コラーゲン、タイプXV、アルファ1

COL15A1
利用可能な構造
ＰＤＢ	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	3N3F
識別子
エイリアス	COL15A1、コラーゲンXV型アルファ1鎖
外部ID	オミム：120325; MGI : 88449;ホモロジーン: 1396;ジーンカード：COL15A1; OMA :COL15A1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	9番染色体（ヒト）
終わり	99,070,792 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	染色体4（マウス）
終わり	47,313,167 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	ヒップの皮膚; ; 胎盤; ; 滑膜関節; ; 噴門; ; 軟骨組織; ; 右心室; ; 心膜; ; 浅側頭動脈; ; 伏在静脈; ; 右心房の心筋組織;
	トップの表現
	上行大動脈; ; 大動脈弁; ; 乳腺; ; 左心室の心筋組織; ; 坐骨神経; ; 白色脂肪組織; ; 外眼筋; ; 子宮; ; 皮下脂肪組織; ; 胸郭横隔膜;
	参照表現データの詳細
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	細胞外マトリックス構造成分; 構造分子活性; 引張強度を与える細胞外マトリックス構造成分;
細胞成分	膜の不可欠な構成要素; 基底膜; コラーゲン; 小胞体腔; 細胞外エクソソーム; コラーゲンXV型トリマー; 細胞外領域; 細胞外マトリックス; 細胞外空間; コラーゲン含有細胞外マトリックス;
生物学的プロセス	コラーゲン分解プロセス; 多細胞生物の発達; 細胞分化; 血管新生; シグナル伝達; 細胞接着; 細胞外マトリックスの組織化;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	1306
	12819
	ENSG00000204291
	ENSMUSG00000028339
	P39059
	O35206
	NM_001855
	NM_009928
	NP_001846
	NP_034058
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

コラーゲンα-1(XV)鎖は、ヒトではCOL15A1遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]

この遺伝子は、FACITコラーゲンファミリー（中断されたらせんを持つ原繊維関連コラーゲン）のメンバーであるXV型コラーゲンのアルファ鎖をコードします。XV型コラーゲンは組織に広く分布していますが、最も強い発現は基底膜領域に局在しているため、基底膜を下にある結合組織間質に接着する機能があると考えられます。マウスの研究では、コラーゲンXVの欠乏は筋肉と微小血管の劣化に関連していることが示されています。^[6]

XV型コラーゲンは腫瘍抑制因子として知られており、腫瘍細胞の環境を理解するために使用できます。XV型コラーゲンは膜にサポートと細胞の固定を提供しますが、通常は密な構造ネットワークを持っていません。^[7]

コラーゲンXVの変化は、組織において癌のような挙動を引き起こすことが知られています。コラーゲンXVが失われると膜の構造的サポートがなくなり、腫瘍細胞が基底膜に侵入し、転移を引き起こす可能性があります。コラーゲンXVの過剰発現は子宮頸癌で見られることが知られています。^[8]

将来の医療目的では、組織中のコラーゲンXVの欠乏は浸潤性腫瘍の指標となる可能性がある。^[8]

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000204291 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000028339 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ ヒュブナー K、カニッツァーロ LA、ジャブズ EW、キヴィリッコ S、マンゾーン H、ピフラジャニエミ T、マイヤーズ JC (1992 年 10 月)。「新しいタイプのコラーゲン（COL15A1）をコードする遺伝子の9q21→q22への染色体割り当て」。ゲノミクス。14 (2): 220– 4.土井: 10.1016/S0888-7543(05)80209-5。PMID 1427836。
^ ab 「Entrez Gene: COL15A1 コラーゲン、タイプ XV、アルファ 1」。
^ ブルトー、サンドリーヌ;ギヨン、エミリー。カルピネン、サンナマリア。ピフラジャニエミ、タイナ;ルッジェーロ、フィレンツェ (2020-05-01)。「コラーゲンXV、組織や種を超えて存在する多面的なマルチプレキシン」。マトリックスバイオロジープラス。6–7 : 100023.土井: 10.1016 /j.mbplus.2020.100023。ISSN 2590-0285。PMC 7852327。PMID 33543021。
^ ab Clementz AG、Harris A (2013年12月)。「コラーゲンXV：腫瘍微小環境におけるその構造と役割の探究」。分子がん研究。11 (12): 1481– 6。doi : 10.1158 / 1541-7786.MCR -12-0662。PMC 4159701。PMID 24043668。

さらに読む

Myers JC、Kivirikko S、Gordon MK、Dion AS、Pihlajaniemi T (1992 年 11 月)。「三重らせん領域での広範な中断を特徴とする、これまで知られていなかったヒトコラーゲン鎖、アルファ 1(XV) の同定」。米国科学アカデミー紀要。89 ( 21): 10144–8。Bibcode : 1992PNAS ...8910144M。doi : 10.1073 / pnas.89.21.10144。PMC 50294。PMID 1279671。
Kivirikko S、Heinämäki P、Rehn M、Honkanen N、Myers JC、Pihlajaniemi T (1994 年 2 月)。「ヒト XV 型コラーゲンのアルファ 1 鎖の一次構造と、対応する遺伝子の 3' 領域におけるエクソン-イントロン構成」。The Journal of Biological Chemistry。269 ( 7 ): 4773–9。doi : 10.1016/S0021-9258(17)37611-1。PMID 8106446 。
Muragaki Y, Abe N, Ninomiya Y, Olsen BR, Ooshima A (1994 年 2 月)。「ヒト α 1(XV) コラーゲン鎖は、タンデムリピート構造を持ち、α 1(XVIII) コラーゲンと相同性を持つ大きなアミノ末端非三重らせんドメインを含む」。The Journal of Biological Chemistry 。269 (6): 4042–6。doi : 10.1016 / S0021-9258 ( 17 ) 41739- X。PMID 8307960 。
Myers JC、Dion AS、Abraham V、Amenta PS (1996 年 12 月)。「タイプ XV コラーゲンはヒト組織に広く分布しているが、基底膜領域では明確な局在を示す」。細胞および組織研究。286 (3 ) : 493– 505。doi :10.1007/s004410050719。PMID 8929352。S2CID 37769206 。
Hägg PM、Hägg PO、Peltonen S、Autio-Harmainen H、Pihlajaniemi T (1997 年 6 月)。「ヒト組織におけるタイプ XV コラーゲンの位置と線維性腎臓の間質マトリックスへの蓄積」。アメリカ病理学ジャーナル。150 ( 6): 2075–86。PMC 1858337。PMID 9176399。
Hägg PM、Muona A、Liétard J、Kivirikko S、Pihlajaniemi T (1998 年 7 月)。「ヒト XV 型コラーゲンのアルファ 1 鎖遺伝子 (COL15A1) の完全なエクソン - イントロン構成と相同 COL18A1 遺伝子との比較」。The Journal of Biological Chemistry。273 ( 28): 17824– 31。doi : 10.1074/ jbc.273.28.17824。PMID 9651385。
ラムチャンドラン R、ダナバル M、フォルク R、ウォーターマン MJ、シーガル M、ルー H、他（1999年2月）。「ヒトコラーゲンXVのNC10ドメインであるレスチンの抗血管新生活性：エンドスタチンとの比較」。生化学および生物物理学研究コミュニケーション。255 (3): 735–9 .土井:10.1006/bbrc.1999.0248。PMID 10049780。
Li D、Clark CC、 Myers JC (2000 年 7 月)。「基底膜ゾーンタイプ XV コラーゲンは、ヒト組織および培養細胞中のジスルフィド結合コンドロイチン硫酸プロテオグリカンである」。The Journal of Biological Chemistry。275 ( 29): 22339– 47。doi : 10.1074/ jbc.M000519200。PMID 10791950。
Nishi M, Mizushima A, Nakagawara K, Takeshima H (2000 年 7 月). 「ヒトジャンクトフィリンサブタイプ遺伝子の特性」.生化学および生物物理学的研究通信. 273 (3): 920– 7. doi :10.1006/bbrc.2000.3011. PMID 10891348.
Eklund L、Muona A、 Liétard J、Pihlajaniemi T (2000 年 11 月)。「マウス XV 型コラーゲン遺伝子 Col15a1 の構造、ヒト COL15A1 遺伝子との比較、および両遺伝子のプロモーターの機能解析」。Matrix Biology。19 ( 6 ): 489– 500。doi :10.1016/S0945-053X(00)00090-1。PMID 11068203 。
Tomono Y, Naito I, Ando K, Yonezawa T, Sado Y, Hirakawa S, et al. (2002年2月). 「マルチプレキシンコラーゲンに対するエピトープ定義モノクローナル抗体は、タイプXVおよびXVIIIコラーゲンが特殊な基底膜で発現していることを実証しています」.細胞構造と機能. 27 (1): 9– 20. doi : 10.1247/csf.27.9 . PMID 11937714.
Myers JC、Amenta PS、Dion AS、Sciancalepore JP、Nagaswami C、Weisel JW、Yurchenco PD (2007 年 6 月)。「ヒト組織タイプ XV の分子構造は、コラーゲンの中でユニークな構造を示す」。The Biochemical Journal。404 ( 3 ) : 535– 44。doi :10.1042/ BJ20070201。PMC 1896284。PMID 17355226。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000204291 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000028339 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid1427836-5] ヒュブナー K、カニッツァーロ LA、ジャブズ EW、キヴィリッコ S、マンゾーン H、ピフラジャニエミ T、マイヤーズ JC (1992 年 10 月)。「新しいタイプのコラーゲン（COL15A1）をコードする遺伝子の9q21→q22への染色体割り当て」。ゲノミクス。14 (2): 220– 4.土井: 10.1016/S0888-7543(05)80209-5。PMID 1427836。

[entrez-6] 「Entrez Gene: COL15A1 コラーゲン、タイプ XV、アルファ 1」。

[7] ブルトー、サンドリーヌ;ギヨン、エミリー。カルピネン、サンナマリア。ピフラジャニエミ、タイナ;ルッジェーロ、フィレンツェ (2020-05-01)。「コラーゲンXV、組織や種を超えて存在する多面的なマルチプレキシン」。マトリックスバイオロジープラス。6–7 : 100023.土井: 10.1016 /j.mbplus.2020.100023。ISSN 2590-0285。PMC 7852327。PMID 33543021。

[:0-8] Clementz AG、Harris A (2013年12月)。「コラーゲンXV：腫瘍微小環境におけるその構造と役割の探究」。分子がん研究。11 (12): 1481– 6。doi : 10.1158 / 1541-7786.MCR -12-0662。PMC 4159701。PMID 24043668。