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| ハデサルカエア | |
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| 科学的分類 | |
| ドメイン： | |
| 王国： | |
| 門: | ハデス古生物学者 マクゴニグル他 2019
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| クラス： | ハデサルカエア ベイカーら 2016
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| 注文： | ハデスアルカエア目
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| 家族： | ハデスアルカエ科
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| 属 | |
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| 同義語 | |
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ハデサルカエアは、以前は南アフリカ金鉱山雑多ユーリアーカエアグループと呼ばれていた好熱性微生物の一種で、深部鉱山、温泉、海洋堆積物、その他の地下環境で発見されています。[1] [2] [3] [4] [5]
命名法
これらの古細菌は、発見された場所にちなんで、当初は南アフリカ金鉱雑多古細菌群（SAGMEG）と呼ばれていました。[6] [7]ハデサルカエアという名前は、ギリシャ神話の冥界の神にちなんで、2016年にベイカーらによって提案されました。[1]
系統発生
これまで、ハデサルカエア（またはSAGMEG）は、生命の樹における独特の系統学的位置を通じてのみ存在が知られていました。2016年、科学者はメタゲノム ショットガンシーケンシングを使用して、これらの古細菌のほぼ完全なゲノムをいくつか組み立てることができました。[1]ハデサルカエアのゲノムは約1.5メガベースペアのサイズであることが示され、[1]これはほとんどの古細菌よりも約0.5 Mbp小さいです。[8]これらの古細菌は実験室でうまく培養されていませんが、その代謝特性はゲノム再構築から推測されています。[1]ハデサルカエアは、他のメタン生成生物との遺伝的類似性に基づいて、メタン生成祖先から進化した可能性があります。[9]
分類
- 「ハダルチャエオタ」Chuvochina et al. 2019 [「Hadesarchaeota」マクゴニグルら。 2019年; 「スティジア」アダムら。 2017 ] [10] [11] [12] [13]
- 「ペルセフォナーキア」コルリグ。ムウィリシアら。 2016 (MSBL-1)
- 「ハダルチャイア」Chuvochina et al. 2019 [「Hadesarchaea」Baker et al. 2016年』（SAGMEG）
- 「ハダルカイール目」Chuvochina et al. 2019年
- 「ハダルケ科」Chuvochina et al. 2019年
- 「Candidatus Hadarchaeum」Chuvochina et al. 2019年
- 「Ca. H. yellowstoneense」チュヴォチナ他 2019
- 「Candidatus Hadesarchaeum」Hua et al. 2019年
- 「Ca. H. tengchongensis」Hua et al. 2019年
- 「Candidatus Methanourarchaeum」Hua et al. 2019年
- 「Ca.M.サーモテルリカム」Hua et al. 2019年
- 「Candidatus Hadarchaeum」Chuvochina et al. 2019年
- 「ハダルケ科」Chuvochina et al. 2019年
- 「ハダルカイール目」Chuvochina et al. 2019年
生息地と代謝
これらの微生物は、南アフリカの金鉱山の深さ約3km（2マイル）で最初に発見されました[6] 。そこでは酸素や光がなくても生息できます。[8] [14] [15]その後、ノースカロライナ州のホワイトオーク川河口やイエローストーン国立公園のLower Culex Basinでも発見されました。 [16]これらの地域は、約70°C（158°F）で、非常にアルカリ性です。[16]系統発生マーカー遺伝子調査に基づくと、Hadesarchaeotaはドイツの東ハルツ地方の古代の鉱山地域の土壌に存在する可能性があります。[17]
この微生物は他の海洋環境でも発見されている。これらの地域には、南シナ海の冷水湧出帯が含まれる。ハデサルカエアはこの地域の古細菌群集の支配的メンバーであることが判明している。これらの冷水湧出帯にはガスハイドレートを含む堆積物があり、その中で微生物が生物地球化学的循環において主要な役割を果たしている。この環境において、ハデサルカエアは二酸化炭素と水の反応に関与していると考えられている。 [18]ハデサルカエアは、カリフォルニア湾周辺のグアイマス盆地とソノラ縁辺部の海底下生息地でも発見されている。[19]
ハデサルカエアは、海洋堆積物、鉱山、温泉に存在するほか、特定の魚種の腸内微生物叢にも確認されている。インド、アッサム、ビハール、西ベンガル原産の淡水フグ（テトラオドン・カットクティア）の腸内微生物叢にはハデサルカエアが存在することがわかった。淡水フグの古細菌群集の中で、ハデサルカエアは2番目に豊富であることがわかった。これは、肉食性のサケや草食性のソウギョの腸内で見られる群集の豊富さと似ていることがわかった。ハデサルカエアはこれらの環境で非常に豊富に存在することがわかったが、これらの魚の健康や栄養段階にどのような影響を与えるかは完全にはわかっていない。[20]
ハデサルカエアは、一酸化炭素と水を二酸化炭素と酸素に変換し、副産物として水素を生成するという点で、既知の古細菌の中でもユニークです。メタゲノムアセンブルゲノム（MAG）データによると、ハデサルカエアはウッド・リュングダール炭素固定経路、メタン生成、アルカン代謝に関連する遺伝子を持っています。[21] [22]ハデサルカエアのゲノムには、従属栄養生活で糖とアミノ酸を代謝し、亜硝酸塩をアンモニウムに還元する遺伝子も含まれていると報告されています。[1] [3]初期の研究では、これらの生物が重要な地球化学プロセスにも関与していることが示唆されています。[1]
ハデサルカエアのゲノムは比較的小さいため、栄養制限の結果としてゲノムの合理化が進んだと考えられています。 [1]
参照
参考文献
- ^ abcdefgh Baker, Brett J.; Saw, Jimmy H.; Lind, Anders E.; Lazar, Cassandra Sara; Hinrichs, Kai-Uwe; Teske, Andreas P.; Ettema, Thijs JG (2016年2月16日). 「コスモポリタンな地下古細菌、Hadesarchaeaの代謝に関するゲノム推論」Nature Microbiology . 1 (3): 16002. doi : 10.1038/nmicrobiol.2016.2 . PMID 27572167.
- ^ Parkes, R. John; Webster, Gordon; Cragg, Barry A.; Weightman, Andrew J.; Newberry, Carole J.; Ferdelman, Timothy G.; Kallmeyer, Jens; Jørgensen, Bo B.; Aiello, Ivano W.; Fry, John C. (2007 年 7 月)。「地質学的時間にわたって界面で刺激を受けた深海底下の原核生物」(PDF)。Nature。436 ( 7049 ) : 390–394。doi : 10.1038 / nature03796。ISSN 0028-0836。PMID 16034418。S2CID 4390333 。
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