ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| HLA-DPB1 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | ヒト UniProt 検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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3LQZ、4P4K、4P4R、4P57、4P5K、4P5M |
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| 識別子 |
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| エイリアス | HLA-DPB1、DPB1、HLA-DP、HLA-DP1B、HLA-DPB、主要組織適合遺伝子複合体、クラス II、DP ベータ 1 |
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| 外部ID | オミム: 142858;ホモロジーン: 129927;遺伝子カード: HLA-DPB1; OMA :HLA-DPB1 - オルソログ |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 顆粒球
- リンパ節
- 付録
- 単球
- 胆嚢
- 脾臓
- 左肺の上葉
- 右肺
- 十二指腸
- 右冠動脈
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| | | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 |
- 膜の不可欠な構成要素
- エンドサイトーシス小胞膜
- クラスリン被覆エンドサイトーシス小胞膜
- エンドソーム
- ゴルジ体
- トランスゴルジネットワーク膜
- 小胞体膜
- 膜
- ゴルジ膜
- 細胞膜
- 輸送小胞膜
- MHCクラスIIタンパク質複合体
- 細胞表面
- リソソーム膜
- 小胞体
- ERからゴルジ体への輸送小胞膜
- リソソーム
- 小胞体膜の内腔側の不可欠な成分
- エンドソーム膜
| | 生物学的プロセス |
- 抗原処理と提示
- MHCクラスIIを介した抗原処理と外因性ペプチド抗原の提示
- インターフェロン-γを介したシグナル伝達経路
- 免疫システムのプロセス
- T細胞共刺激
- インターフェロン-γ産生の正の調節
- MHCクラスIIを介したペプチドまたは多糖抗原の抗原処理および提示
- T細胞活性化の正の調節
- T細胞増殖の正の調節
- 免疫反応
- T細胞受容体シグナル伝達経路
- 適応免疫反応
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | ENSG00000236693 ENSG00000230708 ENSG00000229295 ENSG00000226826 ENSG00000215048
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ENSG00000223865 ENSG00000230763 ENSG00000237710 |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | | |
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| RefSeq (タンパク質) | | |
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| 場所 (UCSC) | 6 章: 33.08 – 33.09 Mb | 該当なし |
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| PubMed検索 | [2] | 該当なし |
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| ウィキデータ |
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HLAクラスII組織適合抗原DP(W2)ベータ鎖は、ヒトではHLA-DPB1遺伝子によってコードされるタンパク質です。
HLA-DPB は、HLA クラス II ベータ鎖パラログに属します。このクラス II 分子は、膜に固定されたアルファ鎖 (DPA) とベータ鎖 (DPB) からなるヘテロ二量体です。細胞外タンパク質由来のペプチドを提示することで、免疫システムで中心的な役割を果たします。クラス II 分子は、抗原提示細胞 (APC: B リンパ球、樹状細胞、マクロファージ) で発現します。ベータ鎖は約 26~28 kDa で、その遺伝子には 6 つのエクソンが含まれています。エクソン 1 はリーダー ペプチドをコードし、エクソン 2 と 3 は 2 つの細胞外ドメインをコードし、エクソン 4 は膜貫通ドメインをコードし、エクソン 5 は細胞質テールをコードします。DP 分子内では、アルファ鎖とベータ鎖の両方にペプチド結合特異性を指定する多型が含まれており、最大 4 つの異なる分子が生成されます。[3]
参照
参考文献
- ^ abc ENSG00000230708、ENSG00000229295、ENSG00000226826、ENSG00000215048、ENSG00000223865、ENSG00000230763、ENSG00000237710 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000236693、ENSG00000230708、ENSG00000229295、ENSG00000226826、ENSG00000215048、ENSG00000223865、ENSG00000230763、ENSG00000237710 –アンサンブル、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「Entrez Gene: HLA-DPB1 主要組織適合遺伝子複合体、クラス II、DP ベータ 1」。
さらに読む
- 光永 S、桑田 S、徳永 K、内川 C、高橋 K、赤座 T、三富 Y、十次 T (1992)。 「HLA-DPB1 多型に関する家族研究: HLA-DR/DQ および 2 つの「新しい」対立遺伝子との連鎖分析」。ハム。イムノール。34 (3): 203-11。土井:10.1016/0198-8859(92)90113-2。PMID 1358867。
- Marsh SG、Bodmer JG (1993)。「HLAクラスIIヌクレオチド配列、1992」。組織抗原。40 (5): 229–43。doi : 10.1111/ j.1399-0039.1992.tb02050.x。PMID 1362295 。
- Eiermann TH、Uhl S、Fakler J、 Goldmann SF (1992)。「新しいHLA-DPB1配列、DPB1*2301」。組織抗原。40 (2): 108–10。doi : 10.1111 /j.1399-0039.1992.tb01969.x。PMID 1412416 。
- Korioth F、Hartung K、Deicher H 、 Frey J (1992)。「全身性エリテマトーデス患者からの新しい HLA-DPB1 対立遺伝子」。組織抗原。39 (4): 216–9。doi :10.1111/ j.1399-0039.1992.tb01938.x。PMID 1529429 。
- デ・コスター HS、ケンター MJ、ダマロ J、ルイテン RM、シュロイジャース WE、ギファート MJ、テルミテレン A (1991)。 「オリゴヌクレオチドのタイピングと HLA-DP 分子の T 細胞認識との間の正の相関」。免疫遺伝学。34 (1): 12-22。土井:10.1007/BF00212307。PMID 1713190。S2CID 21845822 。
- Vanderbeeken YE、Duchateau J、Colle H、Gregoire M、Desseilles P、Lucas A (1991)。「臍帯血細胞と非血縁リンパ球における母体血清による分子レベルでの HLA クラス II 抗原の調節」。Arch . Gynecol. Obstet . 248 (4): 199–209. doi :10.1007/BF02390359. PMID 1832848. S2CID 25184115.
- Piatier-Tonneau D、Gastinel LN、Amblard F、Wojcik M、Vaigot P、Auffray C (1991)。「CD4とHLAクラスII抗原およびHIV gp120との相互作用」。免疫 遺伝学。34 ( 2): 121–8。doi :10.1007/BF00211424。PMID 1869305。S2CID 10116507 。
- Rosenstein Y、Burakoff SJ、Herrmann SH (1990)。「HIV-gp120はCD4クラスII MHC媒介接着を阻害できる」。J . Immunol . 144 (2): 526–31. doi : 10.4049/jimmunol.144.2.526 . PMID 1967269。
- Bowman MR、MacFerrin KD、Schreiber SL、Burakoff SJ (1991)。「ヒト免疫不全ウイルスエンベロープ糖タンパク質gp120およびクラスII主要組織適合性複合体分子との相互作用に関与するCD4のV1領域における残基の同定および構造分析」。Proc . Natl . Acad. Sci. USA。87 ( 22 ): 9052–6。doi : 10.1073 / pnas.87.22.9052。PMC 55099。PMID 1978941。
- Bugawan TL、Begovich AB、Erlich HA (1990)。「酵素増幅DNAと非放射性配列特異的オリゴヌクレオチドプローブを使用した迅速なHLA-DPBタイピング」。免疫遺伝学。32 (4): 231–41。doi : 10.1007 / BF00187094。PMID 2242906。S2CID 39873046 。
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- Begovich AB、Bugawan TL、Nepom BS、Klitz W、Nepom GT、Erlich HA (1990)。「特定の HLA-DP ベータアレルは、少関節型の若年性関節リウマチと関連しているが、成人型関節リウマチとは関連していない」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 86 (23): 9489–93. doi : 10.1073/pnas.86.23.9489 . PMC 298522 . PMID 2512583。
- Scholl P, Diez A, Mourad W, Parsonnet J, Geha RS, Chatila T (1989). 「毒素性ショック症候群毒素1は主要組織適合性複合体クラスII分子に結合する」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 86 (11): 4210–4. Bibcode :1989PNAS...86.4210S. doi : 10.1073/pnas.86.11.4210 . PMC 287420 . PMID 2542966.
- Clayton LK、Sieh M、Pious DA、Reinherz EL (1989)。「クラス II MHC と HIV-1 gp120 の結合に影響を与えるヒト CD4 残基の同定」。Nature . 339 ( 6225 ) : 548–51。Bibcode :1989Natur.339..548C。doi : 10.1038/ 339548a0。PMID 2543930。S2CID 4246781 。
- Lee JS、Sartoris S、Briata P、Choi E、Cullen C、Lepaslier D、Unis I (1989)。 「HLA-DP ベータ鎖の配列多型」。免疫遺伝学。29 (5): 346–9。土井:10.1007/BF00352845。PMID 2714855。S2CID 13414587 。
- Compagnone-Post P、Turco E、Robinson C、Trucco M (1988)。「異なるハプロタイプのDP4分子のベータ鎖は同じ遺伝子によってコード化されている」。Genomics . 2 ( 1): 8–13. doi :10.1016/0888-7543(88)90103-6. PMID 2838415。
- Diamond DC、Sleckman BP、Gregory T、Lasky LA、Greenstein JL、Burakoff SJ (1988)。「HIVエンベロープタンパク質gp120によるCD4+ T細胞機能の阻害」。J . Immunol . 141 (11): 3715–7. doi : 10.4049/jimmunol.141.11.3715 . PMID 2846691。
- Ando A, Inoko H, Kimura M, Ogata S, Tsuji K (1987). 「HLA-DP重鎖および軽鎖のcDNAクローンおよびゲノムクローンの単離と対立遺伝子多型」Hum. Immunol . 17 (3): 355–67. doi :10.1016/0198-8859(86)90286-7. PMID 2878910.
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