ヒトに見られる哺乳類タンパク質
| COL4A6 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | COL4A6、CXDELq22.3、DELXq22.3、DFNX6、コラーゲンIV型アルファ6、コラーゲンIV型アルファ6鎖 |
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| 外部ID | オミム:303631; MGI : 2152695;ホモロジーン:48050;ジーンカード:COL4A6; OMA :COL4A6 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | X染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | X|X F1- F2 | 始める | 139,948,399 bp [2] |
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| 終わり | 140,257,072 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 胃粘膜
- 心室帯
- 精嚢
- 尿道
- 膀胱
- 子宮体部
- 左子宮管
- 膀胱粘膜
- 精巣上体の尾
- 脱落膜
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| | トップの表現 | - レンズ
- 子宮
- 膀胱
- 中腎
- 顔面骨格
- 脳頭蓋
- スケルトン
- 膜状骨
- 皮膚頭蓋
- 下顎
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- 細胞外マトリックス構造成分
- 引張強度を与える細胞外マトリックス構造成分
| | 細胞成分 |
- コラーゲンIV型三量体
- 小胞体腔
- 基底膜
- コラーゲン
- 細胞外領域
- 細胞外空間
- 細胞外マトリックス
- コラーゲン含有細胞外マトリックス
| | 生物学的プロセス |
- 細胞接着
- 細胞外マトリックスの組織化
- コラーゲン活性化チロシンキナーゼ受容体シグナル伝達経路
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001287758 NM_001287759 NM_001287760 NM_001847 NM_033641 |
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| RefSeq (タンパク質) | NP_001274687 NP_001274688 NP_001274689 NP_001838 NP_378667
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NP_001274688.1 |
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| 場所 (UCSC) | 染色体X: 108.16 – 108.44 Mb | クロノスX: 139.95 – 140.26 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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コラーゲンα-6(IV)鎖は、ヒトではCOL4A6遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
この遺伝子は、基底膜の主要構成成分である IV 型コラーゲンの 6 つのサブユニットのうちの 1 つをコードしています。IV 型コラーゲン遺伝子ファミリーの他のメンバーと同様に、この遺伝子は別の IV 型コラーゲン遺伝子であるアルファ 5 IV 型コラーゲンと頭対頭構造で構成されていることから、遺伝子ペアは共通のプロモーターを共有しています。アルファ 5 遺伝子の欠失がアルファ 6 遺伝子にまで及ぶと、アルファ 5 遺伝子の欠失によって引き起こされるX 連鎖アルポート症候群を伴うびまん性平滑筋腫症が発生します。この遺伝子には 2 つのスプライス バリアントが特定されています。[6]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000197565 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000031273 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Zhou J, Mochizuki T, Smeets H, Antignac C, Laurila P, de Paepe A, Tryggvason K, Reeders ST (1993年9月). 「遺伝性平滑筋腫瘍におけるα5(IV)およびα6(IV)コラーゲン遺伝子のペアの欠失」. Science . 261 (5125): 1167–9. Bibcode :1993Sci...261.1167Z. doi :10.1126/science.8356449. PMID 8356449.
- ^ ab 「Entrez Gene: COL4A6 コラーゲン、タイプ IV、アルファ 6」。
さらに読む
- Ständer M、Naumann U、Wick W 、 Weller M (1999)。「トランスフォーミング成長因子ベータとp-21:デコリンを介した腫瘍増殖抑制の複数の分子標的」。Cell Tissue Res。296 ( 2 ) : 221–7。doi :10.1007/s004410051283。PMID 10382266。S2CID 20282995。
- Kurpakus Wheater M、 Kernacki KA、Hazlett LD (1999)。「角膜細胞タンパク質と眼表面病理」。バイオテクニック&組織化学。74 (3): 146–59。doi : 10.3109 /10520299909047967。PMID 10416788 。
- Ghebrehiwet B、Peerschke EI、Hong Y、他 (1992)。「C1q 受容体 (C1q-R) 由来の短いアミノ酸配列は、フィブロネクチンおよびビトロネクチン受容体のアルファ鎖および IV 型コラーゲンと相同性を示す」。J . Leukoc. Biol . 51 (6): 546–56. doi :10.1002/jlb.51.6.546. PMID 1377218. S2CID 1214598。
- Gupta S、Batchu RB、Datta K (1992)。「ラット腎臓ヒアルロン酸結合タンパク質の精製、部分的特性評価および細胞表面での局在」。Eur . J. Cell Biol . 56 (1): 58–67。PMID 1724753 。
- Hernandez MR、Igoe F、Neufeld AH (1986)。「ヒト視神経乳頭の細胞外マトリックス」。Am . J. Ophthalmol . 102 (2): 139–48. doi :10.1016/0002-9394(86)90134-0. PMID 2426947。
- Glant TT、Hadházy C、Mikecz K、 Sipos A (1985)。「軟骨におけるフィブロネクチンの出現と持続。フィブロネクチンと コラーゲンII型との特異的相互作用」。組織化学。82 (2): 149–58。doi : 10.1007/bf00708199。PMID 3997552。S2CID 19401258。
- Matsubara T, Trüeb B, Fehr K, et al. (1984). 「ヒト IV 型コラーゲンに対するモノクローナル抗体を用いた免疫組織化学による滑膜毛細血管における IV 型コラーゲンの局在と分泌」. Exp. Cell Biol . 52 (3): 159–69. doi :10.1159/000163256. PMID 6386565.
- Uscanga L、Kennedy RH、 Stocker S、他 (1984)。「正常なヒト膵臓におけるコラーゲンタイプ、ラミニン、フィブロネクチンの免疫局在」。消化。30 ( 3): 158–64。doi :10.1159/000199100。PMID 6389236 。
- Sundarraj N, Willson J (1982). 「ヒト基底膜コラーゲンIV型に対するモノクローナル抗体」免疫学. 47 (1): 133–40. PMC 1555500. PMID 6811420 .
- Hahn E、Wick G、Pencev D、Timpl R (1980)。「正常および線維性ヒト肝臓における基底膜タンパク質の分布:IV型コラーゲン、ラミニン、フィブロネクチン」。Gut . 21 ( 1): 63–71. doi :10.1136/gut.21.1.63. PMC 1419572. PMID 6988303 。
- Sasaki T, Göhring W, Pan TC, et al. (1996). 「マウスおよびヒト fibulin-2 の細胞外マトリックスリガンドへの結合」J. Mol. Biol . 254 (5): 892–9. doi :10.1006/jmbi.1995.0664. PMID 7500359.
- 大橋 剛、植木 勇、杉本 正、二宮 勇 (1995)。「ヒトα6(IV)コラーゲン鎖をコードするCOL4A6遺伝子の単離と構造、および他のIV型コラーゲン遺伝子との比較」。J . Biol. Chem . 270 (45): 26863–7. doi : 10.1074/jbc.270.45.26863 . PMID 7592929。
- Sugimoto M, Oohashi T, Ninomiya Y (1994). 「基底膜コラーゲン鎖α5(IV)およびα6(IV)をコードする遺伝子COL4A5およびCOL4A6は、ヒト染色体Xq22上に近接して並んで位置し、COL4A6は2つの代替プロモーターから転写される」。Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 91 (24): 11679–83. Bibcode :1994PNAS...9111679S. doi : 10.1073/pnas.91.24.11679 . PMC 45295 . PMID 7972123.
- Donovan FM、Vaughan PJ、Cunningham DD (1994)。「IV型コラーゲンによるプロテアーゼネキシン-1標的プロテアーゼ特異性の調節」。J . Biol. Chem . 269 (25): 17199–205. doi : 10.1016/S0021-9258(17)32540-1 . PMID 8006028。
- Oohashi T, Sugimoto M, Mattei MG, Ninomiya Y (1994). 「cDNA 単離による新しいコラーゲン IV 鎖、α 6(IV) の同定と、COL4A5 と同じ遺伝子座である染色体 Xq22 への遺伝子の割り当て」J. Biol. Chem . 269 (10): 7520–6. doi : 10.1016/S0021-9258(17)37317-9 . PMID 8125972.
- Zhou J、Ding M、Zhao Z、Reeders ST (1994)。「ヒト基底膜コラーゲン6番目の鎖、α6(IV)の完全な一次構造。α6(IV)のcDNAの単離と他の5つのIV型コラーゲン鎖との比較」。J . Biol. Chem . 269 (18): 13193–9. doi : 10.1016/S0021-9258(17)36818-7 . PMID 8175748。
- Zhang X、Zhou J、Reeders ST 、 Tryggvason K (1996)。「アルポート症候群関連平滑筋腫症で変異するヒトIV型コラーゲンCOL4A6遺伝子の構造」。ゲノミクス。33 (3): 473–9。doi : 10.1006 /geno.1996.0222。PMID 8661006 。
- Cáceres J、Brandan E (1997)。「アルツハイマー病βA4前駆体タンパク質(APP)と細胞外マトリックスとの相互作用:ヘパラン硫酸プロテオグリカンの関与の証拠」。J. Cell. Biochem . 65 (2): 145–58. doi :10.1002/(SICI)1097-4644(199705)65:2<145::AID-JCB2>3.0.CO;2-U. PMID 9136074. S2CID 43911847.
- Knott JC、Mahesparan R、Garcia-Cabrera I、et al. (1998)。「侵入する神経膠腫細胞による正常脳の細胞外マトリックス成分の刺激」。Int . J. Cancer。75 ( 6 ): 864–72。doi : 10.1002 /(SICI)1097-0215(19980316)75:6<864::AID-IJC8>3.0.CO;2- T。PMID 9506531 。