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バイオレポジトリは、実験室研究用の生物学的材料のサンプルを収集、分類、保管する施設です。バイオレポジトリは、動物、植物、その他の生物から標本を収集して管理します。バイオレポジトリには、血液、尿、組織、細胞、DNA、RNA、タンパク質のサンプルなど、さまざまな種類の標本が保管されます。サンプルが人体から採取された場合、実験室研究でサンプルを使用することに対する書面による同意とともに、医療情報とともに保管されることがあります。[1]
目的
バイオリポジトリの目的は、将来の研究で使用するために生物学的標本と関連情報を維持することです。バイオリポジトリは、コレクション内の標本の品質を維持し、科学的研究に利用できるようにしています。
オペレーション
バイオリポジトリの 4 つの主な業務は、(i) 収集、(ii) 処理、(iii) 保管または在庫、(iv) 生物学的標本の配布です。
(i) 標本がバイオレポジトリに到着すると、収集または受入が行われます。標本に関する情報は、バイオレポジトリ内のすべての標本に関する情報を追跡する研究情報管理システム(LIMS) に入力されます。標本にリンクされる一般的な情報は、標本の起源とバイオレポジトリに到着した時期です。
(ii) 標本の処理は、取り扱いによる変動を最小限に抑えるために標準化されています。処理により、標本を長期保存用に準備する場合があります。たとえば、DNA サンプルは、適切な pH の塩緩衝液 (水溶液) で処理され、DNA を安定させて保存します。
(iii) 保管と在庫は、配布要求によって要求される前にすべてのサンプルが保管される場所です。在庫システムはサンプル保管ボックスで構成されており、ボックスはサンプル保管要件に応じてさまざまなタイプの冷凍庫に保管されます。
（iv）配布とは、バイオリポジトリ在庫システムから1つ以上のサンプルを取得するプロセスです。
標準操作手順
標準操作手順 (SOP) は、バイオレポジトリ業界で重要な役割を果たします。SOP が重要な理由はいくつかあります。
- SOPは、適切な保管と管理のための標準化されたガイドラインを提供することで、サンプルと保管プロセス内のばらつきを減らします。[2]
- 生体試料のサンプルは、自然な状態の生体試料と非常によく似ている必要があります。SOP は、これを保証するのに役立ちます。
- SOPはバイオレポジトリ内での運用方法の標準化されたフレームワークを提供します。これにより、運用全体にわたってシームレスで信頼性の高いプロセスが実装されます。[3]
生物資源センター
OECDは、生物資源センターと呼ばれるバイオリポジトリのベストプラクティスガイドラインを発行しています。[4] [5] OECDでは、バイオリポジトリを次のように定義しています。
「生物資源センターは、バイオテクノロジーを支えるインフラの重要な部分です。生物資源センターは、生きた細胞、生物のゲノム、遺伝や生物システムの機能に関する情報のサービスプロバイダーとリポジトリで構成されています。BRCには、培養可能な生物（微生物、植物、動物、ヒトの細胞など）、これらの複製可能な部分（ゲノム、プラスミド、ウイルス、cDNAなど）、生存可能だがまだ培養できない生物、細胞、組織のコレクション、およびこれらのコレクションと関連するバイオインフォマティクスに関連する分子、生理学、構造情報を含むデータベースが含まれています。」[6]
米国のバイオリポジトリの例
細胞株リポジトリ
- 国立神経疾患・脳卒中研究所（NINDS）ヒト細胞・データリポジトリは、神経疾患の研究を進めるために細胞株のコレクションを維持しています。[7] [8]
- 国立老化研究所（NIA）老化細胞リポジトリは、さまざまな年齢の被験者から収集された細胞株を提供することで、老化のメカニズムの研究を促進します。[9] [8]
- 国立総合医学研究所（NIGMS）ヒト遺伝子細胞リポジトリは、生物医学研究に使用するために、特性が明確にされたヒト細胞のコレクションです。[10] [8]
サンプルリポジトリ
- インターマウンテンヘルスケアバイオレポジトリは、ホルマリンで保存されパラフィンワックスに埋め込まれた450万以上の生物学的サンプルのコレクションです。[11]
- J.クレイグ・ベンター研究所ヒトリファレンスゲノムは、ゲノムの配列が決定され、組み立てられたJ.クレイグ・ベンターのDNAサンプルを公開しています。 [12]
- 米国疾病管理予防センター（CDC）の遺伝子検査参考物質プログラム（GeT-RM）は、分子遺伝学的検査で使用するためのDNAサンプルを保管しています。[13]これらのサンプルは、ハンチントン病、嚢胞性線維症、脆弱X症候群、アルファサラセミア、ミュンケ症候群などの疾患のものです。
参照
参考文献
- ^ 「NCI辞書 - バイオリポジトリ」。国立がん研究所。2011年2月2日。 2021年9月23日閲覧。
- ^ 「ゲノム医療：バイオバンキングの標準操作手順（SOP）」Inside Biobanking 2015-12-08 2017-10-16閲覧。
- ^ 「バイオバンキングにおける標準操作手順（SOPS）の重要性」。バイオリポジトリ。2017年10月16日閲覧。
- ^ Smith, D; Ryan, MJ (2008年1月). 「OECDベストプラクティスが微生物の凍結保存技術の検証に与える影響」Cryo letters . 29 (1): 63–72. PMID 18392291.
- ^ OECD生物資源センター向けベストプラクティスガイドライン
- ^ OECD BRCガイドライン
- ^ 「iPSCや線維芽細胞を含む幹細胞のリソース | NINDSヒト細胞およびデータリポジトリ」nindsgenetics.org 。 2021年10月20日閲覧。
- ^ abc Siwek, Martina (2015年10月). 「バイオリポジトリの概要 - 過去、現在、そして未来」.軍事医学. 180 (10S): 57–66. doi :10.7205/MILMED-D-15-00119.
- ^ “NIA”. www.coriell.org . 2021年10月20日閲覧。
- ^ 「NIGMSヒト遺伝子細胞リポジトリ」www.nigms.nih.gov . 2021年10月20日閲覧。
- ^ 「Intermountain Biorepositoryについて」。intermountainhealthcare.org 。 2021年10月20日閲覧。
- ^ “HuRef”. www.coriell.org . 2021年10月20日閲覧。
- ^ “GeT-RM | CDC”. www.cdc.gov . 2019-11-05 . 2021-10-20閲覧。
外部リンク
- Specimen Centralバイオリポジトリリスト、世界中で活動中のバイオバンクとバイオリポジトリのリスト
- 臨床検体データベースおよび検体コレクションリポジトリ
- Biorepository LIMS、バイオバンキングおよびバイオリポジトリ向けの LIMS ソフトウェア ソリューション
- バイオバンク、組織バンク、バイオリポジトリのグローバルディレクトリ
- 国立アレルギー感染症研究所 HIV/AIDS 検体保管庫
- 国際生物環境リポジトリ協会 (ISBER)
- ProMedDx BioServices cGMP バイオストレージ & バイオリポジトリ - バイオリポジトリコンサルティング設計
- Cell&Co バイオレポジトリ - フランス初のエコバイオバンク