古細菌の開始因子

古細菌の開始因子は、古細菌におけるタンパク質合成の翻訳段階で使われるタンパク質です。これらのタンパク質が果たす主な機能には、リボソームRNA / mRNAの認識、開始因子Met- tRNA _i ^Met（メチオニン結合tRNAi）の40sリボソームへの送達、開始複合体の校正などがあります。^[1]

生命の3つのドメイン、 古細菌、真核生物、細菌のうち、古細菌のTIFの数は真核生物と細菌の中間に位置し、真核生物はTIFの数が最も多く、細菌はプロセスを合理化しているためTIFを3つしか持っていません。^[1]古細菌のTIFの数が細菌と真核生物の数の中間であるだけでなく、古細菌の開始因子は真核生物と原核生物の開始因子の両方の特徴を持っていると考えられています。^[2] 2つのコアTIF、IF1/IF1AとIF2/IF5Bは、3つの生命ドメインにわたって保存されています。^{[1]また、すべての古細菌と真核生物に見られる}SUI1と呼ばれる半普遍的なTIFがありますが、これは特定の細菌種（YciH）にのみ見られます。古細菌と真核生物では、これらのTIFは開始コドンの識別を修正するのに役立ちますが、細菌ではその機能は不明です。^[1]真核生物と古細菌の間では、古細菌のa/eIF2（三量体）とaIF6は、真核生物ではeIF2（三量体）とeIF6 TIFとして保存されています。^[1]

古細菌は真核生物のeIF2B（eIF2のGTP交換因子）の相同体も持っている可能性がある。しかし、αサブユニットのみが明確に同定されているため、古細菌ではGTP交換因子としては機能しないと思われる。 ^{[3] [4]} eIF4Aの相同体もあるが、翻訳開始には関与していないようである。^[5]

• aIF1: SUI1 (eIF1)ホモログ。^[6]
• aIF1A: IF1 / eIF1Aホモログ。^[6]リボソームA部位を占有する役割を果たし、大リボソームサブユニットのP部位にtRNAiを明確に配置するのに役立ちます。^[1]
• aIF2: 三量体、eIF2相同体。^[6]リボソームの40S小サブユニットに結合し、mRNAからタンパク質への翻訳開始を誘導する。^[7] eIF2の代替となる。^[2]
• aIF5A: EF-P / eIF5Aホモログ。真核生物のものと同様にヒプシンを含む。 ^[8]実際には伸長因子である。^[9]
• aIF5B: IF2 / eIF5Bホモログ。^[6]リボソームサブユニット（小および大）を結合して、開始後期に完全な単一の（モノマー）mRNA結合リボソームユニットを形成する。^[1]
• aIF6: eIF6ホモログ。2つのリボソームサブユニットを分離します。^[6]