ヒトのタンパク質コード遺伝子
| COL4A5 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | COL4A5、ASLN、ATS、CA54、コラーゲンIV型アルファ5、コラーゲンIV型アルファ5鎖、ATS1 |
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| 外部ID | オミム:303630; MGI : 88456;ホモロジーン: 133559;ジーンカード:COL4A5; OMA :COL4A5 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | X染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | X F2|X 62.16 cM | 始める | 140,258,381 bp [2] |
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| 終わり | 140,472,230 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 胃粘膜
- 心室帯
- 精嚢
- 脳梁
- 子宮体部
- 尿道
- 精巣上体の尾
- 右子宮管
- 迷走神経下神経節
- 左子宮管
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| | トップの表現 | - 水晶体上皮
- 上行大動脈
- 虹彩
- 左肺葉
- 精管
- アトリウム
- 大動脈弁
- 大動脈領域の中膜
- 前庭感覚上皮
- 毛様体
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- 細胞外マトリックス構造成分
- 引張強度を与える細胞外マトリックス構造成分
| | 細胞成分 |
- 細胞外領域
- 基底膜
- 神経筋接合部
- コラーゲン
- コラーゲンIV型三量体
- 小胞体腔
- 細胞外空間
- 細胞外マトリックス
- コラーゲン含有細胞外マトリックス
| | 生物学的プロセス |
- 細胞外マトリックスの組織化
- 神経筋接合部の発達
- コラーゲン活性化チロシンキナーゼ受容体シグナル伝達経路
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_000495 NM_033380 NM_033381 |
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| RefSeq (タンパク質) | | |
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| 場所 (UCSC) | 染色体X: 108.44 – 108.7 Mb | 染色体X: 140.26 – 140.47 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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コラーゲンα-5(IV)鎖は、ヒトではCOL4A5遺伝子によってコードされるタンパク質です。
この遺伝子は、基底膜の主要構成成分であるIV型コラーゲンの6つのサブユニットのうちの1つをコードしています。この遺伝子の変異は、遺伝性腎炎としても知られるX連鎖アルポート症候群に関連しています。IV型コラーゲン遺伝子ファミリーの他のメンバーと同様に、この遺伝子は別のIV型コラーゲン遺伝子と頭対頭の構造で構成されており、各遺伝子ペアは共通のプロモーターを共有しています。この遺伝子には3つの転写バリアントが特定されています。[5]
疾患データベース
ARUP COL4A5 遺伝子変異データベース
LOVD Alport 遺伝子変異データベース (COL4A5、COL4A3、COL4A4) [永久リンク切れ ]
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000188153 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000031274 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「Entrez Gene: COL4A5 コラーゲン、タイプ IV、アルファ 5 (アルポート症候群)」。
さらに読む
- Lemmink HH、Schröder CH、Monnens LA、Smeets HJ (1997)。「IV型コラーゲン変異の臨床スペクトル」。Hum . Mutat . 9 (6): 477–99. doi :10.1002/(SICI)1098-1004(1997)9:6<477::AID-HUMU1>3.0.CO;2-#. hdl : 2066/25010 . PMID 9195222. S2CID 196601220.
- Ständer M、Naumann U、Wick W 、 Weller M (1999)。「トランスフォーミング成長因子ベータとp-21:デコリンを介した腫瘍増殖抑制の複数の分子標的」。Cell Tissue Res。296 ( 2 ) : 221–7。doi :10.1007/s004410051283。PMID 10382266。S2CID 20282995。
- Kurpakus Wheater M、 Kernacki KA、Hazlett LD (1999)。「角膜細胞タンパク質と眼表面病理」。バイオテクニック&組織化学。74 (3): 146–59。doi : 10.3109 /10520299909047967。PMID 10416788 。
- Zhou J、Hertz JM、Leinonen A、Tryggvason K (1992)。「アルポート症候群患者におけるヒトα5(IV)コラーゲン鎖の完全なアミノ酸配列と、コラーゲンドメインのグリシン521をシステインに変換するエクソン23の単一塩基変異の特定」。J . Biol. Chem . 267 (18): 12475–81. doi : 10.1016/S0021-9258(18)42301-0 . PMID 1352287。
- Renieri A、Seri M、Myers JC、et al. (1993)。「アルポート症候群におけるグリシン325をグルタミン酸に変換するCOL4A5遺伝子のde novo変異」。Hum . Mol. Genet . 1 (2): 127–9. doi :10.1093/hmg/1.2.127. PMID 1363780。
- Knebelmann B、Deschenes G、Gros F、他 (1992)。「X 連鎖アルポート症候群に関連するコラーゲン α 5 (IV) 鎖におけるグリシン 325 のアルギニン置換: PCR 増幅リンパ芽球 cDNA 断片の直接配列決定による変異の特徴付け」。Am . J. Hum. Genet . 51 (1): 135–42. PMC 1682875. PMID 1376965 。
- Ghebrehiwet B、Peerschke EI、Hong Y、他 (1992)。「C1q 受容体 (C1q-R) 由来の短いアミノ酸配列は、フィブロネクチンおよびビトロネクチン受容体のアルファ鎖および IV 型コラーゲンと相同性を示す」。J . Leukoc. Biol . 51 (6): 546–56. doi :10.1002/jlb.51.6.546. PMID 1377218. S2CID 1214598。
- Zhou J、Barker DF、 Hostikka SL、他 (1991)。「アルポート症候群において保存されたシステインをセリンに変換するアルファ5(IV)コラーゲン鎖遺伝子の単一塩基変異」。ゲノミクス。9 ( 1): 10–8。doi :10.1016/0888-7543(91)90215-Z。PMID 1672282 。
- Hostikka SL、Eddy RL、Byers MG、他 (1990)。「腎臓分布が限定された、異なる IV 型コラーゲン α 鎖の同定と、その遺伝子の X 染色体連鎖アルポート症候群の遺伝子座への割り当て」。Proc . Natl . Acad. Sci. USA . 87 ( 4): 1606–10。Bibcode : 1990PNAS ...87.1606H。doi : 10.1073/ pnas.87.4.1606。PMC 53524。PMID 1689491。
- Gupta S、Batchu RB、Datta K (1992)。「ラット腎臓ヒアルロン酸結合タンパク質の精製、部分的特性評価および細胞表面での局在」。Eur . J. Cell Biol . 56 (1): 58–67。PMID 1724753 。
- Zhou J、Hostikka SL、Chow LT 、 Tryggvason K (1991)。「アルポート症候群で影響を受けるヒトIV型コラーゲンα5遺伝子の3'半分の特性」。ゲノミクス。9 (1): 1–9。doi : 10.1016 /0888-7543(91)90214-Y。PMID 2004755 。
- Myers JC、Jones TA、Pohjolainen ER、他 (1990)。「α5(IV)コラーゲンの分子クローニングとアルポート症候群遺伝子座を含むX染色体領域への遺伝子の割り当て」。Am . J. Hum. Genet . 46 (6): 1024–33. PMC 1683837. PMID 2339699 。
- Barker DF、 Hostikka SL、Zhou J、他 (1990)。「アルポート症候群におけるCOL4A5コラーゲン遺伝子の変異の同定」。Science。248 ( 4960 ): 1224–7。Bibcode : 1990Sci ...248.1224B。doi :10.1126/science.2349482。PMID 2349482 。
- Pihlajaniemi T、Pohjolainen ER、Myers JC (1990)。「新しいIV型コラーゲン鎖、アルファ5(IV)の三重らせん領域とカルボキシル末端ドメインの完全な一次構造」。J . Biol. Chem . 265 (23): 13758–66. doi : 10.1016/S0021-9258(18)77414-0 . PMID 2380186。
- Hernandez MR、Igoe F、Neufeld AH (1986)。「ヒト視神経乳頭の細胞外マトリックス」。Am . J. Ophthalmol . 102 (2): 139–48. doi :10.1016/0002-9394(86)90134-0. PMID 2426947。
- Glant TT、Hadházy C、Mikecz K、 Sipos A (1985)。「軟骨におけるフィブロネクチンの出現と持続。フィブロネクチンと コラーゲンII型との特異的相互作用」。組織化学。82 (2): 149–58。doi : 10.1007/bf00708199。PMID 3997552。S2CID 19401258。
- Matsubara T, Trüeb B, Fehr K, et al. (1984). 「ヒト IV 型コラーゲンに対するモノクローナル抗体を用いた免疫組織化学による滑膜毛細血管における IV 型コラーゲンの局在と分泌」. Exp. Cell Biol . 52 (3): 159–69. doi :10.1159/000163256. PMID 6386565.
- Uscanga L、Kennedy RH、 Stocker S、他 (1984)。「正常なヒト膵臓におけるコラーゲンタイプ、ラミニン、フィブロネクチンの免疫局在」。消化。30 ( 3): 158–64。doi :10.1159/000199100。PMID 6389236 。
- Sundarraj N, Willson J (1982). 「ヒト基底膜コラーゲンIV型に対するモノクローナル抗体」免疫学. 47 (1): 133–40. PMC 1555500. PMID 6811420 .
- Hahn E、Wick G、Pencev D、Timpl R (1980)。「正常および線維性ヒト肝臓における基底膜タンパク質の分布:IV型コラーゲン、ラミニン、フィブロネクチン」。Gut . 21 ( 1): 63–71. doi :10.1136/gut.21.1.63. PMC 1419572. PMID 6988303 。