40Sリボソームタンパク質S30のヒト遺伝子
オーストラリア 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2L7R、%%s4UG0、4V6X、5A2Q、5AJ0、5FLX
識別子 エイリアス FAU 、FAU1、Fub1、Fubi、MNSFbeta、S30、asr1、フィンケル・ビスキス・ライリーマウス肉腫ウイルス（FBR-MuSV）普遍的に発現、ユビキチン様タンパク質とリボソームタンパク質S30融合、FAUユビキチン様タンパク質とリボソームタンパク質S30融合、RPS30 外部ID オミム : 134690; MGI : 102547; ホモロジーン : 37562; ジーンカード ：FAU; OMA :FAU - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 19番染色体（マウス） [2] バンド 19 A|19 4.34 cM 始める 6,107,874 bp [2] 終わり 6,109,554 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 顆粒球 子宮頸管 左卵巣 単球 扁桃体 右子宮管 脛骨動脈 S状結腸の筋層 骨髄細胞 右卵巣
参照表現データの詳細
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能 細胞成分
細胞成分 細胞質 リボソーム 細胞内解剖構造 細胞質小リボソームサブユニット 小さなリボソームサブユニット 核質 細胞外空間 生物学的プロセス
生物学的プロセス ウイルス転写 SRP依存性共翻訳タンパク質の膜への標的化 粘膜における自然免疫反応 翻訳開始 核転写されたmRNAの分解過程、ナンセンス変異による分解 タンパク質生合成 rRNA処理 抗菌ペプチドを介した抗菌性体液性免疫応答 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001160239 NM_001190436 NM_007990
RefSeq (タンパク質) NP_001153711 NP_001177365 NP_032016
場所 (UCSC) 11 章: 65.12 – 65.12 Mb 19章: 6.11 – 6.11 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
40Sリボソームタンパク質S30は、ヒトでは FAU 遺伝子 によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6]
関数 この遺伝子は、フィンケル・ビスキス・ライリーマウス肉腫ウイルス (FBR-MuSV) の fox 配列の細胞相同遺伝子である。これは、 N 末端の ユビキチン 様タンパク質 FUBIと C 末端 のリボソームタンパク質 S30からなる融合タンパク質をコードする 。この融合タンパク質は翻訳後処理されて、遊離 fubi と遊離リボソームタンパク質 S30 を生成すると提案されている。Fubi はユビキチンファミリーのメンバーであり、リボソームタンパク質 S30 はリボソームタンパク質の S30E ファミリーに属する。fubi の機能は現在不明であるが、リボソームタンパク質 S30 は細胞質リボソームの 40S サブユニットの構成要素である。この遺伝子から派生した偽遺伝子がゲノムに存在する。リボソームタンパク質S30と同様に、リボソームタンパク質 S27a と L40 はユビキチンとの融合タンパク質として合成される。 [6]
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000149806 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000038274 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ Kas K、Schoenmakers E、van de Ven W、Weber G、Nordenskjold M、Michiels L、Merregaert J、Larsson C (1993 年 10 月)。 「染色体 11q13 のサブ領域へのヒト FAU 遺伝子の割り当て」。 ゲノミクス 。 17 (2): 387–92。 土井 ：10.1006/geno.1993.1337。 PMID 8406491。 ^ ab 「Entrez Gene: FAU フィンケル・ビスキス・ライリー マウス肉腫ウイルス (FBR-MuSV) 普遍的に発現 (キツネ由来); リボソームタンパク質 S30」。
さらに読む
Wool IG、Chan YL、Glück A (1996)。「哺乳類リボソームタンパク質の構造と進化」。Biochem . Cell Biol . 73 (11–12): 933–47. doi :10.1139/o95-101. PMID 8722009。 Kas K、Michiels L、Merregaert J (1992)。「ヒトfau遺伝子のゲノム構造と発現：ユビキチン様タンパク質に融合したリボソームタンパク質S30をコードする」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 187 (2): 927–33. doi :10.1016/0006-291X(92)91286-Y. PMID 1326960。 Kato S, Sekine S, Oh SW, et al. (1995). 「ヒト完全長cDNAバンクの構築」. Gene . 150 (2): 243–50. doi :10.1016/0378-1119(94)90433-2. PMID 7821789. Michaels L、Van der Rauwelaert E、Van Hasselt F、他。 （1993年）。 「fau cDNA はユビキチン様 S30 融合タンパク質をコードしており、Finkel-Biskis-Reilly マウス肉腫ウイルスではアンチセンス配列として発現されます。」 がん遺伝子 。 8 (9): 2537–46。 PMID 8395683。 Vladimirov SN、Ivanov AV、Karpova GG、他 (1996)。「N末端および内部配列決定、および質量分析によるヒト小リボソームサブユニットタンパク質の特性評価」。Eur . J. Biochem . 239 (1): 144–9. doi : 10.1111/j.1432-1033.1996.0144u.x . PMID 8706699。 Kenmochi N, Kawaguchi T, Rozen S, et al. (1998). 「75 個のヒトリボソームタンパク質遺伝子のマップ」 Genome Res . 8 (5): 509–23. doi : 10.1101/gr.8.5.509 . PMID 9582194. Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932 。 ロスマン TG、ヴィサリ MA、コミサロワ EV (2003)。 「fau とそのユビキチン様ドメイン (FUBI) は、ヒト骨形成肉腫 (HOS) 細胞を足場非依存性に変換します。」 がん遺伝子 。 22 (12): 1817–21。 土井 ：10.1038/sj.onc.1206283。 PMID 12660817。S2CID 21256130 。 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。 Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M, et al. (2004). 「ヒトとマウスの遺伝子の配列比較によりプロモーター領域に相同ブロック構造が発見される」 Genome Res . 14 (9): 1711–8. doi :10.1101/gr.2435604. PMC 515316. PMID 15342556 . Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。 Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。 Mourtada - Maarabouni M、Kirkham L、Farzaneh F、Williams GT (2005)。「機能的発現クローニングとアンチセンス発現により明らかになった fau によるアポトーシスの調節」。Oncogene . 23 (58): 9419–26. doi :10.1038/sj.onc.1208048. PMID 15543234. S2CID 38364471. Andersen JS 、Lam YW、Leung AK 、他 (2005)。「核小体プロテオームダイナミクス」。Nature . 433 ( 7021 ): 77–83。Bibcode :2005Natur.433...77A。doi : 10.1038/nature03207。PMID 15635413。S2CID 4344740。 Yu Y, Ji H, Doudna JA, Leary JA (2005). 「ヒト 40S リボソームサブユニットの質量分析: ネイティブおよび HCV IRES 結合複合体」. Protein Sci . 14 (6): 1438–46. doi :10.1110/ps.041293005. PMC 2253395. PMID 15883184 .
