| ケルチモチーフ | |||||||||||
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| 識別子 | |||||||||||
| シンボル | ケルチ_1 | ||||||||||
| パム | PF01344 | ||||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||||
| SCOP2 | 1gof / スコープ / SUPFAM | ||||||||||
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ケルチタンパク質(およびケルチ様タンパク質)は、複数のケルチモチーフを含むタンパク質の広範なグループです。ケルチドメインは通常、 βプロペラ三次構造を形成する5〜7個のケルチタンデムリピートのセットとして存在します。ケルチリピートβプロペラは、通常、タンパク質間相互作用に関与していますが、ドメイン構造の多様性とケルチモチーフ間の配列同一性の制限により、ケルチスーパーファミリーの特性評価は困難です。
構造
いくつかのケルチタンパク質の N 末端には、ディスコイジン、F ボックス、ブロード複合体、トラムトラック、ブリック・ア・ブラック/ポックスウイルス ジンクフィンガー (BTB/POZ) ドメインなどの他のタンパク質ドメインが含まれています。ケルチタンパク質は、β プロペラ構造のみを持つこともあります。ケルチタンパク質の BTB ドメイン (存在する場合) は、タンパク質間相互作用を媒介するホモ二量体またはヘテロ二量体の形成を可能にします。
ケルチタンパク質のC末端にはケルチリピートが含まれています。各ケルチリピートは長さ 44~55アミノ酸の配列で、通常は 4~7 個のリピートのクラスターで発生します。
各ケルチリピートは、βプロペラフォールドの「ブレード」を形成し、中心軸の周りに放射状に配置された4本鎖の反平行βシート 二次構造で構成され、疎水性接触を介して隣接するリピートに詰め込まれています。
ケルチリピート β プロペラは、他のタンパク質、特に細胞の アクチンフィラメントとさまざまな結合相互作用を起こします。
関数
Kelch 様タンパク質は、Cullin 3ユビキチンリガーゼの基質アダプターとして機能することが知られています。
生物
最初のケルチタンパク質(この科の名前の由来)は、ショウジョウバエから単離されました。このショウジョウバエでは、ケルチ変異体の雌が不妊のカップ型の卵を産みます。[1]ケルチという言葉はドイツ語で「杯、カップ」を意味します。ケルチタンパク質は、他の多くの動物、植物、細菌、真菌、さらにはウイルス(ポックスウイルス科に限定)からも単離されています。
ケルチモチーフを含むヒトタンパク質
ATRN ; ATRNL1; CCIN; ENC1 ; FBXO42;ガン; HCFC1 ; HCFC2; IPP; IVNS1ABP ; KBTBD10 ; KBTBD11; KBTBD2; KBTBD3; KBTBD4; KBTBD5; KBTBD6; KBTBD7 ; KBTBD8; KEAP1 ; KIAA1900; KLHDC1; KLHDC2; KLHDC3 ; KLHDC4; KLHDC5; KLHDC6; KLHDC7A; KLHDC7B; KLHDC8A; KLHDC8B; KLHDC9; KLHDC10; KLHL1 ; KLHL10; KLHL11; KLHL12 ; KLHL13; KLHL14; KLHL15; KLHL17; KLHL18 ; KLHL2 ; KLHL20 ; KLHL21; KLHL22; KLHL23; KLHL24; KLHL25 ; KLHL26 ; KLHL28 ; KLHL29 ; KLHL3; KLHL30; KLHL31; KLHL32 ; KLHL34; KLHL4; KLHL40; KLHL5; KLHL6; KLHL7 ; KLHL8 ; KLHL9 ; LZTR1 ; MEGF8 ; MKLN1 ; RABEPK ; サルコシン;
参考文献
- ^ ショウジョウバエの卵形成の遺伝子解析によるアクチン結合タンパク質の機能の理解、Andrew M. Hudson および Lynn Cooley 著、Annual Review of Genetics、Vol. 36: 455–488 (巻発行日 2002 年 12 月)、2013 年 12 月 12 日取得
- Lo SC、Li X、Henzl MT 、 Beamer LJ、 Hannink M (2006 年 8 月)。「Keap1:Nrf2 インターフェースの構造は、Nrf2 シグナル伝達のメカニズムに関する洞察を提供します」。EMBOジャーナル 。25 ( 15 ): 3605–17。doi :10.1038/ sj.emboj.7601243。PMC 1538563。PMID 16888629。
- Zollman S、Godt D、Privé GG、Couderc JL、Laski FA (1994 年 10 月)。「BTB ドメインは、主にジンクフィンガータンパク質に見られ、ショウジョウバエにおけるいくつかの発達的に調節された遺伝子を含む進化的に保存されたファミリーを定義します」。米国科学アカデミー紀要。91 ( 22): 10717– 21。Bibcode : 1994PNAS ...9110717Z。doi : 10.1073/ pnas.91.22.10717。PMC 45093。PMID 7938017 。
- Adams J、Kelso R、Cooley L (2000 年 1 月)。「ケルチリピートスーパーファミリータンパク質: 細胞機能の推進力」。Trends in Cell Biology。10 ( 1): 17– 24。doi : 10.1016/S0962-8924(99)01673-6。PMID 10603472 。
