人間の体内に存在するタンパク質
| COL9A3 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | COL9A3、DJ885L7.4.1、EDM3、IDD、MED、コラーゲンタイプIXアルファ3、コラーゲンタイプIXアルファ3鎖 |
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| 外部ID | オミム:120270; MGI : 894686;ホモロジーン: 20438;ジーンカード:COL9A3; OMA :COL9A3 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体2(マウス)[2] |
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| | バンド | 2 H4|2 103.14 cM | 始める | 180,239,583 bp [2] |
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| 終わり | 180,263,982 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 脛骨
- 軟骨組織
- 迷走神経下神経節
- C1セグメント
- 三叉神経節
- 脛骨神経
- 腓骨神経
- 内淡蒼球
- 被殻
- 視床下核
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| | トップの表現 | - 窩
- 前庭感覚上皮
- 顆頭
- 第四脳室脈絡叢
- 脈絡叢上皮
- 球形嚢
- 後頭部
- 後頭骨
- つま先
- 網膜色素上皮
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- 引張強度を与える細胞外マトリックス構造成分
- 細胞外マトリックス構造成分
| | 細胞成分 |
- コラーゲンタイプIXトリマー
- 細胞外領域
- コラーゲン
- 小胞体腔
- 細胞外空間
- 細胞外マトリックス
- コラーゲン含有細胞外マトリックス
| | 生物学的プロセス |
- 男性の生殖腺の発達
- 細胞外マトリックスの組織化
- 女性の生殖腺の発達
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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コラーゲンα-3(IX)鎖は、ヒトではCOL9A3遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]
関数
この遺伝子は、軟骨の主要なコラーゲン成分であるIX型コラーゲンの3つのアルファ鎖のうちの1つをコードしています。ヘテロ三量体分子であるIX型コラーゲンは、通常、線維性コラーゲンであるII型コラーゲンを含む組織に見られます。この遺伝子の変異は、多発性骨端線異形成症に関連しています。[7]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000092758 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000027570 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Brewton RG、Wood BM、Ren ZX、Gong Y、Tiller GE、Warman ML、Lee B、Horton WA、Olsen BR、Baker JR、他 (1996 年 3 月)。「ヒト IX 型コラーゲンのアルファ 3 鎖の分子クローニング: COL9A3 遺伝子と染色体 20q13.3 の結合」。Genomics。30 ( 2 ) : 329–36。doi :10.1006/geno.1995.9870。PMID 8586434 。
- ^ Wu JJ、Woods PE、Eyre DR(1992年12月)。「ウシ軟骨のIX型コラーゲンの架橋部位の同定により、II型とIX型の分子関係が反平行であること、およびIX型とIX型の結合が明らかになった」。J Biol Chem . 267(32):23007–14。doi :10.1016 /S0021-9258(18)50048- X。PMID 1429648 。
- ^ ab 「Entrez Gene: COL9A3 コラーゲン、タイプ IX、アルファ 3」。
外部リンク
- GeneReviews/NCBI/NIH/UW の多発性骨端線異形成症、優性遺伝に関するエントリ
さらに読む
- Fahrig T、Landa C、Pesheva P、et al. (1988)。「ミエリン関連糖タンパク質の細胞外マトリックス成分への結合特性の特性」。EMBO J. 6 (10): 2875–83. doi :10.1002/j.1460-2075.1987.tb02590.x . PMC 553721. PMID 2446864 。
- McCormick D, van der Rest M, Goodship J, et al. (1987). 「IX 型コラーゲンプロテオグリカンのグリコサミノグリカンドメインの構造」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 84 (12): 4044–8. Bibcode :1987PNAS...84.4044M. doi : 10.1073/pnas.84.12.4044 . PMC 305018 . PMID 3473493.
- Richardson GP、Russell IJ、Duance VC、Bailey AJ (1987)。「哺乳類の蓋膜のポリペプチド組成」。Hear . Res . 25 (1): 45–60. doi :10.1016/0378-5955(87)90078-5. PMID 3542919. S2CID 42559806.
- Perälä M、Savontaus M、Metsäranta M、Vuorio E (1997)。「マウス胚発生中のII型、IX型、XI型コラーゲンのmRNA種の発達調節」。Biochem . J. 324. ( Pt 1) (Pt 1): 209–16. doi :10.1042/bj3240209. PMC 1218418. PMID 9164858 .
- Paassilta P、Lohiniva J、Annunen S、et al. (2000)。「COL9A3: 多発性骨端異形成の第3遺伝子座」。Am . J. Hum. Genet . 64 (4): 1036–44. doi :10.1086/302328. PMC 1377827. PMID 10090888 .
- Paassilta P、Pihlajamaa T、Annunen S、et al. (1999)。「23キロベースのヒトCOL9A3遺伝子の完全な配列。中立変異体を表すGly-XYトリプレット欠失の検出」。J . Biol. Chem . 274 (32) : 22469–75。doi : 10.1074/ jbc.274.32.22469。PMID 10428822。
- Bönnemann CG、Cox GF、Shapiro F、他 (2000)。「IX 型コラーゲンのアルファ 3 鎖の変異により、軽度のミオパシーを伴う常染色体優性多発性骨端線異形成症が発症する」。Proc . Natl . Acad. Sci. USA . 97 (3): 1212–7。Bibcode : 2000PNAS ...97.1212B。doi : 10.1073/pnas.97.3.1212。PMC 15572。PMID 10655510。
- Lohiniva J、Paassilta P、Seppänen U、et al. (2000)。「コラーゲンIXのCOL3ドメインのスプライシング変異は多発性骨端異形成症を引き起こす」。Am . J. Med. Genet . 90 (3): 216–22. doi :10.1002/(SICI)1096-8628(20000131)90:3<216::AID-AJMG6>3.0.CO;2-1. PMID 10678658。
- Paassilta P、Lohiniva J、 Göring HH、et al. (2001)。「腰椎椎間板疾患の新たな共通遺伝的危険因子の特定」。JAMA。285 ( 14 ) : 1843–9。doi : 10.1001 /jama.285.14.1843。PMID 11308397。
- Czarny-Ratajczak M、Lohiniva J、Rogala P、et al. (2001)。「COL9A1 の変異は多発性骨端異形成症を引き起こす: 遺伝子座異質性のさらなる証拠」。Am . J. Hum. Genet . 69 (5): 969–80. doi :10.1086/324023. PMC 1274373. PMID 11565064 。
- Fertala A、Sieron AL、Aomori E 、Jimenez SA (2002)。「Arg-alpha1-519 の Cys 置換を含むコラーゲン II: 変異分子とコラーゲン IX の異常な相互作用」。生化学。40 (48): 14422–8。doi :10.1021/bi0109109。PMID 11724554 。
- Deloukas P、Matthews LH 、 Ashurst J、他 (2002)。「ヒト染色体20のDNA配列と比較分析」。Nature 414 ( 6866 ): 865–71。Bibcode :2001Natur.414..865D。doi : 10.1038 /414865a。PMID 11780052。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Matsui Y, Wu JJ, Weis MA, et al. (2004). 「ヒト軟骨の発達における、トリプトファン含有 IX 型コラーゲンの対立遺伝子変異体のマトリックス沈着」。Matrix Biol . 22 (2): 123–9. doi :10.1016/S0945-053X(02)00102-6. PMID 12782139。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- 浅村 健、阿部 誠、福岡 秀、他 (2005)。「難聴患者における蝸牛で高発現する遺伝子 COL9A3 の変異解析」。Auris Nasus Larynx。32 ( 2 ): 113–7。doi :10.1016/ j.anl.2005.01.011。PMID 15917166 。
- Rual JF、Venkatesan K、Hao T、他 (2005)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。Nature . 437 ( 7062 ) : 1173–8。Bibcode :2005Natur.437.1173R。doi : 10.1038 /nature04209。PMID 16189514。S2CID 4427026。