ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
IF20 について 識別子 エイリアス IFT20 、鞭毛内輸送20 外部ID オミム ：614394; MGI : 1915585; ホモロジーン : 49559; ジーンカード ：IFT20; OMA :IFT20 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 11番染色体（マウス） [2] バンド 11|11 B5 始める 78,427,187 bp [2] 終わり 78,432,563 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 膵臓の体 脛骨 耳下腺 下垂体 小脳半球 小脳の右半球 下垂体前葉 気管支上皮細胞 小腸粘膜 歯周繊維
トップの表現 涙腺 リップ 網膜の神経層 精母細胞 胚盤胞 卵黄嚢 受精卵 右腎臓 上前頭回 回腸上皮
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能 細胞成分
シスゴルジ体ネットワーク ゴルジ膜 中心小体 樹状突起末端 毛様体基部 毛様体基底小体 運動繊毛 細胞質 光受容体接続繊毛 細胞骨格 細胞投影 繊毛先端 光受容体外節 中心体 ステレオシリウム 微絨毛 繊毛内輸送粒子B ゴルジ体 運動繊毛基底小体 繊毛 生物学的プロセス
スムーズなシグナル伝達経路 細胞投影組織 神経新生 神経前駆細胞の増殖 光受容細胞の外節組織 心筋細胞の分化 腎臓の発達 ゴルジ体へのタンパク質の局在 オプシン輸送 標準的なWntシグナル伝達経路の調節 視覚的な学習 オートファゴソームの組み立ての制御 繊毛形成の調節 平面極性の確立 内耳受容細胞不動毛組織 繊毛へのタンパク質の局在 中心体の局在 蝸牛の発達 繊毛内輸送 繊毛の組み立てに関与する繊毛内輸送 繊毛アセンブリ タンパク質の細胞膜への局在 精子形成 血小板由来成長因子受容体αシグナル伝達経路の調節 細胞分化 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_174887 NM_001267774 NM_001267775 NM_001267776 NM_001267777 NM_001267778
RefSeq (タンパク質) NP_001254703 NP_001254704 NP_001254705 NP_001254706 NP_001254707 NP_777547
場所 (UCSC) 17章: 28.33 – 28.34 Mb 11 章: 78.43 – 78.43 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
鞭毛内輸送タンパク質20ホモログ は、 ヒトでは IFT20 遺伝子によってコードされる タンパク質 である。 [5] この遺伝子は6つのエクソンで構成され、ヒト染色体17p11.1に位置する。この遺伝子はヒトの脳、肺、腎臓、膵臓で発現しており、ヒトの胎盤、肝臓、胸腺、前立腺、精巣でも低い発現が検出されている。 [6]
分子モーターとIFT粒子タンパク質が関与する鞭毛内輸送（IFT）は、細胞や胚の遊泳を駆動する運動繊毛、脊椎動物の胚で左右非対称性を生み出す節状繊毛、一部の動物で感覚刺激を感知する感覚繊毛など、多くの繊毛/鞭毛の組み立てと維持に非常に重要です。 [6] 粒子のIFT20サブユニットは、これまでのすべてのIFT粒子タンパク質が見つかっていた基底小体と繊毛に加えて、 ゴルジ体 にも局在しています。生細胞では、蛍光標識されたIFT20は非常に動的であり、ゴルジ体と繊毛の間、および繊毛微小管に沿って移動します。 [7] IFT20は精巣で SPEF2 と相互作用することが示されており 、精子の運動に役割を果たしています。 [8]
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000109083 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000001105 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「Entrez Gene: IFT20 鞭毛内輸送 20 ホモログ (クラミドモナス)」. ^ ab Yin G, Dai J, Ji C, Ni X, Shu G, Ye X, Dai J, Wu Q, Gu S, Xie Y, Zhao RC, Mao Y (2003 年 12 月). 「ヒト IFT20 遺伝子のクローニングと特性評価」. Mol. Biol. Rep . 30 (4): 255–60. doi :10.1023/A:1026365124176. PMID 14672413. S2CID 11836051. ^ Follit JA、Tuft RA、Fogarty KE、Pazour GJ (2006)。「鞭毛内輸送タンパク質IFT20はゴルジ体と関連し、繊毛の組み立てに必要である」。Mol . Biol. Cell . 17 (9): 3781–92. doi :10.1091/mbc.E06-02-0133. PMC 1593158. PMID 16775004 。 ^ Sironen, Anu; Hanse, J.; Thomsen, B.; Andersson, M.; Vilkki, J.; Toppari, J.; Kotaja, N (2010). 「マウス精子形成中の SPEF2 の発現と相互作用タンパク質としての IFT20 の同定」. 生殖生物学 . 82 (3): 580–590. doi : 10.1095/biolreprod.108.074971 . PMID 19889948.
さらに読む
Andersson B、Wentland MA、Ricafrente JY、他 (1996)。「改良されたショットガンライブラリ構築のための「ダブルアダプター」法」。Anal . Biochem . 236 (1): 107–13. doi :10.1006/abio.1996.0138. PMID 8619474。 Yu W、Andersson B、Worley KC、et al. (1997)。「大規模連結cDNAシークエンシング」。Genome Res . 7 (4): 353–8. doi :10.1101/gr.7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174 。 Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932 。 Baker SA、Freeman K、Luby-Phelps K、他 (2003)。「IFT20 は、運動性鞭毛と感覚繊毛に保存されている哺乳類の鞭毛内輸送複合体とキネシン II を結び付ける」。J . Biol. Chem . 278 (36): 34211–8. doi : 10.1074/jbc.M300156200 . PMID 12821668。 Jurczyk A、Gromley A、Redick S、et al. (2004)。「ペリセントリンは鞭毛内輸送タンパク質およびポリシスチン-2と複合体を形成し、一次繊毛の組み立てに必要である」。J . Cell Biol . 166 (5): 637–43. doi :10.1083/jcb.200405023. PMC 2172416. PMID 15337773 。 Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。 Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。 Rual JF、Venkatesan K、Hao T、他 (2005)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。Nature . 437 ( 7062 ) : 1173–8。Bibcode :2005Natur.437.1173R。doi : 10.1038 /nature04209。PMID 16189514。S2CID 4427026。
