セモチウイルス

セモチウイルス
ウイルスの分類
(ランク外):	ウイルス
領域:	リボビリア
王国：	パラナビラエ
門:	アートバービリコタ
クラス：	レブトラビリセテス
注文：	オルテルビラレス
家族：	ベルパオウイルス科
属:	セモチウイルス
種
	テキストを参照

セモチウイルスは、ベルパオウイルス科（以前はメタウイルス科に含まれていた）の唯一のウイルス属^{である。 [1]種は}真核生物宿主のゲノムにレトロトランスポゾンとして存在する。BEL/paoトランスポゾンは動物にのみ見られる。セモチウイルスは現在認識されている唯一の属であり、属の説明は科、ベルパオウイルス科の説明に対応している。^[2]

分類

この科の唯一の属であるセモティウイルスは、以前はメタウイルス科に含まれていましたが、他のメタウイルス科の属との系統関係のため除外されました。すでに認識されているベルパオウイルスの多様性を考えると、将来的にさらに多くの種と属がベルパオウイルス科に追加される可能性は高いです。ベルパオウイルス科、メタウイルス科、レトロウイルス科のPolドメインの順序は、オルテルウイルス目内では同じですが、カリモウイルス科の場合はインテグラーゼが欠如しているか、シュードウイルス科の場合はプロテアーゼドメインの上流に位置しています。^[3]

この属は長末端反復配列（LTR）レトロトランスポゾンで構成されており、後生動物感染性逆転写酵素ウイルスとも呼ばれています。^[4]

構成

ベルパオウイルス科のメンバーのゲノム配置は、メタウイルス科の長末端反復配列（LTR）レトロトランスポゾンの配置に類似している。[ 5 ^]ゲノム全体は4.2～10 kbで、1～3個の遺伝子（pol、env、gag）が0.2～1.2 kbのLTRに挟まれている。^{[6]逆転写ゲノムの最初のセグメントを表す非コード領域は、5′-LTRの下流に位置している。その後に、宿主tRNA}^ArgまたはtRNA ^Glyの3′末端内の特定の領域に相補的な18 ntのプライマー結合部位が続く。

プロウイルスDNA鎖の合成をプライミングするのは、3'-LTRの上流に位置する約10ntのポリプリン領域です。GagおよびPolポリタンパク質は、1つの連続した遺伝子または2つの重複した遺伝子によってコードされます。^[7]これらの遺伝子は、カプシドおよびヌクレオカプシドドメイン、ならびにプロテアーゼ、逆転写酵素（RT）、リボヌクレアーゼH、およびインテグラーゼドメインをコードします。

レプリケーション

ベルパオウイルスのウイルス粒子の形態についてはほとんど情報が知られていない。セモチウイルスのウイルス粒子の形態についてはほとんどわかっていない。しかし、ベルパオウイルスは、オルテルウイルス目の他のメンバーと相同性のあるヌクレオカプシドおよびカプシドタンパク質ドメインを持つGagポリタンパク質をコードしているため、レトロウイルス、メタウイルス、および擬似ウイルスと同様に、ウイルス様粒子（VLP）を形成して複製する可能性が高い。 ^[8]^[9] env様遺伝子は特定のベルパオウイルスに存在するが、その正確な役割はまだ不明である。^[10]

複製の詳細はよくわかっていないが、メタウイルス科のウイルスの複製に似ていると考えられている^[11]。メタウイルス科のウイルスの複製では、RT が完全な転写産物を dsDNA に変換し、インテグラーゼタンパク質によって宿主ゲノムに組み込まれる。組み込まれたプロウイルスが宿主の RNA ポリメラーゼ II によって転写された後、新しいウイルス RNA が生成され、対応する宿主酵素によってキャップされ、ポリアデニル化される。宿主細胞の細胞質に入ると、これらの新鮮なウイルス RNA は Gag と Pol によって未熟な VLP に翻訳される。VLP の成熟は、ウイルスプロテアーゼによるポリタンパク質のタンパク質分解処理の最終結果である。新しいウイルス RNA は、RT によって dsDNA 分子に逆転写され、核に戻されて宿主細胞ゲノム内の新しい場所に挿入される。^[12]

RT:逆転写酵素。

VLPS:ウイルス様粒子。

LTR : Long Terminal Repeat (長い末端反復)。

種

この属には以下の種が含まれる: ^[13]

ハマダラカムースウイルス
アンセレアセモチウイルスタミー
回虫ルンブリコイデス Tas ウイルス
カイコパオウイルス
線虫Cer13ウイルス
キイロショウジョウバエベルウイルス
キイロショウジョウバエ Roo ウイルス
ショウジョウバエセモチウイルスマックス
ショウジョウバエ・シミュランス忍者ウイルス
住血吸虫セモチウイルスシンドバッド
トラフグスズウイルス

参考文献

^ クルポビッチ、M;ブロンバーグ、J;コフィン、JM。ダスグプタ、私。ファン、H;広告、ギアリング。ギフォード、R;ハラッハ、B;ハル、R;ジョンソン、W;クロイツェ、JF。リンデマン、D;ジョレンス、C;ロックハート、B;メイヤー、J;ミュラー、E;オルシェフスキー、N;パップ、HR;プーギン、M;リヒェルト・ペゲラー、KR;サバナゾビッチ、S;サンファソン、H;シェルツ、JE;シール、S;スタボロン、L;ストイ、日本。ペンシルバニア州テイチェニー;トリステム、M;クーニン、EV; JH クーン氏（2018 年 4 月 4 日）。「オルテルビラ目: 逆転写ウイルスの 5 つのファミリーを統合する新しいウイルス秩序」。ウイルス学ジャーナル。92 (12)。土井：10.1128/JVI.00515-18。PMC 5974489。PMID 29618642。
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^ 「ウイルス分類：2020年リリース」。国際ウイルス分類委員会（ICTV）。 2021年7月7日閲覧。

Frame IG、Cutfield JF、Poulter RTM (2001) Fugu rubripes、Caenorhabditis elegans、Drosophila melanogaster における新しい BEL 様 LTR レトロトランスポゾン。Gene 263(1–2):219–230

外部リンク

「メタウイルス科」。NCBI分類ブラウザ。186665。
ICTVdB ウイルスインデックス
植物ウイルスの説明
WikispeciesのSemotivirusに関連するデータ

[1] クルポビッチ、M;ブロンバーグ、J;コフィン、JM。ダスグプタ、私。ファン、H;広告、ギアリング。ギフォード、R;ハラッハ、B;ハル、R;ジョンソン、W;クロイツェ、JF。リンデマン、D;ジョレンス、C;ロックハート、B;メイヤー、J;ミュラー、E;オルシェフスキー、N;パップ、HR;プーギン、M;リヒェルト・ペゲラー、KR;サバナゾビッチ、S;サンファソン、H;シェルツ、JE;シール、S;スタボロン、L;ストイ、日本。ペンシルバニア州テイチェニー;トリステム、M;クーニン、EV; JH クーン氏（2018 年 4 月 4 日）。「オルテルビラ目: 逆転写ウイルスの 5 つのファミリーを統合する新しいウイルス秩序」。ウイルス学ジャーナル。92 (12)。土井：10.1128/JVI.00515-18。PMC 5974489。PMID 29618642。

[2] 「Genus: Semotivirus | ICTV」. ictv.global . 2024年10月13日閲覧。

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[4] Soriano, Beatriz; Krupovic, Mart; Llorens, Carlos (2021). 「ICTVウイルス分類プロファイル：ベルパオウイルス科 2021」. Journal of General Virology . 102 (11): 001688. doi :10.1099/jgv.0.001688. ISSN 1465-2099. PMC 8742986 . PMID 34761738.

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[6] ジョレンス、C.;二見良。コヴェッリ、L.ドミンゲス・エスクリバ、L.ヴィウ、JM。タマリット、D.アギラール・ロドリゲス、J.ビセンテ・リポレス、M.ファスター、G.バーネット、GP;モーマス、F.ムニョス・ポマー、A.センペレ、JM。ラトーレ、A.モヤ、A. (2010-10-29)。「モバイル遺伝要素のジプシーデータベース (GyDB): リリース 2.0」。核酸研究。39 (データベース): D70 – D74。土井：10.1093/nar/gkq1061。ISSN 0305-1048。PMC 3013669。PMID 21036865。

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[8] クルポビッチ、マート;ジョナス・ブロンバーグ。コフィン、ジョン・M.ダスグプタ、インドラニル。ファン、フン。ギアリング、アンドリュー D.ギフォード、ロバート。ハラハ、バラズ。ハル、ロジャー。ジョンソン、ウェルキン。クロイツェ、ヤン・F.リンデマン、ディルク。ジョレンス、カルロス。ベン・ロックハート。メイヤー、イェンス (2018-06-15)。「オルテルビラレス目: 逆転写ウイルスの 5 つのファミリーを統合する新しいウイルス秩序」。ウイルス学ジャーナル。92 (12)。土井：10.1128/JVI.00515-18。ISSN 0022-538X。PMC 5974489。PMID 29618642。

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[11] Llorens, Carlos; Soriano, Beatriz; Krupovic, Mart; ICTV Report Consortium (2020). 「ICTVウイルス分類プロファイル：メタウイルス科」. Journal of General Virology . 101 (11): 1131– 1132. doi :10.1099/jgv.0.001509. ISSN 1465-2099. PMC 7879559. PMID 33048045 .

[12] Soriano, Beatriz; Krupovic, Mart; Llorens, Carlos (2021). 「ICTVウイルス分類プロファイル：ベルパオウイルス科 2021」.一般ウイルス学ジャーナル. 102 (11). doi :10.1099/jgv.0.001688. PMC 8742986. PMID 34761738 .

[13] 「ウイルス分類：2020年リリース」。国際ウイルス分類委員会（ICTV）。 2021年7月7日閲覧。