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| zf-AN1 | |||||||||
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 Arabiopsis thaliana f5o11.17 タンパク質の zf-an1 ドメインの溶液構造 | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
| シンボル | zf-AN1 | ||||||||
| パム | PF01428 | ||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||
| 頭いい | 亜鉛 | ||||||||
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分子生物学では、AN1型ジンクフィンガードメインは、二金属（亜鉛）結合アルファ/ベータフォールドを有する。このドメインは、アフリカツメガエルのユビキチン様タンパク質であるAN1 SWISSPROTのC末端のジンクフィンガーとして最初に同定された。[1] AN1型ジンクフィンガーには、2つの亜鉛原子を配位できる可能性のある6つの保存されたシステインと2つのヒスチジンが含まれている。
特定のストレス関連タンパク質（SAP）にはAN1ドメインが含まれており、多くの場合、A20ジンクフィンガードメイン（SAP8）またはC2H2ドメイン（SAP16）と組み合わせて使用されています。[2]たとえば、ヒトタンパク質Znf216はN末端にA20ジンクフィンガー、C末端にAN1ジンクフィンガーを持ち、 NFkappaB活性化経路を負に制御し、 RIP、IKKgamma、TRAF6などの免疫応答のコンポーネントと相互作用します。Znf216とIKK-gammaおよびRIPとの相互作用はA20ジンクフィンガードメインによって媒介され、TRAF6との相互作用はAN1ジンクフィンガードメインによって媒介されるため、両方のジンクフィンガードメインが免疫応答の制御に関与しています。[3] AN1ジンクフィンガードメインは、ユビキチン化経路に関与するユビキチン様ドメインを含むタンパク質にも見られます。[1] AN1型ジンクフィンガーを含むタンパク質には以下のものがある：
- ホヤ後端マーク6（pem-6）タンパク質。[4]
- ヒトAWP1タンパク質（PRK1と関連）は初期胚発生中に発現する。[5]
- ヒト免疫グロブリンμ結合タンパク質2（SMUBP-2）の変異は、呼吸窮迫1型筋萎縮症を引き起こす。[6]
AN1 型ジンクフィンガードメインは、多様な「ユーリアーキオータ」とニトロソスファエロタに広く存在し、ロンボイドファミリーセリンペプチダーゼ、パパインフォールドのトランスグルタミナーゼ様チオールペプチダーゼ、および Zn 依存性メタロペプチダーゼなどの膜関連ペプチダーゼドメインと融合していることが多い。古細菌の AN1 ドメインは、膜貫通ヘリックスや、DNAJ や SCP/PR1 などのドメインにもリンクしている。これらの融合は、古細菌の AN1 ドメイン含有タンパク質が、ポリペプチドのタンパク質分解処理やタンパク質の折り畳みや安定性の調節など、膜関連の役割を担っていることを示唆している。その構造的構文は、原核生物のB ボックスジンクフィンガーおよびLIMドメインと非常によく似ている。[7]
参考文献
- ^ ab Linnen JM、Bailey CP 、Weeks DL（1993年6月）。「アフリカツメガエル由来の2つの関連する局所mRNAはユビキチン様融合タンパク質をコードする」。遺伝子。128 （ 2 ）：181–8。doi ：10.1016/0378-1119（93）90561-G。PMID 8390387 。
- ^ Vij S, Tyagi AK (2006 年 12 月). 「イネにおける A20/AN1 ジンクフィンガーを含むストレス関連タンパク質 (SAP) 遺伝子ファミリーのゲノムワイド解析とシロイヌナズナとの系統関係」. Mol. Genet. Genomics . 276 (6): 565–75. doi :10.1007/s00438-006-0165-1. PMID 17033811. S2CID 31769652.
- ^ Huang J, Teng L, Li L, Liu T, Li L, Chen D, Xu LG, Zhai Z, Shu HB (2004 年 4 月). 「ZNF216 は A20 様で IkappaB キナーゼガンマと相互作用する NFkappaB 活性化阻害剤です」. J. Biol. Chem . 279 (16): 16847–53. doi : 10.1074/jbc.M309491200 . PMID 14754897.
- ^ Satou Y, Satoh N (1997年12月). 「後端マーク2 (pem-2), pem-4, pem-5, pem-6: ホヤ胚に局在するmRNAを持つ母性遺伝子」. Dev. Biol . 192 (2): 467–81. doi : 10.1006/dbio.1997.8730 . PMID 9441682.
- ^ Duan W, Sun B, Li TW, Tan BJ, Lee MK, Teo TS (2000 年 10 月). 「生体内でセリン/スレオニンキナーゼ PRK1 と関連する新規タンパク質 AWP1 のクローニングと特性評価」. Gene . 256 (1–2): 113–21. doi :10.1016/S0378-1119(00)00365-6. PMID 11054541.
- ^ Liepinsh E、Leonchiks A、Sharipo A、Guignard L、Otting G (2003 年 2 月)。「ヒト Smubp-2 の R3H ドメインの溶液構造」。J . Mol. Biol . 326 (1): 217–23. doi :10.1016/S0022-2836(02)01381-5. PMID 12547203。
- ^ Burroughs AM、Iyer LM、Aravind L (2011 年 7 月)。「原核生物における RING フィンガーおよびその他の二核トレブル クレフ ドメインの機能的多様化とユビキチン システムの初期進化」。Mol . Biosyst . 7 (1): 2261–77. doi :10.1039/C1MB05061C. PMC 5938088. PMID 21547297 。