ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
SUMO4 識別子 エイリアス SUMO4 、IDDM5、SMT3H4、SUMO-4、dJ281H8.4、小型ユビキチン様修飾子4、小型ユビキチン様修飾子4 外部ID オミム :608829; ホモロジーン : 88399; ジーンカード :SUMO4; OMA :SUMO4 - オルソログ RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) トップの表現 卵母細胞 頬粘膜細胞 乳管 幽門 腎髄質 視神経 噴門 咽頭粘膜 舌の上側 大静脈
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
タンパク質タグ
ユビキチン様タンパク質リガーゼ結合
細胞成分 生物学的プロセス 出典:Amigo / QuickGO
ウィキデータ
小型ユビキチン関連修飾子4は、ヒトでは SUMO4 遺伝子 によってコードされる タンパク質 である 。 [3] [4]
関数
この遺伝子はSUMO遺伝子ファミリーのメンバーです。この遺伝子ファミリーは、タンパク質に付着して標的タンパク質の細胞内局在、安定性、または活性を制御する小さなユビキチン関連修飾子をコードします。このレコードに記載されているタンパク質は細胞質にあり、IKBAを特異的に修飾し、IL12B遺伝子のNF-κB依存性転写の負の調節につながります 。 このSUMO遺伝子の特定の多型はM55V置換を引き起こし、I型糖尿病と関連しています。RefSeqにはこの多型が含まれています。 [4]
インタラクション
SUMO4はIκBα と 相互作用する ことが示されている 。 [5]
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000177688 – Ensembl 、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。
^ Bohren KM、Nadkarni V、Song JH、Gabbay KH、Owerbach D (2004 年 6 月)。「新規 SUMO 遺伝子 (SUMO-4) の M55V 多型は、熱ショック転写因子を差別的に活性化し、I 型糖尿病の感受性と関連している」。The Journal of Biological Chemistry。279 ( 26): 27233–8。doi : 10.1074 / jbc.M402273200。PMID 15123604 。
^ ab 「Entrez Gene: mif two 3 homolog 4 (S. cerevisiae) の SUMO4 SMT3 サプレッサー」。
^ Guo D, Li M, Zhang Y, Yang P, Eckenrode S, Hopkins D, Zheng W, Purohit S, Podolsky RH, Muir A, Wang J, Dong Z, Brusko T, Atkinson M, Pozzilli P, Zeidler A, Raffel LJ, Jacob CO, Park Y, Serrano-Rios M, Larrad MT, Zhang Z, Garchon HJ, Bach JF, Rotter JI, She JX, Wang CY (2004 年 8 月)。「新しい I kappa B α 修飾因子である SUMO4 の機能的変異体は 1 型糖尿病と関連している」。Nature Genetics。36 ( 8 ) : 837–41。doi : 10.1038 /ng1391。PMID 15247916。S2CID 41123857。
さらに読む
Wang CY、Podolsky R、She JX (2006 年 10 月) 。 「 SUMO4 が 1 型糖尿病感受性遺伝子であることを裏付ける遺伝的および機能的証拠」。Annals of the New York Academy of Sciences。1079 (1): 257–67。Bibcode : 2006NYASA1079..257W。doi : 10.1196 /annals.1375.039。PMID 17130563。S2CID 20462827。
Davies JL、Kawaguchi Y、Bennett ST、Copeman JB、Cordell HJ、Pritchard LE、Reed PW、Gough SC、Jenkins SC、Palmer SM (1994 年 9 月)。「ヒト 1 型糖尿病感受性遺伝子のゲノム全体にわたる検索」 。Nature。371 ( 6493 ) : 130–6。Bibcode : 1994Natur.371..130D。doi :10.1038/371130a0。PMID 8072542。S2CID 4275341 。
Luo DF、Buzzetti R、Rotter JI、Maclaren NK、Raffel LJ、Nisticò L、Giovannini C、Pozzilli P、Thomson G、She JX (1996 年 5 月)。「インスリン依存性糖尿病に対する 3 つの感受性遺伝子の確認: IDDM4、IDDM5、IDDM8」。 ヒト 分子 遺伝学 。5 (5): 693–8。doi : 10.1093/hmg/ 5.5.693。PMID 8733139 。
Mungall AJ、Palmer SA、Sims SK、Edwards CA、Ashurst JL、Wilming L、Jones MC、Horton R、Hunt SE、Scott CE、Gilbert JG、Clamp ME、Bethel G、Milne S、Ainscough R、Almeida JP、Ambrose KD、Andrews TD、Ashwell RI、Babbage AK、Bagguley CL、Bailey J、Banerjee R、Barker DJ、Barlow KF、Bates K、Beare DM、Beasley H、Beasley O、Bird CP、Blakey S、Bray-Allen S、Brook J、Brown AJ、Brown JY、Burford DC、Burrill W、Burton J、Carder C、Carter NP、Chapman JC、Clark SY、Clark G、Clee CM、Clegg S、Cobley V、Collier RE、Collins JE、Colman LK、Corby NR、Coville GJ、 Culley KM、Dhami P、Davies J、Dunn M、Earthrowl ME、Ellington AE、Evans KA、Faulkner L、Francis MD、Frankish A、Frankland J、French L、Garner P、Garnett J、Ghori MJ、Gilby LM、Gillson CJ、Glithero RJ、Grafham DV、Grant M、Gribble S、Griffiths C、Griffiths M、Hall R、Halls KS、Hammond S、Harley JL、Hart EA、Heath PD、Heathcott R、Holmes SJ、Howden PJ、Howe KL、Howell GR、Huckle E、Humphray SJ、Humphries MD、Hunt AR、Johnson CM、Joy AA、Kay M、Keenan SJ、Kimberley AM、King A、Laird GK、Langford C、Lawlor S、Leongamornlert DA、Leversha M、ロイド CR、ロイド DM、ラブランド JE、ラヴェル J、マーティン S、マシュレギ モハマディ M、マスレン GL、マシューズ L、マッキャン OT、マクラーレン SJ、マクレイ K、マクマレー A、ムーア MJ、マリキン JC、ニブレット D、ニッカーソン T、ノビック KL、オリバー K、オーバートン ラーティ EK、パーカー A、パテル R、ピアス AV、ペック AI、フィリモア B、フィリップス S、プラム RW、ポーター KM、ラムジー Y、ランビー SA、ライス CM、ロス MT、サール SM、セラ HK、シェリダン E、スクセ CD、スミス S、スミス M、スプラゴン L、スクエア SL、スチュワード CA、シカモア N、タムリン ホール G、テスター J、シーカー AJ、トーマス DW、ソープ A、トレーシーA、Tromans A、Tubby B、Wall M、Wallis JM、West AP、White SS、Whitehead SL、Whittaker H、Wild A、Willey DJ、Wilmer TE、Wood JM、Wray PW、Wyatt JC、Young L、Younger RM、Bentley DR、Coulson A、Durbin R、Hubbard T、Sulston JE、Dunham I、Rogers J、Beck S (2003 年 10 月)。「ヒト染色体 6 の DNA 配列と分析」。Nature。425 ( 6960 ) : 805–11。Bibcode :2003Natur.425..805M。doi : 10.1038 / nature02055。PMID 14574404 。
Guo D、Li M、Zhang Y、Yang P、Eckenrode S、Hopkins D、Zheng W、Purohit S、Podolsky RH、Muir A、Wang J、Dong Z、Brusko T、Atkinson M、Pozzilli P、Zeidler A、Raffel LJ、Jacob CO、Park Y、Serrano-Rios M、Larrad MT、Zhang Z、Garchon HJ、Bach JF、Rotter JI、She JX、Wang CY (2004 年 8 月)。「新しい I kappa B α 修飾因子である SUMO4 の機能的変異体は、1 型糖尿病と関連している」。Nature Genetics。36 ( 8 ) : 837–41。doi :10.1038/ng1391。PMID 15247916。S2CID 41123857 。
Smyth DJ、Howson JM、Lowe CE、Walker NM、Lam AC、Nutland S、Hutchings J、Tuomilehto-Wolf E、Tuomilehto J、Guja C、Ionescu-Tîrgoviste C、Undlien DE、Rønningen KS、Savage D、Dunger DB、Twells RC、McArdle WL、Strachan DP、Todd JA (2005 年 2 月)。「SUMO4 M55V 変異体と 1 型糖尿病リスクの関連性の妥当性の評価」。Nature Genetics。37 ( 2 ) : 110–1、著者返信 112–3。doi :10.1038/ng0205-110。PMID 15678134。S2CID 33336557 。
Qu H、Bharaj B、Liu XQ、Curtis JA、Newhook LA、Paterson AD、Hudson TJ、Polychronakos C (2005 年 2 月)。「SUMO4 M55V 変異体と 1 型糖尿病リスクの関連性の妥当性の評価」。Nature Genetics。37 ( 2 ): 111–2、 著者 の 回答 112–3。doi : 10.1038/ng0205-111。PMID 15678135 。
Park Y、Park S、Kang J、Yang S、Kim D (2005 年 2 月)。「SUMO4 M55V 変異体と 1 型糖尿病リスクの関連性の妥当性の評価」。Nature Genetics。37 ( 2 ) : 112、著者の返信 112–3。doi : 10.1038/ ng0205-112a。PMID 15678137。S2CID 30406915 。
Owerbach D、McKay EM、Yeh ET、Gabbay KH、Bohren KM (2005 年 11 月)。「SUMO-4 に特有のプロリン 90 残基が成熟と SUMO 化を阻止する」。 生化学 および生物物理学的研究通信 。337 (2): 517–20。doi :10.1016/ j.bbrc.2005.09.090。PMID 16198310 。
Guo D、Han J、Adam BL、Colburn NH、Wang MH、Dong Z、Eizirik DL、She JX、Wang CY (2005 年 12 月)。「血清飢餓誘発ストレス下における HEK293 細胞における SUMO4 基質のプロテオーム解析」。 生化学 および生物物理学的研究通信 。337 (4): 1308–18。doi :10.1016/ j.bbrc.2005.09.191。PMID 16236267 。
野曽 S、池上 英、藤澤 哲、川端 裕、浅野 和、広峰 裕、鶴丸 正、杉原 信、李 I、川崎 E、粟田 哲、扇原 哲 (2005 年 12 月)。 「SUMO4 M55V バリアントと 1 型糖尿病の感受性との関連における遺伝的不均一性」。 糖尿病 。 54 (12): 3582–6。 土井 : 10.2337/diabetes.54.12.3582 。 PMID 16306380。
鶴丸正人、川崎E、井田英、右田K、森内A、福島K、福島T、阿比留N、山崎H、能曽S、池上H、粟田T、佐々木H、江口K (2006年8月)。 「日本人における一般的な自己免疫遺伝子座としての小さなユビキチン様修飾因子 4 の役割の証拠」。 臨床内分泌学と代謝のジャーナル 。 91 (8): 3138–43。 土井 : 10.1210/jc.2006-0206 。 PMID 16735488。
Costas J、Perez-Pampin E、Ferreiros-Vidal I、Torres M、Phillips C、Vicario JL、Pablos JL、Carracedo A、Gomez-Reino JJ、Gonzalez A (2006 年 6 月)。「SUMO4 および MAP3K7IP2 の一塩基多型と関節リウマチの感受性」。 リウマチ 学ジャーナル 。33 (6): 1048–51。PMID 16755651 。
Sedimbi SK、Shastry A、Park Y、Rumba I、Sanjeevi CB (2006 年 10 月)。「ラトビア人患者における SUMO4 M55V 多型と自己免疫糖尿病の関連性」。Annals of the New York Academy of Sciences。1079 (1): 273–7。Bibcode :2006NYASA1079..273S。doi : 10.1196 /annals.1375.041。PMID 17130565。S2CID 22345614 。
Lin HY、Wang CL、Hsiao PJ、Lu YC、Chen SY 、 Lin KD、Hsin SC、Hsieh MC、Shin SJ (2007 年 4 月)。「SUMO4 M55V 変異体は 2 型糖尿病の糖尿病性腎症と関連している」。 糖尿 病 。56 ( 4): 1177–80。doi : 10.2337/db06-1283。PMID 17229939 。
Sedimbi SK、Kanungo A、Shastry A、Park Y、Sanjeevi CB (2007 年 4 月)。「アジア系インド人患者における自己免疫性糖尿病と SUMO4 M55V の関連性はない」。International Journal of Immunogenetics。34 ( 2 ): 137–42。doi :10.1111/j.1744-313X.2007.00668.x。PMID 17373940。S2CID 10433791 。
Noso S, Fujisawa T, Kawabata Y, Asano K, Hiromine Y, Fukai A, Ogihara T, Ikegami H (2007 年 6 月)。「IDDM5 遺伝子座に位置する小型ユビキチン様修飾因子 4 (SUMO4) 変異体と日本人の 2 型糖尿病との関連性」。 臨床 内分泌 代謝学ジャーナル 。92 (6): 2358–62。doi : 10.1210/ jc.2007-0031。PMID 17374705 。
Bohren KM、 Gabbay KH 、 Owerbach D (2007 年 8 月)。「Co2+ をチャージしたタロン樹脂に結合した His タグ付き組み換え UBC9 を使用したネイティブ SUMO タンパク質のアフィニティークロマトグラフィー」。 タンパク質発現および精製 。54 (2): 289–94。doi :10.1016/j.pep.2007.03.013。PMID 17459725 。