ホモサピエンスにおける非コードRNA
654780 番地 識別子 エイリアス POMP100PPP1R140PSFSFPQスプライシング因子プロリン/グルタミンリッチ 外部ID GeneCards : [1]; OMA :- オルソログ RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 頬粘膜細胞 精子 乳首 胸腺 迷走神経下神経節 腎髄質 幽門 脳梁 噴門 舌の上側
参照表現データの詳細
バイオGPS
ウィキデータ
プロリンおよびグルタミンに富むスプライシング因子は、ヒトでは SFPQ 遺伝子 によってコードされる タンパク質 である 。 [3] [4]
インタラクション SFPQはPTBP1 、 [3] [5] NONO 、 [6] CDC5L [7] および ユビキチンC [8] と 相互作用する ことが示されている 。
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000250685 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ ab Patton JG、Porro EB、Galceran J、Tempst P、Nadal-Ginard B (1993年3月)。「新規プレmRNAスプライシング因子PSFのクローニングと特性評価」。 遺伝子 と 発達 。7 ( 3):393–406。doi : 10.1101/gad.7.3.393。PMID 8449401 。 ^ 「Entrez Gene: SFPQ スプライシング因子プロリン/グルタミンに富む (ポリピリミジン トラクト結合タンパク質関連)」。 ^ Meissner M、Dechat T、Gerner C、Grimm R、Foisner R、Sauermann G (2000 年 1 月)。「スプライシング因子 PSF および PTB の異なる核局在と核マトリックスとの関連」。Journal of Cellular Biochemistry。76 ( 4 ): 559–66。doi :10.1002/( SICI )1097-4644(20000315)76:4<559::AID-JCB4>3.0.CO;2-U。PMID 10653975。S2CID 25669908 。 ^ Peng R、Dye BT、Pérez I 、Barnard DC、Thompson AB、Patton JG (2002年10月)。「PSFとp54nrbはU5 snRNAの保存されたステムに結合する」 。RNA。8 ( 10 ):1334–47。doi : 10.1017 /S1355838202022070。PMC 1370341。PMID 12403470 。 ^ Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (2000 年 12 月). 「ヒト CDC5L 複合体の機能分析と質量分析によるその成分の同定」. The EMBO Journal . 19 (23): 6569–81. doi :10.1093/emboj/19.23.6569. PMC 305846. PMID 11101529 . ^ シュテルツル U、ヴォルム U、ラロウスキー M、ハーニッヒ C、ブレンベック FH、ゲーラー H、シュトロディッケ M、ツェンクナー M、シェーンヘル A、ケッペン S、ティム J、ミンツラフ S、エイブラハム C、ボック N、キーツマン S、ゲーデ A、トクセズE、ドローゲ A、クロビッチ S、コーン B、バーヒマイヤーW、Lehrach H、Wanker EE (2005 年 9 月)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワーク: プロテオームに注釈を付けるためのリソース」。 セル 。 122 (6): 957–68。 土井 ：10.1016/j.cell.2005.08.029。 hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 。 PMID 16169070。S2CID 8235923 。
さらに読む
Shav-Tal Y, Zipori D (2002 年 11 月). 「PSF と p54(nrb)/NonO - 多機能核タンパク質」. FEBS Letters . 531 (2): 109–14. doi : 10.1016/S0014-5793(02)03447-6 . PMID 12417296. S2CID 12485304. Gower HJ、Moore SE、Dickson G、Elsom VL、Nayak R、Walsh FS (1989 年 4 月)。「24.1D5 モノクローナル抗体で定義された筋芽細胞表面抗原のクローニングと特性評価」。 開発 。105 ( 4 ): 723–31。doi :10.1242/dev.105.4.723。PMID 2480877 。 Gozani O 、Patton JG、Reed R (1994 年 7 月)。「スプライソソーム関連タンパク質の新しいセットと必須スプライシング因子 PSF は、スプライシング反応の触媒ステップ II の前に pre-mRNA に安定的に結合する」。EMBO ジャーナル 。13 ( 14 ): 3356–67。doi :10.1002/ j.1460-2075.1994.tb06638.x。PMC 395233。PMID 8045264 。 Zhang WW、Zhang LX、Busch RK、Farrés J、Busch H (1993 年 2 月)。「HeLa 細胞からの 52 kDa および 100 kDa の DNA 結合ヘテロダイマーの精製と特性評価」。The Biochemical Journal。290 ( 1 ) : 267–72。doi :10.1042/ bj2900267。PMC 1132410。PMID 8439294 。 Clark J、Lu YJ、Sidhar SK、Parker C、Gill S、Smedley D、Hamoudi R、Linehan WM、Shipley J、Cooper CS (1997 年 10 月)。「乳頭状腎細胞癌におけるスプライシング因子遺伝子 PSF および NonO (p54nrb) の TFE3 遺伝子への融合」 。Oncogene。15 ( 18 ) : 2233–9。CiteSeerX 10.1.1.462.8435。doi : 10.1038 / sj.onc.1201394。PMID 9393982 。 Teigelkamp S、Mundt C、Achsel T、Will CL、Lührmann R (1997 年 11 月)。「ヒト U5 snRNP 特異的 100 kD タンパク質は、酵母スプライシング因子 Prp28p と高い相同性を持つ RS ドメイン含有の推定 RNA ヘリカーゼである」 。RNA。3 ( 11 ) : 1313–26。PMC 1369570。PMID 9409622 。 Straub T、Grue P、Uhse A、Lisby M、Knudsen BR、Tange TO、Westergaard O、Boege F (1998 年 10 月)。「RNA スプライシング因子 PSF/p54 は直接相互作用によって DNA トポイソメラーゼ I 活性を制御する」。The Journal of Biological Chemistry。273 ( 41): 26261–4。doi : 10.1074/ jbc.273.41.26261。PMID 9756848 。 Lutz CS、Cooke C、O'Connor JP、Kobayashi R、Alwine JC (1998 年 12 月)。「snRNP フリー U1A (SF-A) 複合体: 最大サブユニットがポリピリミジン トラクト結合タンパク質関連スプライシング因子 PSF であると特定」 。RNA。4 ( 12 ) : 1493–9。doi : 10.1017 /S1355838298981183。PMC 1369720。PMID 9848648 。 Meissner M、Dechat T、Gerner C、Grimm R、Foisner R、Sauermann G (2000 年 1 月)。「スプライシング因子 PSF および PTB の異なる核局在と核マトリックスとの関連」。Journal of Cellular Biochemistry。76 ( 4): 559–66。doi : 10.1002/(SICI)1097-4644(20000315)76:4<559::AID-JCB4>3.0.CO;2- U。PMID 10653975。S2CID 25669908 。 Urban RJ、Bodenburg Y、Kurosky A、Wood TG、Gasic S (2000 年 6 月)。「ポリピリミジン トラクト結合タンパク質関連スプライシング因子は、ブタ p450scc インスリン様成長因子応答エレメントの転写活性の負の調節因子である」。 分子 内分泌 学 。14 (6 ) : 774–82。doi : 10.1210/mend.14.6.0485。PMID 10847580 。 Straub T、Knudsen BR、Boege F (2000年 6 月)。「PSF/p54(nrb) は DNA トポイソメラーゼ I の個別の DNA ヘリックス間の「ジャンプ」を刺激する」。 生化学 。39 ( 25): 7552–8。doi :10.1021/bi992898e。PMID 10858305 。 Akhmedov AT 、 Lopez BS (2000 年 8 月)。「ヒト 100 kDa 相同 DNA ペアリングタンパク質はスプライシング因子 PSF であり、DNA 鎖侵入を促進する」。 核酸 研究 。28 ( 16): 3022–30。doi : 10.1093/nar/28.16.3022。PMC 108454。PMID 10931916 。 de Vries H、Rüegsegger U、Hübner W、Friedlein A、Langen H、Keller W (2000 年 11 月)。「ヒトの pre-mRNA 切断因子 II(m) には酵母タンパク質の相同体が含まれており、他の 2 つの切断因子を橋渡しする」。EMBO Journal。19 ( 21 ) : 5895–904。doi : 10.1093/emboj/19.21.5895。PMC 305781。PMID 11060040 。 Dye BT、Patton JG (2001 年 2 月)。「RNA 認識モチーフ (RRM) は、PTB 関連スプライシング因子 (PSF) の核内スペックルへの局在に必要である」。 実験 細胞研究 。263 (1): 131–44。doi : 10.1006 /excr.2000.5097。PMID 11161712 。 Mathur M、Tucker PW、Samuels HH (2001 年 4 月)。「PSF は、Sin3A と核ホルモン受容体の DNA 結合ドメインを介してその効果を媒介する新しいコリプレッサーです」。 分子 細胞 生物 学 。21 (7): 2298–311。doi :10.1128/ MCB.21.7.2298-2311.2001。PMC 86864。PMID 11259580 。 Shav-Tal Y、Cohen M、Lapter S、Dye B、Patton JG、Vandekerckhove J、Zipori D (2001 年 8 月)。「アポトーシス中の pre-mRNA スプライシング因子 PSF の核再局在化には、過剰リン酸化、抗原エピトープのマスキング、およびタンパク質相互作用の変化が関与している」。Molecular Biology of the Cell . 12 (8): 2328–40. doi :10.1091/mbc.12.8.2328. PMC 58597 . PMID 11514619。 Zhang Z、Carmichael GG (2001 年 8 月)。「核内での dsRNA の運命: p54(nrb) を含む複合体が、無差別に A から I に編集された RNA の核内保持を仲介する」。Cell . 106 ( 4): 465–75. doi : 10.1016/S0092-8674(01)00466-4 . PMID 11525732. S2CID 18799711。 Andersen JS、Lyon CE、Fox AH、Leung AK、Lam YW、Steen H、Mann M、Lamond AI (2002 年 1 月)。「ヒト核小体の指向性プロテオーム解析」。Current Biology . 12 (1): 1–11. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . PMID 11790298. S2CID 14132033. Sewer MB、Nguyen VQ、Huang CJ、Tucker PW、Kagawa N、Waterman MR (2002 年 4 月)。「H295R 副腎皮質細胞におけるヒト CYP17 の転写活性化は、タンパク質関連スプライシング因子 p54(nrb)/NonO と転写抑制にも関与する複合体 SF-1 との複合体形成に依存する」。 内分泌 学 。143 ( 4): 1280–90。doi : 10.1210/ endo.143.4.8748。PMID 11897684 。
