
1960年に設立された真菌遺伝学ストックセンター(FGSC)は、遺伝学的に特徴づけられた真菌類の主要な公開リポジトリです。FGSCは世界培養コレクション連盟( WFCC)の加盟機関であり、米国培養コレクションネットワーク研究調整ネットワーク(USCCN)における主要なコレクションの一つです。
FGSCは、 NeurosporaとAspergillusの株、およびFusarium、Magnaportheの限られた数の株、および現在の真菌ゲノムプロジェクトからの多くの株を配布しています。[ 1 ]
1980年代と1990年代に、FGSCはクローン遺伝子、クローニングベクター、遺伝子ライブラリーなどの分子材料をコレクションに追加した。
より多くの真菌ゲノムが配列決定されたため、FGSCは遺伝システムの定義を再評価しました。これにより、ゲノムプログラム[ 2 ]の株や、 Neurospora crassa、Aspergillus nidulans、Cryptococcus neoformans、Candida albicansなどの生物の変異株コレクションを含む追加材料を含むコレクションが拡大されました。
遺伝子リポジトリとして、FGSCは常に利用可能な遺伝物質の多様性を代表するよう努めてきました。そのため、少数の異なる種の多数の株を保有しています。具体的には、23属76種の株を保有しています。これらのうち、19種については10株以上を保有しています。これらの株は310人の個人によって寄贈され、そのうち64人は1株のみを寄贈しています。FGSCはまた、デイビッド・パーキンス博士の野生型株コレクションや、退職した他の研究者からのニューロスポラ株など、登録されていない株も多数保有しています。これらは、保管スペースがある限り保管するという了解のもとで保管されています。キュレーションは行われておらず、現状のまま利用可能です。その他の株コレクションには、歴史的なタトゥム研究室コレクションからのアロミセス(PDF)、アスペルギルス・ニガー、ウスティラゴ・マディス、ニューロスポラ株が含まれます。
1998年1月から2018年12月までの期間に、FGSCは、約5,000種類の個別変異株と20,000種類以上の遺伝子欠失変異株を含む、63万種類以上の培養株を96ウェルプレート形式で配布しました。1987年にFGSCデータベースが構築されて以来、FGSCは65万種類以上の菌株を配布しています。
FGSCは1960年に米国国立科学財団からの助成金を受けてダートマス大学に設立されました。R・バラット博士が初代所長を務めました。FGSCはその後3回移転し、ハンボルト州立大学、カンザス大学医療センター、ミズーリ大学カンザスシティ校を経て、2014年からはカンザス州立大学に拠点を置いています。KUメディカルセンターでは、J.キンジー博士が所長を務め、アミノ酸代謝の遺伝学に取り組み、後にコートジボワールのアディオポドゥメ産のNeurospora crassa株からトランスポゾン「Tad」を同定した。 [ 3 ] UMKCでは、細胞骨格ダイナミクスに取り組んでいたマイケル・プラマン博士が所長を務めた。[ 4 ] 2014年以降、カンザス州立大学植物病理学科のジョン・レスリー博士が所長を務めている。
FGSC は設立以来 3 人の学芸員を擁してきました。初代学芸員はウィリアム (ビル) オガタで、1981 年に退職するまで務めました。後任はハンボルトのクレイグ ウィルソンでした。ウィルソン氏はコレクションと共にカンザスシティに移り、1995 年にケビン マクラスキー博士が学芸員に就任しました。1995 年以降、FGSC の所蔵株数は 8,000 株から 25,000 株以上に増加しました。[ 5 ]同様に、培養コレクションのベスト プラクティス ガイドが利用可能になり、FGSC の業務に組み込まれました。[ 6 ]
長年にわたり、FGSCは米国国立科学財団の生体家畜収集プログラムによって支援されてきました。[ 7 ] 2015年からは、FGSCはカンザス州立大学農学部と顧客から支払われる料金 によって支援されています。
FGSCの主な目標の一つは、糸状菌(カビ)を用いた研究をより身近なものにすることです。そのため、FGSCのウェブサイトには、NeurosporaとAspergillusに関する詳細なプロトコル[ 8 ]が掲載されています。その他の材料やサービスは、個々のケースに応じて提供されます。
FGSCにおける研究活動のほとんどは、所蔵資料の価値を高めることを目的としています。具体的なプロジェクトとしては、菌株の改良、未知のマーカーの同定、多重マーカー株の作製などが挙げられます。最近の研究では、これまで未解明であったアカパンカビの温度感受性変異の特性解析や、米国エネルギー省JGIとの共同研究による、これまで未解明であった古典的な変異体の特性解析などが行われています。
FGSCはNeurospora Functional Genomicsプログラムの一部であり[ 9 ]、2006年から2014年の間に全ゲノム欠失セットを構成する13,000を超える遺伝子欠失変異体を登録した。