リボヌクレアーゼT1

リボヌクレアーゼ_T1
リボヌクレアーゼT1
	アスペルギルス・オリザエ由来のリボヌクレアーゼT1 。 [
識別子
シンボル	rntA
ＰＤＢ	1YGW
ユニプロット	P00651
その他のデータ
EC番号	4.6.1.24
構造
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構造	スイスモデル
ドメイン	インタープロ

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国立情報学研究所	タンパク質

リボヌクレアーゼ_T1
リボヌクレアーゼT1
識別子
EC番号	4.6.1.24
CAS番号	9026-12-4
データベース
インテンズ	IntEnzビュー
ブレンダ	BRENDAエントリー
エクスパス	NiceZyme ビュー
ケッグ	KEGGエントリー
メタサイク	代謝経路
プリアモス	プロフィール
PDB構造	RCSB PDB PDBe PDBsum
遺伝子オントロジー	アミゴー / クイックゴー
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リボヌクレアーゼ T ₁ ( EC 4.6.1.24、グアニルリボヌクレアーゼ、Aspergillus oryzae リボヌクレアーゼ、RNase N1、RNase N2、リボヌクレアーゼ N3、リボヌクレアーゼ U1、リボヌクレアーゼ F1、リボヌクレアーゼ Ch、リボヌクレアーゼ PP1、リボヌクレアーゼ SA、RNase F1、リボヌクレアーゼ C2、ビナーゼ、RNase Sa、グアニル特異的 RNase、RNase G、RNase T ₁、リボヌクレアーゼグアニンヌクレオチド-2'-トランスフェラーゼ (環化)、リボヌクレアーゼ N3、リボヌクレアーゼ N1 ) は、一本鎖RNA をグアニン残基の後で切断する真菌エンドヌクレアーゼです。 RNase T _1はグアニンに特異性があるため、変性RNAを分解してシークエンシングを行う際によく使用されます。バーナーゼやRNase Aなどの他のリボヌクレアーゼと同様に、リボヌクレアーゼT 1_は折り畳み研究によく使用されています。^[2]

構造的には、リボヌクレアーゼ T _{1 は}、長いアルファヘリックス(ほぼ 5 回転)を覆う4 本鎖の反平行ベータシートを持つ小さな α+β タンパク質 (104アミノ酸) です。RNase T ₁には、Cys2-Cys10 と Cys6-Cys103 の 2 つのジスルフィド結合があり、後者はフォールディングの安定性に大きく貢献します。^[3]通常、両方のジスルフィドが完全に還元されるとタンパク質は展開しますが、高塩濃度でフォールディングを回復できます。^[4]

RNase T _1にも4つのプロリンがあり、そのうち2つ（Pro39とPro55）はX-Proペプチド結合のシス異性体を持っています。これらのプロリンの非天然異性体は、構造的折り畳みを劇的に遅らせる可能性があり、^[5] 10℃、pH 5で7,000秒（約2時間）という特徴的な時間スケールで折り畳まれます。^[6]

参考文献

^ PDB : 1ygw ; Pfeiffer S, Karimi-Nejad Y, Rüterjans H (1997). 「可変ターゲット関数計算を使用したNMR構造決定の限界：リボヌクレアーゼT ₁のケーススタディ」。Journal of Molecular Biology . 266 (2): 400–423. doi :10.1006/jmbi.1996.0784. PMID 9047372.
^ Pace CN、Heinemann U、 Hahn U、Saenger W (1991)。「リボヌクレアーゼT1 _：構造、機能、安定性」。Angewandte Chemie。30（4）：343–360。doi ：10.1002/anie.199103433。
^ Pace CN、Grimsley GR、Thomson JA 、 Barnett BJ (1988)。「0、1、2個の無傷のジスルフィド結合を持つリボヌクレアーゼT1の構造安定性と活性」。Journal of Biological Chemistry。263 ( 24): 11820–11825。doi : 10.1016 /S0021-9258(18)37859-1。PMID 2457027 。
^ 大畑正之、高橋誠、大井孝文 (1979)。「リボヌクレアーゼT1の構造安定性。II _.塩誘導再生」。生化学ジャーナル。86 :65–70。
^ Mayr LM、Odefey CO、Schutkowski M、 Schmid FX (1996)。「ストップトフロー二重混合法によるリボヌクレアーゼT1の展開と再折り畳みの速度論的解析」。_生化学。35 ( 17 ) : 5550–5561。doi :10.1021/bi953035y。PMID 8611546。
^ Mullins LS、Pace CN 、 Raushel FM (1997)。「水素 -重水素交換法によるリボヌクレアーゼT1の構造安定性の測定」。タンパク質科学。6 (7):1387–1395。doi :10.1002/pro.5560060702。PMC 2143755。PMID 9232639。

外部リンク

米国国立医学図書館医学件名標目表(MeSH)のリボヌクレアーゼ + T1

[pmid9047372-1] PDB : 1ygw ; Pfeiffer S, Karimi-Nejad Y, Rüterjans H (1997). 「可変ターゲット関数計算を使用したNMR構造決定の限界：リボヌクレアーゼT ₁のケーススタディ」。Journal of Molecular Biology . 266 (2): 400–423. doi :10.1006/jmbi.1996.0784. PMID 9047372.

[2] ^ Pace CN、Heinemann U、 Hahn U、Saenger W (1991)。「リボヌクレアーゼT1 _：構造、機能、安定性」。Angewandte Chemie。30（4）：343–360。doi ：10.1002/anie.199103433。

[3] ^ Pace CN、Grimsley GR、Thomson JA 、 Barnett BJ (1988)。「0、1、2個の無傷のジスルフィド結合を持つリボヌクレアーゼT1の構造安定性と活性」。Journal of Biological Chemistry。263 ( 24): 11820–11825。doi : 10.1016 /S0021-9258(18)37859-1。PMID 2457027 。

[4] 大畑正之、高橋誠、大井孝文 (1979)。「リボヌクレアーゼT1の構造安定性。II _.塩誘導再生」。生化学ジャーナル。86 :65–70。

[5] ^ Mayr LM、Odefey CO、Schutkowski M、 Schmid FX (1996)。「ストップトフロー二重混合法によるリボヌクレアーゼT1の展開と再折り畳みの速度論的解析」。_生化学。35 ( 17 ) : 5550–5561。doi :10.1021/bi953035y。PMID 8611546。

[6] ^ Mullins LS、Pace CN 、 Raushel FM (1997)。「水素 -重水素交換法によるリボヌクレアーゼT1の構造安定性の測定」。タンパク質科学。6 (7):1387–1395。doi :10.1002/pro.5560060702。PMC 2143755。PMID 9232639。