| サリセジミニバクテリウム | |
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| 属: | サリセジミニバクテリウム 江ら 2012 [1]
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サリセディミニバクテリウムはバチルス科に属するグラム陽性細菌の属である。 [1] [2] [3]タイプ種はサリセディミニバクテリウム・ハロトレランスである。[1]
Salisediminibacterium beveridgeiとSalisediminibacterium selenitireducensは、以前はBacillus属に属する種であったが、この属は広範な多系統性を示すことが認識されており、最近の系統学的研究により、 Bacillus subtilisとBacillus cereus に近縁の種のみを含むように制限されている。[4] [5]
Salisediminibacteriumという名前は、接頭辞「-salisedimini」(ラテン語の名詞salは「塩」、ラテン語の名詞sedimenは「堆積物」を意味する)と接尾辞「-bacterium」(ラテン語の名詞bacteriumは棒を意味する)に由来している。[5]これらを合わせると、Salisediminibacteriumは「塩の堆積物からできた棒」と訳される。
生化学的特性と分子シグネチャー[5][6]
細胞は胞子を形成しないか、または胞子を形成し、運動性はさまざまです。カタラーゼおよび硝酸塩還元活性はさまざまです。ほとんどの種は好塩性およびアルカリ耐性があり、増殖するには培地に最低 1% (w/v) の NaCl が必要です。S . selenitireducens は、Se(IV)、As(V)、硝酸塩、亜硝酸塩、トリメチルアミンオキシド、フマル酸塩を電子受容体として弱い微好気性増殖および嫌気性呼吸増殖を示します。
Salisediminibacterium種のゲノム配列の解析により、インスリン分解酵素ファミリータンパク質、α-ケト酸脱水素酵素サブユニット β、MBL フォールドメタロヒドロラーゼ、およびエキシヌクレアーゼABC サブユニット UvrA の 4 つの保存されたシグネチャーインデル(CSI) がこの属で特定されました。これらはほとんどの場合、この属のすべてまたはほとんどのメンバーで排他的に共有されています。[5]これらの CSI は、この属を他のバチルス科の属や細菌から識別および区別するための信頼性の高い方法を提供します。
分類
サリセディミニバクテリウムには、2021年5月現在、有効な名前が公表されている種が合計5種含まれています。[1]この分岐パターンは、ゲノム分類データベース(GTDB)でも観察されています。[7]
参考文献
- ^ abcdefg Parte、AC「Salisediminibacterium」。LPSN。
- ^ 「サリセディミニバクテリウム」www.uniprot.org .
- ^ Parker, Charles Thomas; Garrity, George M (2012). Parker, Charles Thomas; Garrity, George M. (編). 「Salisediminibacterium の命名法抄録 Jiang 他 2012 年改訂版。Sultanpuram 他 2015 年改訂版」The NamesforLife Abstracts . doi :10.1601/nm.23320.
- ^ Patel, Sudip; Gupta, Radhey S. (2020-01-01). 「バチルス属の多系統性を解明するための系統ゲノム的および比較ゲノム的枠組み:バチルス属の6つの新属、Peribacillus gen. nov.、Cytobacillus gen. nov.、Mesobacillus gen. nov.、Neobacillus gen. nov.、Metabacillus gen. nov.、およびAlkalihalobacillus gen. novの提案」。International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 70 (1): 406–438. doi : 10.1099/ijsem.0.003775 . ISSN 1466-5026. PMID 31617837.
- ^ abcd Gupta, Radhey S.; Patel, Sudip; Saini, Navneet; Chen, Shu (2020-11-01). 「系統ゲノム学と比較ゲノム解析による、バチルス科の新属として提案された17の異なるバチルス種クレードの確固たる区分:Robertmurraya kyonggiensis sp. nov. の説明、およびバチルス属をSubtilisおよびCereusクレード種のメンバーのみに限定する修正属バチルスの提案」。International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 70 (11): 5753–5798. doi : 10.1099/ijsem.0.004475 . ISSN 1466-5026. PMID 33112222.
- ^ Parker, Charles Thomas; Osier, Nicole Danielle; Garrity, George M (2009). Parker, Charles Thomas; Garrity, George M. (編). 「Caldalkalibacillus の命名法抄録 Xue ら 2006 年改訂。Zhao ら 2008 年改訂」。The NamesforLife Abstracts . doi :10.1601/nm.10093.
- ^ 「GTDB - ツリー」. gtdb.ecogenomic.org . 2021年5月28日閲覧。
さらに読む
- Sultanpuram, VR; Mothe, T; Mohammed, F (2015 年 5 月)。「インドのロナールソーダ湖から分離された Salisediminibacterium haloalkalitolerans sp. nov.、および Bacillus locisalis を Salisediminibacterium locisalis comb. nov. として再分類する提案、および Salisediminibacterium 属および Salisediminibacterium halotolerans 種の修正された説明」。Archives of Microbiology。197 (4): 553–60。Bibcode :2015ArMic.197..553S。doi : 10.1007 / s00203-015-1081-8。PMID 25638045 。
- Jiang, F; Cao, SJ; Li, ZH; Fan, H; Li, HF; Liu, WJ; Yuan, HL (2012 年 9 月)。「ソーダ湖堆積物由来の好塩性細菌 Salisediminibacterium halotolerans gen. nov., sp. nov.」。International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology。62 (Pt 9): 2127–32。doi : 10.1099 /ijs.0.034488-0。PMID 22039006 。
