遺伝子交換 塩分濃度が高い自然環境にあるハロアーキアHalorubrum の集団は、組換えによって遺伝情報を頻繁に交換した。 [ 2 ] この集団は、有性生殖集団に近い程度の連鎖平衡を示した。
種 Halorubrum ejinorenseは、中国 内モンゴル のエジノール湖から初めて分離された。[ 3 ]
Halorubrum lacusprofundi は 、1980 年代に南極の ディープ湖 から初めて分離されました。[ 4 ] 2008 年に配列決定された そのゲノムは 、 2 つの染色体 (1 つは 2.74 Mb 、もう 0.53 Mb) と 1 つのプラスミド (0.43 Mb) から構成されています。[ 5 ] そのβ-ガラクトシダーゼ 酵素は 、低温高塩分環境でタンパク質がどのように機能するかを理解するために広く研究されています。[ 6 ] [ 7 ] H. lacusprofundi の 1 つの株は、小胞に包まれたウイルス様粒子を使用するメカニズムを介して行われる水平遺伝子伝達 のためのプラスミドを含んでいます。 [ 8 ]
Halorubrum sodomense は1980 年に 死海 で初めて発見されました。関連する好塩菌 よりも高い濃度のMg 2+ イオンを成長に必要とします。[ 9 ] その細胞表面膜には、 太陽光 からエネルギーを収集してATP 合成に使用されるプロトン駆動力を作り出す光受容体タンパク質であるアーケロドプシン-3 (AR3) が含まれています。[ 10 ] [ 11 ] AR3 の変異体は、神経科学研究のための光遺伝学 のツールとして広く使用されています。[ 12 ]
Halorubrum tibetenseは 、中国チベットのザブイェ湖 から初めて分離された。 [ 13 ]
Halorubrum xinjiangenseは 、中国新疆ウイグル自治区の小二楽湖 から初めて分離された。 [ 14 ]
提案された種 いくつかの種と新しい二名法名が提案されたが、正式に発表されていない。
「Halorubrum africanae 」Kharroub et al. 2007b および「Halorubrum constantinense 」Kharroub et al. 2007b は アルジェリア で分離され、2007年 と 2005 年に新種として提案されました [ 16 ] 。 「Halorubrum alimentarium 」Nam et al. 2008 nom. nud. および「Halorubrum koreense 」Nam et al. 2008 nom. nud. は、 2008 年の出版物に掲載された未記載の株B43 およびB6 の提案名である。 [ 17 ] 「Halorubrum halotolerans 」Sabet et al. 2009は 、 2009年にバハ・カリフォルニア の太陽塩田から分離された未記載の株に提案された名前である。[ 18 ] Halorubrum hochstenium は、2014年にデータベースに提供された未記載の株ATCC 700873 の全ゲノムの提案名である。[ 19 ] [ 20 ] 「Halorubrum jeotgali 」Roh et al. 2007bは 、韓国の伝統的な海産物のサンプルから分離され、2007年に新種として提案されました。[ 21 ] 同じ出版物でHalorubrum cibariumが提案されました。これは H. cibi という名前で再び提案され、2009年に承認されました。 「Halorubrum kribbense 」Nkamga、Henrissat & Drancourt 2017 および「Halorubrum norisence 」Nkamga、Henrissat & Drancourt 2017 は、 2017 年の出版物で言及されている、ヒト腸内マイクロバイオームから分離された株の提案名です。[ 22 ] H. miltondacostae Albuquerque et al. 2025年 「Halorubrum salipaludis 」Gong et al. 2021 は2021年に初めて発表されました。[ 23 ] 「ハロルブルム・サルソリス 」 ハロルブルム・サルサメンティ 塩水から分離され、2017年に新種として提案された。[ 24 ] 「Halorubrum sfaxense 」Trigui et al. 2011年は チュニジア で分離され、2017年に新種として提案された[ 25 ] 「ハロルブルム・トロピカーレ 」プエルトリコ で分離され、2016年に新種として提案された。[ 26 ]
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さらに読む
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外部リンク Bac Diveの Halorubrum - 細菌多様性メタデータベース