ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| EIF5 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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2E9H、2G2K、2IU1 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | EIF5、EIF-5、EIF-5A、真核生物翻訳開始因子5、真核生物開始因子5 |
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| 外部ID | オミム:601710; MGI : 95309;ホモロジーン: 49610;ジーンカード:EIF5; OMA :EIF5 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 12番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 12 F1|12 61.03 cM | 始める | 111,504,450 bp [2] |
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| 終わり | 111,513,186 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 中心後回
- ポンス
- 精子
- 外淡蒼球
- 視床の外側核群
- 上前頭回
- 緻密部
- 下オリーブ核
- 上前庭核
- 卵母細胞
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| | トップの表現 | - 耳板
- 髄質集合管
- 腎小体
- 球形嚢
- 耳小胞
- 血
- 人間の胎児
- 涙腺
- 胎児の尾
- 精母細胞
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- 翻訳開始因子活性
- ヌクレオチド結合
- 翻訳因子活性、RNA結合
- GTP結合
- GTPase活性
- タンパク質結合
- 真核生物開始因子 eIF2 結合
- RNA結合
- カドヘリン結合
- GDP解離阻害活性
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- 翻訳開始の制御
- タンパク質生合成
- GTPase活性の活性化
- 翻訳開始前複合体の形成
- 翻訳開始
- 細胞質翻訳開始複合体の形成
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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真核生物翻訳開始因子5は、ヒトではEIF5遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
EIF5はGTPase活性化タンパク質である。[7]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000100664 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000021282 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Si K、Das K、Maitra U (1996年8月)。「哺乳類翻訳開始因子5 (eIF-5)をコードする複数のmRNAの特性評価」。J Biol Chem . 271 (28): 16934–8. doi : 10.1074/jbc.271.28.16934 . PMID 8663286。
- ^ 「Entrez Gene: EIF5 真核生物翻訳開始因子 5」。
- ^ Das S、Ghosh R、Maitra U (2001 年 3 月)。「真核生物翻訳開始因子 5 は GTPase 活性化タンパク質として機能する」。J . Biol. Chem . 276 (9): 6720–6. doi : 10.1074/jbc.M008863200 . PMID 11092890。
外部リンク
- Nature Reviews Microbiology の Cap 依存性翻訳開始。開始因子の機能に関する優れた画像と概要
- PDBe-KBは、ヒト真核生物翻訳開始因子5(EIF5)のPDBで利用可能なすべての構造情報の概要を提供します。
さらに読む
- Das S、Maiti T、Das K、Maitra U (1998)。「真核生物翻訳開始因子5(eIF5)とeIF2のベータサブユニットとの特異的相互作用」。J . Biol. Chem . 272 (50): 31712–8. doi : 10.1074/jbc.272.50.31712 . PMID 9395514。
- Bandyopadhyay A、Maitra U (1999)。「哺乳類翻訳開始因子3(eIF3)のp42サブユニットのクローニングと特性評価:eIF3が哺乳類細胞でeIF5と相互作用することの実証」。Nucleic Acids Res . 27 (5): 1331–7. doi :10.1093/nar/27.5.1331. PMC 148320 . PMID 9973622。
- Das S, Maitra U (2000). 「哺乳類翻訳開始因子 5 (eIF5) の変異解析: eIF2 のベータサブユニットと eIF5 の相互作用が in vitro および in vivo での eIF5 機能に果たす役割」. Mol. Cell. Biol . 20 (11): 3942–50. doi :10.1128/MCB.20.11.3942-3950.2000. PMC 85746. PMID 10805737 .
- Choi SK、Olsen DS、Roll-Mecak A、et al. (2000)。「原核生物翻訳開始因子 IF1 および IF2 の真核生物オーソログ間の物理的および機能的相互作用」。Mol . Cell. Biol . 20 (19): 7183–91. doi :10.1128/MCB.20.19.7183-7191.2000. PMC 86272. PMID 10982835 。
- Das S、Ghosh R、Maitra U (2001)。「真核生物翻訳開始因子5はGTPase活性化タンパク質として機能する」。J . Biol. Chem . 276 (9): 6720–6. doi : 10.1074/jbc.M008863200 . PMID 11092890。
- Wiemann S、Weil B、Wellenreuther R、他 (2001)。「ヒト遺伝子およびタンパク質のカタログに向けて:ヒトcDNAをコードする500個の新規完全タンパク質の配列決定および分析」。Genome Res . 11 (3): 422–35. doi :10.1101/gr.GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166 。
- Asano K, Shalev A, Phan L, et al. (2001). 「翻訳開始複合体の組み立てと GTPase 活性化における eIF5 の C 末端ドメインの複数の役割」EMBO J. 20 ( 9): 2326–37. doi :10.1093/emboj/20.9.2326. PMC 125443. PMID 11331597 .
- Majumdar R、Bandyopadhyay A、Deng H、Maitra U (2002)。「in vitro および in vivo での哺乳類翻訳開始因子 5 (eIF5) のリン酸化」。Nucleic Acids Res . 30 (5): 1154–62. doi :10.1093/nar/30.5.1154. PMC 101238 . PMID 11861906。
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- Marintchev A、Kolupaeva VG、Pestova TV、Wagner G (2003)。「ヒト真核生物開始因子 1A と 5B 間の結合界面のマッピング: 古いパートナー間の新しい相互作用」。Proc . Natl . Acad. Sci. USA . 100 (4): 1535–40。Bibcode :2003PNAS..100.1535M。doi : 10.1073/pnas.0437845100 . PMC 149867 . PMID 12569173。
- 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
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- Homma MK, Wada I, Suzuki T, et al. (2005). 「真核生物翻訳開始因子5のCK2リン酸化は細胞周期の進行を促進する」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 102 (43): 15688–93. Bibcode :2005PNAS..10215688H. doi : 10.1073/pnas.0506791102 . PMC 1266118 . PMID 16227438.
- Conte MR、Kelly G、Babon J、et al. (2006)。「真核生物の開始因子 (eIF) 5 の構造は、いくつかの翻訳因子に共通する折り畳み構造を明らかにする」。生化学。45 ( 14 ): 4550–8。doi :10.1021/bi052387u。PMID 16584190 。
- Bieniossek C, Schütz P, Bumann M, et al. (2006). 「ヒト翻訳開始因子 eIF5 のカルボキシ末端ドメインの結晶構造」J. Mol. Biol . 360 (2): 457–65. doi :10.1016/j.jmb.2006.05.021. PMID 16781736.
- Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、et al. (2006)。「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」。Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983。