ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| LSM10 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | LSM10、MST074、MSTP074、U7小核RNA関連 |
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| 外部ID | OMIM : 617909; MGI : 2151045; HomoloGene : 13154; GeneCards : LSM10; OMA :LSM10 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体4(マウス)[2] |
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| | バンド | 4|4 D2.2 | 始める | 125,990,416 bp [2] |
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| 終わり | 125,992,377 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 太ももの筋肉
- 腓腹筋
- 顆粒球
- 心の頂点
- 単球
- 右耳介
- 骨格筋組織
- 前脛骨筋
- 大腿四頭筋
- S状結腸の筋層
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| | トップの表現 | - 心室中隔
- 一次卵母細胞
- 顆粒球
- 心内膜クッション
- 卵黄嚢
- 右腎臓
- 内側神経節隆起
- 肝臓の左葉
- 胚
- 胚
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- U7 snRNA結合
- タンパク質結合
- ヒストンpremRNA DCP結合
- RNA結合
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- 有糸分裂細胞周期のG1/S移行の正の調節
- RNAポリメラーゼII転写の終結
- mRNA処理
- ヒストン mRNA 代謝プロセス
- RNAスプライシング
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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U7 snRNA関連Sm様タンパク質LSm10は、ヒトではLSM10遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
インタラクション
LSM10はLSM3と相互作用することが示されている。[7] [8]
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000181817 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000050188 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Pillai RS、Will CL、Lührmann R、Schümperli D、Müller B (2001 年 10 月)。「精製された U7 snRNP には Sm タンパク質 D1 および D2 が欠けているが、新しい 14 kDa Sm D1 様タンパク質である Lsm10 が含まれている」( PDF ) 。The EMBO Journal。20 ( 19): 5470–9。doi :10.1093/ emboj /20.19.5470。PMC 125645。PMID 11574479 。
- ^ 「Entrez Gene: LSM10 LSM10、U7 小型核 RNA 関連」。
- ^ Lehner B、 Sanderson CM (2004年7月)。「ヒトmRNA分解 のためのタンパク質相互作用フレームワーク」。ゲノム研究。14 (7):1315–23。doi :10.1101/gr.2122004。PMC 442147。PMID 15231747。
- ^ ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實・岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ・グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルシュタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグ DS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサク S 、Sequerra R、Doucette-Stamm L、Cusick ME、Hill DE、Roth FP、Vidal M (2005 年 10 月)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
さらに読む
- Dominski Z、Zheng LX、Sanchez R、Marzluff WF (1999 年 5 月)。「ステムループ結合タンパク質は、ヒストン pre-mRNA への U7 snRNP 結合を安定化することで 3' 末端形成を促進する」。分子細胞生物学。19 (5): 3561–70。doi : 10.1128/ mcb.19.5.3561。PMC 84148。PMID 10207079。
- Dominski Z、Erkmann JA、Yang X、Sànchez R、Marzluff WF (2002 年 1 月)。「新しいジンクフィンガータンパク質は U7 snRNP と関連し、ヒストン pre-mRNP のステムループ結合タンパク質と相互作用して 3' 末端処理を刺激します」。遺伝子 と発達。16 ( 1): 58–71。doi :10.1101/ gad.932302。PMC 155312。PMID 11782445。
- Pillai RS、Grimmler M、Meister G、Will CL、Lührmann R、Fischer U、Schümperli D (2003 年 9 月)。「U7 snRNP のユニークな Sm コア構造: 特殊な SMN 複合体による組み立てとヒストン RNA 処理における新しいコンポーネント Lsm11 の役割」。遺伝子と発達 。17 ( 18 ): 2321–33。doi :10.1101/gad.274403。PMC 196468。PMID 12975319。
- Hassel S、Eichner A、Yakymovych M、Hellman U、Knaus P、Souchelnytskyi S (2004 年 5 月)。「タイプ II 骨形成タンパク質受容体 (BMPR-II) に関連し、2 次元ゲル電気泳動および質量分析によって同定されたタンパク質」。プロテオミクス 。4 ( 5 ) : 1346–58。doi :10.1002/pmic.200300770。PMID 15188402。S2CID 6773754。
- Lehner B、 Sanderson CM (2004年7 月)。「ヒト mRNA分解 のためのタンパク質相互作用フレームワーク」。ゲノム研究。14 (7): 1315–23。doi :10.1101/gr.2122004。PMC 442147。PMID 15231747。
- Azzouz TN、Pillai RS、Däpp C、Chari A、Meister G、Kambach C、Fischer U、Schümperli D (2005 年 10 月)。「U7 snRNP のアセンブリ ラインに向けて: U7 特異的 Lsm タンパク質と PRMT5 および SMN 複合体との相互作用」。The Journal of Biological Chemistry。280 ( 41): 34435–40。doi : 10.1074 /jbc.M505077200。hdl : 21.11116 /0000-0007-E5F1-6。PMID 16087681。
- Wagner EJ、Marzluff WF (2006 年 9 月)。「ヒストンの pre-mRNA 処理を制限する活性 U7 snRNP の構成要素である ZFP100 は、S 期への移行に必要である」。分子細胞 生物学。26 ( 17): 6702–12。doi :10.1128/MCB.00391-06。PMC 1592837。PMID 16914750。