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分子生物学では、トランス活性化 CRISPR RNA ( tracrRNA ) は、小さなトランスエンコードRNA です。これは、人類に危害をもたらす細菌の一種であるヒト病原体Streptococcus pyogenesの研究において、エマニュエル・シャルパンティエによって初めて発見されました。 [1]細菌と古細菌 では、CRISPR-Cas (クラスター化され、規則的に間隔を空けた短い回文反復配列/CRISPR 関連タンパク質) が、ウイルスやプラスミドから保護する RNA 媒介防御システムを構成しています。この防御経路には 3 つのステップがあります。まず、侵入した核酸のコピーが CRISPR遺伝子座に組み込まれます。次に、この CRISPR 遺伝子座から CRISPR RNA (crRNA) が転写されます。次に、crRNA はエフェクター複合体に組み込まれ、crRNA が複合体を侵入した核酸に導き、Cas タンパク質がこの核酸を分解します。[2] CRISPRシステムにはいくつかのサブタイプがある。
タイプ II CRISPR-Cas システムには、crRNA の成熟に役割を果たす tracrRNA が必要です。[3] tracrRNA はpre-crRNAと部分的に相補的で、塩基対を形成してRNA 二重鎖を形成します。これはRNA 特異的リボヌクレアーゼであるRNase IIIによって切断され、crRNA/tracrRNA ハイブリッドを形成します。このハイブリッドは、侵入した核酸を切断するエンドヌクレアーゼCas9のガイドとして機能します。 [1] [4] [5]
参照
参考文献
- ^ ab Deltcheva E, Chylinski K, Sharma CM, Gonzales K, Chao Y, Pirzada ZA, et al. (2011). 「トランスエンコードされたsmall RNAと宿主因子RNase IIIによるCRISPR RNAの成熟」。Nature . 471 ( 7340): 602–607. Bibcode :2011Natur.471..602D. doi : 10.1038/nature09886. PMC 3070239. PMID 21455174.
- ^ Terns MP, Terns RM (2011). 「CRISPRベースの適応免疫システム」. Curr Opin Microbiol . 14 (3): 321–327. doi :10.1016/j.mib.2011.03.005. PMC 3119747. PMID 21531607 .
- ^ Charpentier E, Richter H, van der Oost J, White MF (2015). 「古細菌および細菌のCRISPR-Cas適応免疫におけるRNAガイドの生合成経路」FEMS微生物レビュー. 39 (3): 428–441. doi :10.1093/femsre/fuv023. PMC 5965381. PMID 25994611 .
- ^ Jinek M, Chylinski K, Fonfara I, Hauer M, Doudna JA, Charpentier E (2012). 「適応型細菌免疫におけるプログラム可能なデュアルRNA誘導DNAエンドヌクレアーゼ」. Science . 337 (6096): 816–821. Bibcode :2012Sci...337..816J. doi :10.1126/science.1225829. PMC 6286148. PMID 22745249 .
- ^ Brouns SJ (2012). 「免疫のスイスアーミーナイフ」. Science . 337 (6096): 808–809. Bibcode :2012Sci...337..808B. doi :10.1126/science.1227253. PMID 22904002. S2CID 206543893.