ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| SLITRK5 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | SLITRK5、LRRC11、bA364G4.2、SLIT、NTRK 類似ファミリーメンバー 5 |
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| 外部ID | オミム:609680; MGI : 2679448;ホモロジーン: 9193;ジーンカード:SLITRK5; OMA :SLITRK5 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 14番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 14|14 E4 | 始める | 111,912,529 bp [2] |
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| 終わり | 111,920,573 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 中側頭回
- 正面ポール
- ブロードマン領域23
- 耳下腺
- ブロードマン領域10
- 眼窩前頭皮質
- ブロードマン領域46
- 中心後回
- 上前頭回
- 海馬のI領域
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| | トップの表現 | - 鉤状部
- 一次運動野
- 前扁桃体領域
- 腹内側核
- 梨状皮質
- 乳頭体
- 帯状回
- 顔面運動核
- 上丘
- 嗅結節
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_015567 NM_001384609 NM_001384610 |
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NM_029273 NM_198865 NM_001378768 NM_001378769 NM_001378770 |
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| RefSeq (タンパク質) | | |
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NP_942565 NP_001365697 NP_001365698 NP_001365699 |
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| 場所 (UCSC) | 13 章: 87.67 – 87.7 Mb | 14 章: 111.91 – 111.92 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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SLITおよびNTRK様タンパク質5は、ヒトではSLITRK5遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]
関数
SLITRK5などのSLITRKファミリーのメンバーは、SLITタンパク質(SLIT1を参照; MIM 603742)のものと類似した2つのN末端ロイシンリッチリピート(LRR)ドメインを持つ膜貫通タンパク質です。SLITRK5を含むほとんどのSLITRKは、神経栄養因子受容体と相同性を共有するC末端領域も持っています(NTRK1を参照; MIM 191315)。SLITRKは主に神経組織で発現し、神経突起調節活性を持っています(Aruga et al.、2003)。[OMIM提供] [7]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000165300 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000033214 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Hirosawa M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (1998年12月). 「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。XII. 試験管内で大きなタンパク質をコードする脳由来の100個の新しいcDNAクローンの完全な配列」。DNA研究 。5 ( 6 ): 355–64。doi : 10.1093/dnares/5.6.355。PMID 10048485。
- ^ Aruga J, Yokota N, Mikoshiba K (2003年10月). 「ヒトSLITRKファミリー遺伝子:正常脳および脳腫瘍組織におけるゲノム構成と発現プロファイリング」. Gene . 315 :87–94. doi :10.1016/S0378-1119(03)00715-7. PMID 14557068.
- ^ ab "Entrez Gene: SLITRK5 SLIT および NTRK 類似ファミリー、メンバー 5"。
さらに読む
- Amanchy R、Kalume DE、Iwahori A、Zhong J、Pandey A (2006)。「細胞培養におけるアミノ酸の安定同位体標識 (SILAC) を使用した HeLa 細胞のリン酸化プロテオーム解析」。Journal of Proteome Research。4 ( 5): 1661–71。doi : 10.1021/pr050134h。PMID 16212419 。
- Aruga J、Mikoshiba K (2003 年 9 月)。「神経突起の伸長を制御する新規神経膜貫通タンパク質ファミリー Slitrk の同定と特性評価」。分子細胞神経科学。24 (1): 117–29。doi : 10.1016 /S1044-7431(03) 00129-5。PMID 14550773。S2CID 25473221 。