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 膜輸送とシグナル伝達に関与するタンパク質である hrs の vhs および fyve タンデムドメインの結晶構造 | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
| シンボル | VHS | ||||||||
| パム | PF00790 | ||||||||
| ファム一族 | CL0009 | ||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||
| 頭いい | VHS | ||||||||
| SCOP2 | 1elk / スコープ / SUPFAM | ||||||||
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分子生物学では、VHS タンパク質ドメインは約140残基の長さです。その名前は、V PS-27、H rs、およびSTAMに出現することから派生した頭字語です。これは、多くのタンパク質のN末端によく見られるドメインです。[1]
関数
VHSドメインは小胞輸送において非常に重要であり、特に膜標的化と貨物認識の役割を助けると考えられています。[1]
構造
ショウジョウバエHrsとヒトTOM1のVHSドメインの結晶構造の解析により、二重層スーパーヘリックスに配置された8つのヘリックスで構成されていることが明らかになりました。 [2]ドメイン表面の保存された残基パッチの存在は、VHSドメインがタンパク質間の認識とドッキングに関与している可能性を示唆しています。全体的に、ドメインファミリーメンバー間の配列類似性は低い（約25％）。
分類
ドメイン周囲の領域に基づいて、VHSタンパク質は4つのグループに分類されます。[1]
- STAM /EAST/ STAM2 (Hbp) はすべてドメイン構成 VHS- SH3 - ITAMを共有し、1つまたは2つのユビキチン相互作用モチーフを持っています。
- FYVEドメイン（INTERPRO）を持つタンパク質は、VHSのC末端に1つまたは2つのユビキチン相互作用モチーフも持っています。
- ドメイン構成VHS-GAT（GGAおよびTom1）相同ドメインを持つGGAタンパク質
- VHSドメイン単独、または上記以外のドメインとの組み合わせ
VHSドメインは常にタンパク質のN末端に存在し、このようなトポロジーが機能にとって重要であることを示唆している。このドメインは、小胞輸送において一般的な膜標的化/貨物認識の役割を果たすと考えられている。[3]
参考文献
- ^ abc Lohi O、Poussu A、Mao Y、Quiocho F、Lehto VP (2002)。「VHSドメイン - 小胞ラインの港湾労働者」。FEBS Lett。513 ( 1 ): 19–23。doi : 10.1016/s0014-5793(01) 03287-2。PMID 11911875。S2CID 10894998 。
- ^ マオ Y、ニッキテンコ A、ドゥアン X、ロイド TE、ウー MN、ベレン H、キオチョ FA (2000 年 2 月)。 「膜輸送およびシグナル伝達に関与するタンパク質であるHrsのVHSおよびFYVEタンデムドメインの結晶構造」。セル。100 (4): 447–56。土井：10.1016/S0092-8674(00)80680-7。PMID 10693761。S2CID 4979735 。
- ^ Misra S、Beach BM、Hurley JH (2000 年 9 月)。「ヒト Tom1 (myb 1の標的) の VHS ドメインの構造: タンパク質および膜との相互作用に関する考察」。生化学。39 ( 37): 11282–90。doi :10.1021/bi0013546。PMID 10985773 。