ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
ＨＮＲＮＰＨ１ 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス HNRNPH1 、HNRPH、HNRPH1、hnRNPH、異種核リボ核タンパク質 H1 (H)、異種核リボ核タンパク質 H1 外部ID オミム ：601035; MGI : 1891925; ホモロジーン : 31318; ジーンカード ：HNRNPH1; OMA :HNRNPH1 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 11番染色体（マウス） [2] バンド 11|11 B1.3 始める 50,376,990 bp [2] 終わり 50,386,528 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 甲状腺の右葉 甲状腺の左葉 右子宮管 左卵巣 右卵巣 アキレス腱 膵臓の体 右肺 神経節隆起 心室帯
トップの表現 胎児の尾 上頸部神経節 手 腹壁 下顎突出 上顎突出 性器結節 原始的な線 生殖腺隆起 真皮
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
核酸結合 タンパク質結合 RNA結合 ポリ(U)RNA結合 細胞成分
触媒ステップ 2 スプライソソーム スプライソソーム複合体 膜 核質 細胞質 核 生物学的プロセス
スプライソソームを介したmRNAスプライシング RNAスプライシングの調節 mRNA処理 RNA処理 RNAスプライシング 線維芽細胞増殖因子受容体シグナル伝達経路 RNA代謝プロセス 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001257293 NM_005520 NM_001363572
RefSeq (タンパク質) NP_001244222 NP_005511 NP_001350501 NP_001351154 NP_001351155 NP_001351156 NP_001351157 NP_001351158 NP_001351159 NP_001351160 NP_001351161 NP_001351162 NP_001351163 NP_001351164 NP_001351165 NP_001351166 NP_001351167 NP_001351168 NP_001351169 NP_001351170 NP_001351171 NP_001351172 NP_001351173 NP_001351174 NP_001351175 NP_001351176 NP_001351177 NP_001351179 NP_001351180 NP_001351181 NP_001351182 NP_001351183 NP_001351184
NP_001334416 NP_067485 NP_001349451 NP_001349452 NP_001349453 NP_001349454 NP_001349455 NP_001349456 NP_001349457 NP_001349458 NP_001349459 NP_001349461 NP_001349462 NP_001349463
場所 (UCSC) 5 章: 179.61 – 179.63 Mb 11 章: 50.38 – 50.39 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
異種核リボ核タンパク質Hは タンパク質 [5] であり 、ヒトでは HNRNPH1 遺伝子 によってコードされている。 [6] [7]
この遺伝子は、普遍的に発現する異種核リボ核タンパク質 (hnRNP) のサブファミリーに属します。hnRNP は RNA 結合タンパク質であり、異種核 RNA (hnRNA) と複合体を形成します。これらのタンパク質は核内の pre-mRNA と関連しており、pre-mRNA の処理や mRNA 代謝および輸送の他の側面に影響を与えるようです。hnRNP はすべて核内に存在しますが、一部は核と細胞質の間を行き来しているようです。hnRNP タンパク質は、明確な核酸結合特性を持っています。この遺伝子によってコードされるタンパク質には、RNA に結合する準 RRM ドメインの 3 つの繰り返しがあります。これは、ファミリー メンバーの HNRPF と非常によく似ています。この遺伝子は、遺伝性リンパ浮腫 I 型表現型に潜在的に関与していると考えられています。 [7]
参考文献
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さらに読む
Rasmussen HH、van Damme J、 Puype M、他 (1993)。「正常なヒト表皮角化細胞の 2 次元ゲルタンパク質データベースに記録された 145 個のタンパク質のマイクロシーケンス」。 電気 泳動 。13 ( 12) : 960–9。doi :10.1002/elps.11501301199。PMID 1286667。S2CID 41855774。 Dawson SJ、White LA (1992)。「シプロフロキサシンによるヘモフィルス・アフロフィルス心内膜炎の治療」。J . Infect . 24 (3): 317–20. doi :10.1016/S0163-4453(05)80037-4. PMID 1602151。 Matunis MJ、Xing J、Dreyfuss G (1994)。「hnRNP Fタンパク質：ユニークな一次構造、核酸結合特性、および細胞内局在」。Nucleic Acids Res . 22 (6): 1059–67. doi :10.1093/nar/22.6.1059. PMC 307930 . PMID 7512260。 Gamberi C, Izaurralde E, Beisel C, Mattaj IW (1997). 「ヒト核キャップ結合タンパク質複合体とhnRNP Fとの相互作用」 Mol. Cell. Biol . 17 (5): 2587–97. doi :10.1128/MCB.17.5.2587. PMC 232108. PMID 9111328 . Chou MY、Rooke N、Turck CW、Black DL (1999)。「hnRNP H は、神経細胞で c-src 代替エクソンを活性化するスプライシングエンハンサー複合体の構成要素である」。Mol . Cell. Biol . 19 (1): 69–77. doi :10.1128/MCB.19.1.69. PMC 83866. PMID 9858532 。 Evans AL、Brice G、Sotirova V、et al. (1999)。「原発性先天性リンパ浮腫の5q35.3領域へのマッピング」。Am . J. Hum. Genet . 64 (2): 547–55. doi :10.1086/302248. PMC 1377764. PMID 9973292 。 Honoré B, Vorum H, Baandrup U (1999). 「hnRNPs H、H'、F は翻訳後切断と細胞内局在に関して異なる挙動を示す」. FEBS Lett . 456 (2): 274–80. doi : 10.1016/S0014-5793(99)00911-4 . PMID 10456323. S2CID 7617501. Markovtsov V、Nikolic JM、Goldman JA、他 (2000)。「ポリピリミジントラクト結合タンパク質の組織特異的ホモログによって誘導されるhnRNP複合体の協調的アセンブリ」。Mol . Cell. Biol . 20 (20): 7463–79. doi :10.1128/MCB.20.20.7463-7479.2000. PMC 86300. PMID 11003644 。 Andersen JS、Lyon CE、Fox AH 、et al. (2002)。「ヒト核小体の指向性プロテオーム解析」。Curr . Biol . 12 ( 1 ) : 1–11。Bibcode :2002CBio...12....1A。doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9。PMID 11790298。S2CID 14132033。 Jurica MS、Licklider LJ、Gygi SR 、 et al. (2002)。「3次元構造解析に適したネイティブスプライソソームの精製と特性評価」 。RNA。8 ( 4 ) : 426–39。doi : 10.1017 /S1355838202021088。PMC 1370266。PMID 11991638 。 Angenstein F、Evans AM、Settlage RE、他 (2002)。「活性化 C キナーゼの受容体は、ニューロン内のポリ A-mRNA と関連するメッセンジャーリボ核タンパク質複合体の一部である」。J . Neurosci . 22 (20): 8827–37. doi :10.1523/JNEUROSCI.22-20-08827.2002. PMC 6757688. PMID 12388589 。 Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932 。 Li J、Hawkins IC、Harvey CD、et al. (2003)。「SRrp86 とその相互作用タンパク質による選択的スプライシングの調節」。Mol . Cell. Biol . 23 (21): 7437–47. doi :10.1128/MCB.23.21.7437-7447.2003. PMC 207616. PMID 14559993 。 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。 Honoré B、Baandrup U、Vorum H (2004)。「異種核リボ核タンパク質 F および H/H' は、正常組織および特定の癌組織で異なる発現を示す」。Exp . Cell Res . 294 (1): 199–209. doi :10.1016/j.yexcr.2003.11.011. PMID 14980514。 Brill LM、Salomon AR、Ficarro SB、他 (2004)。「固定化金属アフィニティークロマトグラフィーとタンデム質量分析法を用いたヒトT細胞からのチロシンリン酸化部位の堅牢なホスホプロテオームプロファイリング」。Anal . Chem . 76 (10): 2763–72. doi :10.1021/ac035352d. PMID 15144186。 Beausoleil SA、Jedrychowski M、 Schwartz D、他 (2004)。「HeLa 細胞核リン酸化タンパク質の大規模特性評価」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 101 ( 33 ) : 12130–5。Bibcode :2004PNAS..10112130B。doi : 10.1073/ pnas.0404720101。PMC 514446。PMID 15302935 。 Jin J、Smith FD、Stark C、他 (2004)。「細胞骨格調節と細胞組織化に関与する生体内 14-3-3 結合タンパク質のプロテオーム、機能、およびドメインベースの分析」。Curr . Biol . 14 ( 16 ) : 1436–50。Bibcode :2004CBio...14.1436J。CiteSeerX 10.1.1.323.5263。doi : 10.1016 /j.cub.2004.07.051。PMID 15324660。S2CID 2371325 。 Lin KT、Lu RM、Tarn WY (2004)。「WW ドメイン含有タンパク質は初期スプライソソームと相互作用し、生体内での pre-mRNA スプライシングに関与する」。Mol . Cell. Biol . 24 (20): 9176–85. doi :10.1128/MCB.24.20.9176-9185.2004. PMC 517884. PMID 15456888 .
