サポウイルスは、 カリシウイルス 科に属する、遺伝的に多様な一本鎖プラス鎖RNA ウイルスで、エンベロープを持たない ウイルスの属です。 [ 1 ] [ 2 ] ノロウイルス とともに、サポウイルスはヒトや動物における急性胃腸炎( インフルエンザ とは関係ありませんが、一般的に「胃腸風邪」と呼ばれています)の最も一般的な原因です。 [ 3 ] [ 4 ] サポウイルスは、サッポロウイルス ( Sapovirus sapporoense )という1種のみを含む単型分類群 です。 [ 5 ] [ 6 ]
このウイルスの自然宿主はヒトとブタです。ウイルスは経口/糞便接触 によって伝染します。サポウイルスは一般的に子供や乳幼児に発生するため、保育園や託児所でよく蔓延しますが、長期介護施設でも発見されています。[ 7 ] これは、個人衛生や衛生対策の不足が原因である可能性があります。一般的な症状には、下痢や嘔吐があります。[ 8 ] サポウイルスは、 1977年に日本の札幌 にある孤児院 で発生した胃腸炎の集団感染で最初に発見されました。 [ 9 ]
感染経路と宿主の感受性 サポウイルスは糞口感染経路 で広がる。感染者は1000万個以上のサポウイルスを排泄する。10 9 10^9 糞便または嘔吐物1グラムあたり粒子。感染者の粒子は何年も生存し、感染量はわずか10個の粒子でも起こり得る。作業面や手などの汚染により、多数の新たな感染が発生する可能性がある。感染は糞口感染経路で起こる。その他の感染経路としては、感染者による食品の過剰な取り扱い(これはレストランで最もよく起こる)、感染した糞便で汚染された水域に生息していた貝類の摂取、汚染された水の摂取などがある。[ 10 ]
症状 1~4日の潜伏期間の後、病気の兆候が現れ始めます。サポウイルスの症状はノロウイルス の症状と非常によく似ています。最も一般的な症状は嘔吐と下痢です。ただし、悪寒、吐き気、頭痛、腹部痙攣、筋肉痛 、発熱などの追加症状が現れることもありますが、発熱は非常にまれです。患者は1~4日の潜伏期間後に症状が現れ始めることが多いですが、無症状のケースもあります。症状がなくても、感染者は一般的な感染経路である経口糞便経路でウイルスを拡散する可能性があります。[ 3 ]
防止 サポウイルス感染予防において最も重要なのは、一般的な衛生管理です。トイレ使用後や食事・調理前には、必ず手をよく洗ってください。アルコール系手指消毒剤はサポウイルスには効果がありません。汚染された表面は、消毒剤または漂白剤を含む溶液で清掃してください。その他の予防策としては、感染者との接触や飲食物の共有を避けることが挙げられます。
病院環境において 感染した患者は隔離し、感染した職員は業務を停止すべきである。 便器洗浄者は、注意して作業できるよう、十分な知識と教育を受けるべきである。 大規模な感染拡大が発生した場合、「新規入院患者の受け入れを停止する必要が生じる可能性がある」。 「感染した病棟から感染していない病棟への職員の移動は禁止し、集団活動は中止し、子供の面会は控えるべきである。」[ 10 ]
処理 サポウイルスに感染した人に対する特効薬はありません。サポウイルスは細菌感染症ではないため、抗生物質で治療することはできません。治療には、水分補給などの症状緩和が含まれます。[ 10 ]
免疫 サポウイルス感染後の免疫は、遺伝子型または遺伝子群に大きく特異的であり、遺伝的に異なる株に対する交差防御は限られているようです。[ 11 ] [ 12 ]
ウイルス分類
構造とゲノム サポウイルスは、エンベロープを持たない、プラス鎖一本鎖RNAウイルスで、サイズは約7.7kbです。このウイルスは3'末端にポリ(A)テールを持ちますが、5'キャップはありません。サポウイルスは180個のサブユニット(T=3)を含む正二十面体 構造をしています。カプシドの直径は27~40nmです 。[ 13 ] 他のカリシウイルスと同様に、サポウイルスのカプシドの表面には丸い突起があります。しかし、その「ダビデの星」のような表面形態は、他のカリシウイルスと区別されます。[ 3 ]
サポウイルスのゲノムは、2つ(おそらく3つ)のよく知られたオープンリーディングフレーム (ORF)に組織化されています。ORF1は、非構造タンパク質と主要カプシドタンパク質であるVP1をコードしています。VP1には、シェル(S)と突出部(P)という2つの標準ドメインがあります。Sタンパク質の機能は「核酸の周りに足場を形成する」ことであり、Pタンパク質は「受容体とのホモ二量体を形成する」上で重要です。[ 14 ] ORF2は、マイナー構造ポリタンパク質であるVP2をコードしています。3番目のORF(ORF3)の存在が予測されていますが、その機能が何であるかの証拠はありません。[ 3 ]
サポウイルスの完全なゲノムは少なくとも21個が解析され、同定されており、これらはすべて5つのカテゴリー(GI~GV)に分類でき、さらに異なる遺伝子クラスターに分けられる。5つのグループのうち4つ(GI、GII、GIV、GV)はヒトに感染することができ、これらの4つのグループは、抗原的に異なるサポウイルスの4つの株、すなわち札幌、ヒューストン、ロンドン、ストックホルムに対応する。[ 10 ] このウイルスには少なくとも21の遺伝子型が存在するが、アメリカ、アジア、ヨーロッパでは新しい遺伝子型が報告され続けている。[ 15 ]
臨床検査診断
核酸検出法 逆転写PCR(RT-PCR )は、反応性、感度、速度、特異性の幅広さから、サポウイルスの検出に最も一般的に使用されているツールです。サポウイルスの多様性のため、RNA依存性RNAポリメラーゼを特異的に標的として増幅するために、数百ものプライマーが設計されています。これを利用して、「サポウイルスを部分的に特徴付け、検出されたサポウイルスの類似性を調査する」ことができます。[ 3 ]
米国の一部の商業臨床検査機関では、複数の病原体を同時に検査するマルチプレックス消化管PCRパネルにサポウイルスを含めています。たとえば、米国最大の臨床検査ネットワークの1つであるLabcorp [ 16 ] は、 PCRベースの便検査の1つであるGastrointestinal Profile, Stool, PCRパネルにサポウイルスを含めています[ 17 ] 。ただし、この検査では特定のサポウイルス遺伝子群または遺伝子型は識別されず、サポウイルス遺伝子群I、II、IV、およびVを区別せずにまとめて検出します[ 18 ] 。
ウイルス粒子の検出 「サポウイルスは、電子顕微鏡下での典型的な「ダビデの星」表面形態によって、他の胃腸炎病原体(例えば、ノロウイルス、ロタウイルス、アストロウイルス、アデノウイルス)と形態学的に区別できます。しかし、これは核酸検出法に比べて感度が低いです。」[ 3 ]
抗原検出方法 酵素結合免疫吸着法(ELISA )は、臨床サンプルからヒトサポウイルスを検出するために使用されてきました。ELISAはヒトサポウイルス抗原の検出に使用できますが、一般的には使用されていません。サポウイルスの多くの株の多様性により、存在する可能性のある広範囲の抗原を検出することが困難です。可能な抗原が非常に多いため、ELISAは核酸検出法ほど正確でも感度も高くありません。[ 3 ]
複製サイクル サポウイルスの正確な複製サイクルはまだ解明されていませんが、他のカリシウイルスと同様の細胞質複製サイクルを持つと考えられています。細胞質複製サイクルは以下のとおりです。
宿主細胞への侵入は、宿主受容体への結合によって達成され、これによりウイルスが宿主細胞内にエンドサイトーシスされる。 ウイルスゲノムRNAの脱殻と細胞質への放出。 VPgはウイルスRNAから除去され、その後、処理されたORF1ポリタンパク質に翻訳されて複製タンパク質が生成される。 複製はウイルス工場で行われる。ゲノムssRNA(+)からdsRNAゲノムが合成される。 dsRNAゲノムは転写/複製され、それによってウイルスmRNA/新しいssRNA(+)ゲノムが生成される。 サブゲノムRNAの翻訳により、カプシドタンパク質とVP2が生成される。 新たなウイルス粒子の組み立てと細胞溶解による放出。[ 13 ]
歴史 電子顕微鏡 を用いて、サポウイルスは1977年にイギリスの下痢便サンプルから初めて発見され、すぐに胃腸炎病原体として知られるようになった。ウイルスはイギリスで初めて発見されたが、「サポウイルス 属のプロトタイプ株は、 1982年に日本の札幌で発生した別のアウトブレイク由来である」[ 3 ]。 サポウイルスの最初の完全なゲノムは、1993年にイギリスのマンチェスター株から解読された。以前は、サポウイルスは「札幌様ウイルス」と呼ばれていたが、2002年にカリシウイルス 科のサポウイルス属のサッポロウイルス種に変更された。「現在、 カリシウイルス 科は、サポウイルス、ノロウイルス、ラゴウイルス、ベシウイルス 、ネボウイルスの5つの確立された属で構成されている」 [ 3 ] 。
アウトブレイク
2013年12月 ニュージーランドのギズボーン病院でサポウイルス感染の陽性結果が1件確認された。職員2名にさらに感染が確認され、患者5名が隔離された。病院職員は、部屋に入る際に個人用保護具を使用するなど予防措置を講じた。[ 9 ]
2007年6月 台北県のある大学の教職員55人がサポウイルス感染症と診断された。
長期介護施設 2002年~2009年「オレゴン州とミネソタ州の公衆衛生局のデータを用いて、研究者らは2002年から2009年の間に発生した2161件の胃腸炎の集団発生を調査した。これらのうち、142件(7%)はノロウイルス陰性であることが判明し、そのうち93件については、サポウイルス、アストロウイルス、アデノウイルス、ロタウイルスなどの他の胃腸ウイルスについてさらに検査を行った。サポウイルスは21件(23%)の集団発生で確認され、そのうち66%は長期療養施設で発生した。これらの症例のほぼ半数は2007年だけで発生した。」研究者らはさらに、長期療養施設で発生したサポウイルスの割合は高かったものの、それはおそらく法的に義務付けられた集団発生報告によるアーティファクトであると説明した。[ 7 ]
関連疾患 ノロウイルス はサポウイルスと最もよく関連しています。ノロウイルスとサポウイルスのゲノムは非常に密接に関連しており、両者の区別はコーディング戦略とリーディングフレームの違いからのみ可能です。ノロウイルスはサポウイルスとともに胃腸炎の最も一般的な原因であり、そのため互いに同じ症状を示します。[ 19 ]
アストロウイルスは 、サポウイルスと同様に、小児や高齢者、特に免疫不全の人に胃腸炎を引き起こします。サポウイルスは2つのORFを持ちますが、アストロウイルスは3つ持っています。アストロウイルスには6つの組換え株もあります。アストロウイルスは細胞質内で複製し、消化管内で容易に増殖します。 [ 10 ]
ロタウイルスは 、ノロウイルス、アストロウイルス、サポウイルスと同様に胃腸炎を引き起こします。しかし、ロタウイルスははるかに致死率が高く、下痢を起こした子供の死亡の37%、世界中で21万5000人の死亡を引き起こしています。 [ 20 ]
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外部リンク ICTVレポート: カリシウイルス科 Viralzone : サポウイルス