ロイ・R・パーカー

外部ビデオ
ロイ・パーカー、「大学院教育の改善」、iBiology
ロイ・パーカー、「真核生物のmRNAの生涯：局在、翻訳、分解」、iBiology

ロイ・R・パーカーは、1970年代から科学の分野で活躍する生化学者です。現在はコロラド大学ボルダー校の化学・生化学の特別教授および生化学のチェク・ラインヴァント寄付講座教授を務めています。パーカーは生涯を通じて、生化学の研究と調査に多大な知識を貢献してきました。現在は、真核生物におけるさまざまな形態のRNAの生合成、機能、分解に焦点を当てています。パーカーは、 RNAの異常がさまざまな疾患や病理を引き起こす仕組みを研究で解明することを目指しています。 ^[1] 2012年、パーカーは米国科学アカデミー生化学部門に選出されました。^[2]

パーカーはキャリアをスタートさせるため、ペンシルベニア州ピッツバーグのカーネギーメロン大学に入学し、化学の理学士号を取得した。1979年にカーネギーメロン大学を卒業後、 1985年にカリフォルニア大学サンフランシスコ校に進学し、クリスティン・ガスリーの指導の下、遺伝学の博士号を取得した。1985年から1987年まで、パーカーはカリフォルニア大学サンフランシスコ校とカリフォルニア大学サンディエゴ校の両方でポスドク研究員として働いた。[ 3 ]その後、パーカーは1988年から1989年まで、^{マサチューセッツ}州ウースターのマサチューセッツ大学医学部でアラン・ジェイコブソンの指導の下、ポスドク研究員を務めた。[ 4 ^]

パーカーは1989年にアリゾナ大学で研究室を始め、 2012年にコロラド大学ボルダー校の教授に就任するまで分子細胞生物学の教授を務めた。^[4]現在はチェフ・ラインヴァント生化学寄付講座の教授であり、化学および生化学の講座の教授でもある。パーカーはハワード・ヒューズ医学研究所の研究員である（1994年以来）。^[1]

パーカー博士の主な研究対象には、真核生物のRNAの分析と、欠陥のあるタイプのRNAが体内の生化学的メカニズムに与える影響が含まれます。^[1]より技術的には、彼の研究室はRNA分子の調節、それが真核細胞の正常な生理機能に及ぼす影響、および異常なRNA調節が人間の病気にどのように寄与するかを研究しています。彼の研究室では、酵母と哺乳類細胞を使用して、オリゴ(U)とオリゴ(A)のテーリングとディテーリング、RNA生物学におけるタウタンパク質、およびRNAシャペロンを調べています。

重要な研究成果は、パーカーと彼の研究チームが真核生物のmRNAターンオーバーの主要な経路を確立したときに始まりました。これらの経路は、mRNAの分解と脱キャップを引き起こす可能性があります。次に、研究グループは、mRNA分解に寄与する主要なヌクレアーゼと、このイベントを促進する分子を特定しました。これらの促進因子には、脱キャップ酵素、3'から5'への崩壊複合体、およびデアデニラーゼが含まれます。その後数年間、パーカーと同僚は、脱キャップおよび崩壊タンパク質の一部が翻訳抑制因子であると結論付けるのに十分なデータを収集しました。言い換えると、パーカーは、脱キャップと翻訳は、そのメカニズムが互いに反対であるため、ライバルであると考えられると判断しました。最後に、ごく最近、研究グループはいくつかの細胞質mRNP顆粒、特にPボディを発見しました。^[2]

パーカーは科学雑誌に数百の研究論文を発表するほか、全国の学生の教育を支援してきた。彼の講演のいくつかはオンラインで公開されている。これらは大学院教育の改善や「真核生物mRNAの寿命：局在、翻訳、分解」などのトピックに焦点を当てている。これらのビデオ講義は学生や他の科学者を教育するためにオンラインで公開されている。^[4]

パーカーは、これまでの教育とキャリアを通じて、165本のオリジナル論文と77の章と招待レビューを発表してきました。彼の最も引用された出版物と発見のいくつかは次のとおりです。^[3]

「PEP4遺伝子の機能はサッカロミセス・セレビシエにおけるいくつかの液胞加水分解酵素の発現に必要である」 （1982年）パーカーの最初のオリジナル出版物は1982年で、彼は他の2人の科学者、ズベンコとジョーンズと共同で酵母S.セレビシエにおけるPEP4遺伝子の役割を調査しました。^[5]

「酵母における安定および不安定な mRNA の両方のターンオーバー経路: 脱アデニル化の必要性の証拠」 (1993) この調査の目的は、酵母における mRNA ターンオーバーに関与する経路を追跡することでした。そのために、パーカーとデッカーは、新生転写物の分解を分析することにより、4 つの遺伝子で実験を行いました。彼らは、mRNA の脱アデニル化率とオリゴ (A) の安定性の両方と mRNA 半減期の間に関連性があることを発見しました。より具体的には、彼らは RNA 二次構造の影響に注目し、脱アデニル化後、5' 配列のないものが凝集し始めることに気付きました。これらの結果を評価した後、彼らは、脱アデニル化が mRNA の変化に寄与し、mRNA 分解経路を作成するという結論に達しました。^[6]

「真核生物におけるmRNAの分解」（1995年）この研究で、パーカーとビールマンは、mRNAのいくつかのサブタイプの分解のさまざまな経路を調査しました。彼らは、mRNAの分解速度とターンオーバー経路の間に関連があるという証拠を提示しました。この研究で多くの観察と研究から結論を導き出した後、パーカーとビールマンは、核酸分解イベントを制御し、分解経路を促進する遺伝子産物を正確に特定することを望みました。^[7]

「MATalpha1不安定性要素によって促進される酵母のmRNAターンオーバー」（1996年）1996年、パーカーとカポニグロは、MATalpha1不安定性要素の成分を削除し、その影響を観察することで、酵母のmRNAの減衰率を分析しました。^[8]

「酵母mRNAを「ナンセンス含有」と認識すると、mRNAの翻訳とmRNAの分解の両方が阻害される：mRNAの脱キャップの制御への影響」（1999年）この論文では、脱キャップのプロモーターと、プロモーターがmRNAの翻訳と破壊を阻害する仕組みについて検討しました。^[9]

「メッセンジャーRNAの脱キャップと分解は細胞質プロセシング体で起こる」（2003年） 2003年、パーカーとシェスはこの論文で脱アデニル化、脱キャップ、エキソヌクレアーゼ分解に焦点を当てました。彼らは酵母モデルを研究し、P体が細胞内の分解部位であり、mRNA分解の中間体を含むというモデルを提唱しました。この情報から、彼らはmRNAがポリソームとP体の間を移動し、これが細胞質におけるmRNA代謝の重要な側面であると結論付けました。 ^[10]

「スプライス欠陥のあるプレmRNAおよび中間体の細胞質分解」 （2003年）この論文で、ヒレレンとパーカーは、Dbr1p依存性経路における特定の中間体の蓄積は、同じ経路がプレmRNAスプライシングを制御していることを示していることを発見しました。^[11]

「mRNAデキャッピングの活性化因子による一般的な翻訳抑制」（2005年）コラー氏とパーカー氏は、この研究でデキャッピング機構の活性化因子を特に取り上げました。これらのデキャッピング活性化因子は翻訳を阻害し、P体の形成を刺激します。染色技術を使用してデキャッピング活性化因子の活性を特定し、mRNAにデキャッピングのシグナルを送り、mRNAが翻訳されるのを制限するメカニズムが存在するという結論に至りました。^[12]

「真核生物mRNAのポリソームと細胞質処理体間の移動」（2005年）この論文では、パーカーと他の2人の科学者、ブレンゲスとテイシェイラは、mRNAがmRNAパッキングの一形態としてポリソームと細胞質処理体の間を移動することを実証しました。^[13]

「翻訳伸長の停止を伴う真核生物mRNAのエンドヌクレアーゼによる切断」（2006年）ドーマとパーカーは、特殊なタンパク質が停止したmRNAの翻訳を識別し、エンドヌクレアーゼによる切断プロセスを開始できる、ノンストップの分解プロセスを特定しました。^[14]

「P ボディと mRNA の翻訳および分解の制御」（2007 年）この出版物は、真核生物と、翻訳されなかった mRNA の凝集による P ボディの形成に焦点を当てています。P ボディは、母体および神経細胞の mRNA 顆粒にリンクされています。このリンクにより、細胞質 mRNA の活性に関して、P ボディ内のポリソームと mRNA の関係が明らかになりました。パーカーとシェスがこの出版物から得た主な結論は、miRNAや RISC などの mRNA 特異的調節因子が P ボディと関与すると、翻訳が阻害され、分解が促進されるというものです。^[15]

「真核生物のストレス顆粒：翻訳の詳細」（2009年）この出版物の焦点は、翻訳を妨げる身体のストレス反応によるストレス顆粒の形成です。パーカーとバチャンは、ストレス顆粒がRNA、特にmRNAの安定性を低下させ、翻訳を妨げることで多くの問題を引き起こすことを研究しました。彼らは、ストレス顆粒がP体と通信してmRNAの機能にさらに有害な影響を与える可能性があるという結論に達しました。^[16]

「大学院教育におけるスキル開発」（2012年）このユニークな論文は、生化学のプロセスについて議論するのではなく、生化学の分野における適切な教育の影響について探究しています。パーカーは、大学院の学位取得を目指す学生のドロップアウト率の高さを示し、学生が成功するために必要な手順と習得するスキルを分析しています。^[17]

「微生物群集からの二本鎖RNAの分析により二本鎖RNAウイルス様要素が特定される」 （2014年）デッカーとパーカーはこの論文から、二本鎖RNAの調査がウイルスや他の微生物の遺伝学に関する多くの発見につながる可能性があることを示唆した。^[18]

「隣接コドン対とmRNAの安定性の関係」（2017年）2017年、ハリガヤとパーカーは、コドンを介した遺伝子制御における特定の機能を抑制する働きをするコドン対とmRNAの安定性との間に関連があることを発見しました。^[19]

「ストレス顆粒とP体のトランスクリプトーム全体の比較により、翻訳がRNAの分割に大きな役割を果たしていることが明らかになった」（2019年）マセニー、ラオ、パーカーは共同で、翻訳はP体とストレス顆粒の形成において極めて重要なプロセスであり、ストレス時には抑制されることが多いことを明らかにした。^[20]

パーカーは以下のような多くの栄誉と賞を受賞している。^[3]

• 2018年、コロラド大学ボルダー校名誉教授^[21]
• 2018年、イリノイ大学アーバナ校におけるアダ・ドワシー生化学講義^[22]
• 2018年、カリフォルニア州ラホヤで開催されたIonis/Nature RNA生物学会議の基調講演者^[23]
• 2018年、マックスプランク生化学研究所特別講演シリーズ、ドイツ^[24]
• 2018年、ミシガン大学RNAバイオメディカルセンターシンポジウム基調講演者^[25]
• 2018年、第3回国際ブレーンストーミングシンポジウム基調講演者、フロリダ大学^[3]
• 2017年、SFBシンポジウム基調講演者、レーゲンスブルク^[3]
• 2017年、第2回ストレス顆粒国際シンポジウム基調講演者、ハイデルベルク^[3]
• 2017年、カリフォルニア州デュアルテのシティ・オブ・ホープ基調講演者^[3]
• 2017年、EMBOカンファレンス基調講演者、イタリア、バルガ^[26]
• 2012年、米国科学アカデミー会員^[3]
• 2012年、FASEB基調講演者^[3]
• 2011年、EMBL基調講演者^[3]
• 2010年、アメリカ芸術科学アカデミー会員^[3]
• 2010年、RNA協会会長^[3]
• 2006年、コールド・スプリング・ハーバー研究所翻訳制御会議基調講演者^[3]
• 2005年、ドイツ、ハイデルベルクにおける翻訳および制御会議基調講演者^[3]
• 2005年、スイスのEMBOワークショップ基調講演者^[3]
• 2005年、時間内に研究を延長する方法（MERIT）、国立衛生研究所^[3]
• 2003年、アリゾナ大学ガリレオフェロー^[27]
• 2003年、アリゾナ大学理事教授^[3]
• 2002年、FASEB転写後制御会議基調講演者^[3]
• 2000年、ミシガンRNAカンファレンス基調講演者^[3]
• 1994年、ハワード・ヒューズ医学研究所研究員^[3]
• 1990年、サール・スカラーズ奨学生^[28]
• 1979年、カリフォルニア大学サンフランシスコ校、リージェンツフェローシップ^[3]