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| メチロールエキス | |
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科学的分類 
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| ドメイン： | 細菌 |
| 門: | シュードモナドタ |
| クラス： | アルファプロテオバクテリア |
| 注文： | ヒポミクロバイオレ |
| 家族： | メチロバクテリア科 |
| 属: | メチロールルブルム |
| 種： | M.エクストルケンス
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| 二名法名 | |
| メチロールエキス (浦上と駒形 1984) グリーンとアードレー 2018 [1]
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| 同義語[2] [3] | |
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メチロールブルム・エクストルケンスはグラム陰性細菌である。メチロールブルム属はピンク色を呈することが多く、ピンク色色素の通性メチロトローフ（ PPFM）に分類される。 [4]野生型はメタンと多炭素化合物の両方をエネルギー源として利用することが知られている。 [4]具体的には、 M.エクストルケンスは主にメタノールとC1化合物をエネルギーサイクルの基質として利用することが観察されている。 [5]また、メタノール脱水素酵素活性を高めるためにランタニドを補因子として利用することも観察されている[6] [7]
遺伝的構造
土壌から分離後、M. extorquens は5.71 Mbの単一の染色体を持つことが判明しました。[8]細菌自体は、メタノールの代謝に使用される染色体の8 つの領域にわたって 70 個の遺伝子を含んでいます。 [9] M. extorquens AM1の染色体のセクション内には、メタノール中で増殖できるようにする 2 つの xoxF 遺伝子があります。[9]
M. extorquens AM1ゲノムは、機能不明の47.5 kbの遺伝子をコードしています。この遺伝子は、15,000残基を超える長さのポリペプチドと、発現していない3つのユニークな化合物をコードしています。[10]この微生物は、mxa遺伝子[11]を使用してメタノールを脱水素化し、エネルギー源として使用します。[10]
化学物質の使用
メチロールブルム・エクストルケンスは主にC1とC2の化合物を使って成長します。[9]炭素-炭素結合の少ない化合物を利用することで、細菌はメタノールを放出する気孔のある葉の表面など、メタノールのある環境でうまく成長することができます。[12]メタノールを炭素源とエネルギー源の両方として利用できる能力は、メディカゴ・トランカトゥラのコロニー形成に有利であることが示されました。[13]
H4MPT依存性ホルムアルデヒド酸化はM.extroquensAM1で初めて単離され、生物がメチロトローフ代謝を利用しているかどうかを定義するために使用されました。[ 10]
他の生物との関係
メチロバクテリア科に属する細菌の多くは、土壌、塵、植物の葉など、さまざまな生物環境に生息しています。[14]これらの細菌の中には、生息する植物と共生関係にあるものが発見されており、固定窒素を供給したり、ビタミンB12を生成したりしています。[14] M. extorquens は、植物がストレス反応を調節するために使用するPhyRも生成し、さまざまな条件下で植物が生き残れるようにしています。[15] PhyRに加えて、細菌は植物全体と根の成長に関連するホルモンを生成することができます。[9]
M. extorquens はイチゴと共生関係にあることがわかっています。[16]最終的に、M. extorquensは 1,2-プロパンジオールをラクトアルデヒドに酸化するのに使用され、これは後に化学反応に使用されます。[17]開花中の植物に導入されると、フラネオールの生産が増加し、イチゴの味が変わります。[16]
参照
参考文献
- ^ Green PN 、 Ardley JK (2018年9月)。「メチロバクテリウム属および近縁生物のレビュー：一部のメチロバクテリウム種を新属Methylorubrum gen. novに再分類する提案」。International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology。68 (9): 2727–2748。doi : 10.1099/ ijsem.0.002856。PMID 30024371。
- ^ LPSN lpsn.dsmz.de
- ^ Kato Y, Asahara M, Arai D, Goto K, Yokota A (2005年10月). 「Methylobacterium chloromethanicum と Methylobacterium dichloromethanicum を Methylobacterium extorquens の後継の主観的シノニムとして、また Methylobacterium lusitanum を Methylobacterium rhodesianum の後継の主観的シノニムとして再分類」. The Journal of General and Applied Microbiology . 51 (5): 287–299. doi : 10.2323/jgam.51.287 . PMID 16314683.
- ^ ab Lidstrom ME、 Chistoserdova L (2002年4 月)。「ピンクの植物: メチロバクテリウムによるサイトカイニン生成」。Journal of Bacteriology。184 ( 7 ): 1818。doi :10.1128/JB.184.7.1818.2002。PMC 134909。PMID 11889085。
- ^ Belkhelfa S、Roche D、Dubois I、Berger A、Delmas VA、Cattolico L、et al. (2019)。「Methylobacterium extorquens AM1およびTK 0001の非常に高いメタノール濃度への連続培養適応」。Frontiers in Microbiology。10：1313。doi ：10.3389 / fmicb.2019.01313。PMC 6595629。PMID 31281294。
- ^ Good, Nathan M.; Fellner, Matthias; Demirer, Kemal; Hu, Jian; Hausinger, Robert P.; Martinez-Gomez, N. Cecilia (2020年2月25日). 「ランタニド依存性アルコール脱水素酵素は、金属配位と酵素機能に必須のアスパラギン酸残基を必要とする」. Journal of Biological Chemistry . 295 (24): 8272–8284. doi : 10.1074/jbc.RA120.013227 . PMC 7294098. PMID 32366463 .
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- ^ Belkhelfa S, Labadie K, Cruaud C, Aury JM , Roche D, Bouzon M, et al. (2018年2月). 「ポーランドの土壌から分離された通性メチロトローフMethylobacterium extorquens TK 0001の完全ゲノム配列」。ゲノムアナウンスメント。6 (8). doi :10.1128/genomeA.00018-18. PMC 5824006. PMID 29472323 .
- ^ abcd Dourado MN、Camargo Neves AA、Santos DS、 Araújo WL (2015)。「ピンク色色素を持つ内生メチロトローフMethylobacterium sppのバイオテクノロジー的および農業的可能性」。BioMed Research International。2015 ： 909016。doi ：10.1155 /2015/ 909016。PMC 4377440。PMID 25861650。
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- ^ Nasopoulou C、Pohjanen J、Koskimäki JJ、Zabetakis I、Pirttilä AM (2014 年 8 月)。 「in situ ハイブリダイゼーションによるイチゴ組織におけるイチゴ (Fragaria x ananassa) とイチゴフレーバー生合成のメチロバクテリウム extorquens 遺伝子の局在化」。植物生理学ジャーナル。171 (13): 1099–1105。土井：10.1016/j.jplph.2014.03.018。PMID 24973582。
外部リンク
- Methylorubrum JP Euzéby: 命名法に載っている原核生物の名前の一覧
- メチロバクテリウム・エクストルクエンス NCBI
- BacDive の Methylobacterium extorquens の標準株 - 細菌多様性メタデータ