".ゲノム分類データベース. 2023年5月10日閲覧。

[taxon_history-12] 「分類の歴史」。ゲノム分類データベース。 2023年5月10日閲覧。