| アスパラギン酸セミアルデヒド脱水素酵素 | |||||||||
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アスパラギン酸セミアルデヒド脱水素酵素テトラマー、トリコフィトン・ルブルム | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
| EC番号 | 1.2.1.11 | ||||||||
| CAS番号 | 9000-98-0 | ||||||||
| データベース | |||||||||
| インテンズ | IntEnzビュー | ||||||||
| ブレンダ | BRENDAエントリー | ||||||||
| エクスパス | NiceZyme ビュー | ||||||||
| ケッグ | KEGGエントリー | ||||||||
| メタサイク | 代謝経路 | ||||||||
| プリアモス | プロフィール | ||||||||
| PDB構造 | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| 遺伝子オントロジー | アミゴー / クイックゴー | ||||||||
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酵素学では、アスパラギン酸セミアルデヒド脱水素酵素( EC 1.2.1.11) は、原核生物、菌類、一部の高等植物におけるアミノ酸の生合成に非常に重要な酵素です。アスパラギン酸からリジン、メチオニン、ロイシン、イソロイシンを形成する代謝経路の初期の分岐点を形成します。この経路は、細菌細胞壁形成に不可欠な役割を果たすジアミノピメリン酸も生成します。ASADH は、この酵素を無効にすると生物にとって致命的であることが証明されており、この酵素を阻害することを目的とした新しいクラスの抗生物質、殺菌剤、除草剤の可能性が生まれるため、特に注目されています。[引用が必要]
- L-アスパラギン酸4-セミアルデヒド + リン酸 + NADP + L -4-アスパルチルリン酸 + NADPH + H +
この酵素の3 つの基質はL-アスパラギン酸 4-セミアルデヒド、リン酸、およびNADP +であり、3 つの生成物は L-4-アスパルチルリン酸、NADPH、およびH +です。ただし、生理学的条件下では、反応は逆方向に進行します。
この酵素は酸化還元酵素のファミリーに属し、具体的にはNAD+またはNADP+を受容体として供与体のアルデヒドまたはオキソ基に作用する酵素です。この酵素クラスの系統名は、 L-アスパラギン酸-4-セミアルデヒド:NADP+酸化還元酵素(リン酸化)です。一般的に使用される他の名前には、アスパラギン酸セミアルデヒド脱水素酵素、アスパラギン酸セミアルデヒド脱水素酵素、L-アスパラギン酸-β-セミアルデヒド:NADP+酸化還元酵素(リン酸化)、アスパラギン酸-β-セミアルデヒド脱水素酵素、ASA脱水素酵素などがあります。この酵素は、グリシン、セリン、スレオニンの代謝とリジンの生合成に関与しています。
アスパラギン酸セミアルデヒド脱水素酵素は、一部の Asd 遺伝子の 5' UTRにあるAsd RNA モチーフによってシス制御される可能性があります。
タンパク質ファミリー
| セミアルデヒド脱水素酵素、二量体化ドメイン | |||||||||
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| 識別子 | |||||||||
| シンボル | セミアルデヒド_dhC | ||||||||
| パム | PF02774 | ||||||||
| ファム一族 | CL0139 | ||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||
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このドメインには、アルギニン生合成に関与するN-アセチルグルタミンセミアルデヒド脱水素酵素(AgrC)と、アスパラギン酸からさまざまなアミノ酸を生合成する酵素であるアスパラギン酸セミアルデヒド脱水素酵素[1]の両方が含まれています。また、酵母と真菌のArg5,6タンパク質も含まれており、これはN-アセチル-γ-グルタミルリン酸還元酵素とアセチルグルタミン酸キナーゼに切断されます。これらもアルギニン生合成に関与しています。このエントリのすべてのタンパク質には、セミアルデヒド脱水素酵素の二量体化ドメインが含まれています。
構造研究
2007 年末現在、このクラスの酵素については 24 の構造が解明されており、PDBアクセス コードは 1BRM、1GL3、1MB4、1MC4、1NWC、1NWH、1NX6、1OZA、1PQP、1PQU、1PR3、1PS8、1PU2、1Q2X、1T4B、1T4D、1TA4、1TB4、1YS4、2EP5、2GYY、2GZ1、2GZ2、および 2GZ3 です。
参考文献
- BLACK S, WRIGHT NG (1955). 「アスパラギン酸β-セミアルデヒド脱水素酵素とアスパラギン酸β-セミアルデヒド」J. Biol. Chem . 213 (1): 39– 50. doi : 10.1016/S0021-9258(18)71042-9 . PMID 14353904.
- Boyer, PD, Lardy, H. および Myrback, K. (編)、『酵素』第 2 版、第 7 巻、Academic Press、ニューヨーク、1963 年、p. 203-221。
