線維性細菌

線維性細菌
科学的分類
ドメイン：	細菌
クレード:	FCBグループ
門:	線維性細菌 Garrity & Holt 2021 [1]
クラス
キチニスピリリア キチニビブリオニア 線維性細菌
同義語
「線維性バクテリア」オーレン他 2015 「フィブロバクテリア」ギャリティとホルト 2001 「線維性細菌叢」ホイットマン他 2018 「レイモンドバクテリア」アナンタラマンら。 2016年

線維性細菌門は、反芻動物の植物由来セルロースの分解を可能にする、主要なルーメン細菌の多くを含む小さな細菌 門です。この門のメンバーは他の門に分類されていました。線維性細菌門の唯一の属である線維性バクテリア属は、1988年にバクテロイデス属から除外されました。^[2]

線維性細菌門は現在、別個の門として認識されているが、RpoCおよびジャイレースBタンパク質配列に基づく系統発生研究は、線維性細菌門がバクテロイデス門およびクロロビ門の種と近縁であることを示している。^[3]これら3つの門の種はまた、多くの重要なタンパク質における保存されたシグネチャインデルに基づいて、同じ位置で分岐している。^[4]最後に、そして最も重要なこととして、比較ゲノム研究により、これら3つの門のすべての種に独自に共有される2つの保存されたシグネチャインデル（RpoCタンパク質の5〜7アミノ酸挿入およびセリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼの13〜16アミノ酸挿入）と1つのシグネチャタンパク質（PG00081）が特定されている。^[5]これらの結果はすべて、これら3つの門の種が他のすべての細菌を除いて共通の祖先を共有していたことを示す説得力のある証拠を提供し、それらすべてを単一の「FCB」上門の一部として認識すべきであると提案されています。^{[3] [5]}

線維性細菌の系統発生。

現在受け入れられている分類法は、原核生物の命名法リスト（LSPN）^[12]と国立生物工学情報センター（NCBI） ^[13]に基づいています。

• キチニスピリリア 綱Sorokin et al. 2016
  • キチニスピリラ 目Sorokin et al. 2016 ]
    • キチニスピリラ 科Sorokin et al. 2016
      • キチニスピリルム 属Sorokin et al. 2016
        • 種C. アルカリフィラム Sorokin et al. 2016
• キチニビブリオ ニア綱Sorokin et al. 2014
  • キチニビブリオ ノラ目Sorokin et al. 2014
    • キチニビブリオ 科Sorokin et al. 2014
      • キチニビブリオ 属Sorokin et al. 2014
        • 種C. アルカリフィルス Sorokin et al. 2014
• 線維性細菌クラス スペイン他 2012
  • 線維性細菌目 Spain et al. 2012 ["線維性細菌目" Abdul Rahman et al. 2016 ]
    • Fibrobacteraceae科 Spain et al. 2012 [Fibromonadaceae" Abdul Rahman et al. 2016 ]
      • フィブロバクター 属Montgomery et al. 1988
        • 種F. intestinalis Montgomery et al. 1988
        • 種F. succinogenes (Hungate 1950) Montgomery et al. 1988
          • 亜種F. s. elongatus Montgomery et al. 1988
          • 亜種F. s. succinogenes (Hungate 1950) Montgomery et al. 1988
      • 属「Candidatus Fibromonas」Abdul Rahman et al. 2016年
        • 種「Ca.F. termitidis」Abdul Rahman et al. 2016年
      • 「ハレレラ」属Wylensek et al. 2020年
        • 種「H. porci」Wylensek et al. 2021年
        • 種「H. succinigenes」Wylensek et al. 2020

線維性細菌門は、CFB [細胞ファガ-フラビバクテリウム-バクテロイドータ] と近縁であると考えられています。^[5]この門には、牛や豚を含む多くの哺乳類の腸内に株が存在する線維性細菌属が含まれます。 ^[14]この属に記載されている2つの種、すなわち線維性細菌サクシノゲネスと線維性細菌インテスティナリスは、哺乳類の腸内の線維分解コミュニティの重要なメンバーであり、植物繊維を分解できる微生物に対する長年の関心により、ここ数十年で多くの注目を集めています。

様々な環境からの16rRNA遺伝子の増幅に基づく分子的証拠は、この門がこれまで考えられていたよりもはるかに広範囲に広がっていることを示唆している。^{[15] [16]}哺乳類環境からのクローンのほとんどは、既知の分離株とともに亜門1と呼ばれるグループに分類されている。 ^[16]しかし、亜門2のメンバーは、これまでのところシロアリの腸内でのみ発見されている。^{[16] [17]}および一部の落ち葉を食べるゴキブリでも発見されている。^{[18]木材を食べる}Nasutitermes cornigerの後腸のセルロース分解繊維関連細菌群集で亜門2が優勢であることは、高等シロアリの植物質分解において亜門2が重要な役割を果たしていることを示唆している。^[19]

• フィブロバクター・サクシノゲネス
• 候補門TG3
• 細菌目一覧
• 細菌属の一覧

• Holt JG 編 (1994)。Bergeyの決定細菌学マニュアル(第 9 版)。Williams & Wilkins。ISBN 978-0-683-00603-2。

• 命名法上の原核生物名一覧- フィブロバクター属
• Systema Naturae 2000 分類: 線維性細菌門 2006-03-14ウェイバックマシンにアーカイブ