リゾビウム・リゾゲネス

リゾビウム・リゾゲネス
科学的分類
ドメイン：	細菌
門:	シュードモナドタ
クラス：	アルファプロテオバクテリア
注文：	ヒポミクロバイオレ
家族：	根粒菌科
属:	リゾビウム
種：	ロドプシス・リゾゲネス
二名法名
	リゾビウム・リゾゲネス; （ライカーら1930）ヤングら2001 [
同義語
	アグロバクテリウム・リゾゲネス (Riker et al . 1930) Conn 1942; Agrobacterium rhizogenes (Riker et al . 1930) Conn 1942 (Approved Lists 1980) を修正。澤田他1993年;

Rhizobium rhizogenes（旧称Agrobacterium rhizogenes）は、双子葉植物に毛状根病を引き起こすグラム陰性土壌細菌。R . rhizogenesは、感染部位に増殖性の多分岐不定根、いわゆる「毛状根」の形成を誘導する。^[3]また、虫こぶも誘導する。^[4]^{: 39}

根圏では、植物は土壌病原体やその他の原因により傷を受けることがある。これにより、アセトシリンゴンなどのフェノール化合物が分泌され、細菌を引き寄せる走化性作用を持つ。このような状況下では、特定の細菌遺伝子が活性化され、その根誘導プラスミド（Riプラスミド）からT-DNAが傷を通して植物に移される。試験管内または自然条件下での統合および発現後、毛状根表現型が観察され、典型的には完全には地向性ではない根系の過剰発達や、葉がある場合は葉の形態変化（しわ）が含まれる。^[5]R. rhizogenesは種子伝染病原体としても増殖する。^[4]^{: 39}

細菌の遺伝子は植物内に保持される可能性があり^[6]、例えばサツマイモは同属の他の植物には存在しないA. rhizogenes遺伝子を保持し、活発に発現している^{[7] 。}

毛状根は、真菌や線虫などの他の病原体と土壌との相互作用を研究するために、バイオリアクターで試験管内で栽培されます。この技術は、特に他の手段では十分な量を栽培することが難しい薬用植物に関して、植物が分泌することが知られている特定の代謝化合物の商業生産にもつながりました。^{[8]根の培養は}遺伝子工学にも使用されます。^[9]^[10]

参考文献

^ ヤングの論文は、リゾビウムをアグロバクテリウムの全てを包含するより包括的な視点から改名したが、これはまた、2001年のデータに基づく分子レベルでの系統発生上の矛盾の多くを解決している。GTDBはこのタイプ株の割り当てに同意しており、アグロバクテリウムを包含しなくても一貫性があるとしている。しかし、GTDBは、この種として誤って分類された可能性のあるゲノムを含む4つの余分な種レベルのクラスターを作成している。^[2]

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[3] ヤングの論文は、リゾビウムをアグロバクテリウムの全てを包含するより包括的な視点から改名したが、これはまた、2001年のデータに基づく分子レベルでの系統発生上の矛盾の多くを解決している。GTDBはこのタイプ株の割り当てに同意しており、アグロバクテリウムを包含しなくても一貫性があるとしている。しかし、GTDBは、この種として誤って分類された可能性のあるゲノムを含む4つの余分な種レベルのクラスターを作成している。^[2]

[1] Young, JM; Kuykendall, LD; Martínez-Romero, E; Kerr, A; Sawada, H (2001). 「Rhizobium Frank 1889 の改訂版。属の説明を修正し、Agrobacterium Conn 1942 および Allorhizobium undicola de Lajudie et al. 1998 の全種を新しい組み合わせとして含めた：Rhizobium radiobacter、R. rhizogenes、R. rubi、R. undicola、および R. vitis」。International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 51 (Pt 1): 89–103. doi : 10.1099/00207713-51-1-89 . PMID 11211278.

[2] 「GTDB - GCF_000696095.1 (リリース 214)」. gtdb.ecogenomic.org .

[4] Chilton, Mary-Dell; Tepfer, David A.; Petit, Annik; David, Chantal; Casse-Delbart, Francine; Tempé, Jacques (1982). 「Agrobacterium rhizogenes は宿主植物の根細胞のゲノムに T-DNA を挿入する」。Nature . 295 ( 5848): 432–434. Bibcode :1982Natur.295..432C. doi :10.1038/295432a0. ISSN 1476-4687.

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[6] Cardarelli, M.; Mariotti, D.; Pomponi, M.; Spanò, L.; Capone, I.; Costantino, P. (1987). 「毛状根表現型を誘導できる Agrobacterium rhizogenes T-DNA 遺伝子」. Molecular and General Genetics MGG . 209 (3): 475–480. doi :10.1007/BF00331152. ISSN 1432-1874. PMID 17193709.

[7] ^ Intrieri, Maria Carmela; Buiatti, Marcello (2001年7 月)。「 Agrobacterium rhizogenes遺伝子の水平伝播とNicotiana属の進化」。分子系統学と進化。20 (1): 100–110。Bibcode :2001MolPE..20..100I。doi :10.1006/mpev.2001.0927。PMID 11421651 。

[kyndt-8] Kyndt, Tina; Quispea, Dora; Zhaic, Hong; Jarretd, Robert; Ghislainb, Marc; Liuc, Qingchang; Gheysena, Godelieve; Kreuzeb, Jan F. (2015年4月20日). 「栽培サツマイモのゲノムには発現遺伝子を持つアグロバクテリウムT-DNAが含まれる: 自然に遺伝子組み換えされた食用作物の例」。米国科学アカデミー紀要。112 ( 18): 5844–5849。Bibcode :2015PNAS..112.5844K。doi : 10.1073 / pnas.1419685112。PMC 4426443。PMID 25902487。

[Shanks-9] Shanks, Jacqueline V.; Morgan, John (1999年4月)。「植物の毛根培養」。Current Opinion in Biotechnology 10 ( 2): 151–155. doi :10.1016/S0958-1669(99)80026-3. PMID 10209145。

[10] 大谷元康;みー・まさひろ；半田隆志;鎌田洋島田多喜子（1993）。「アグロバクテリウム・リゾゲネスによるサツマイモ（Ipomoea butatas (L.) Lam.）植物の形質転換」。植物科学。94 (1): 151–159。書誌コード:1993PlnSc..94..151O。土井：10.1016/0168-9452(93)90016-S。ISSN 0168-9452。

[11] ヴァン・デ・ヴェルデ、ウィレム;マーゲイ、ヨアヒム。ホルスター、マルセル。ゴルマクティグ、ソフィー (2003 年 12 月)。「アグロバクテリウム・リゾゲネスを介したセスバニア・ロストラタの形質転換」。植物科学。165 (6): 1281–1288。書誌コード:2003PlnSc.165.1281V。土井：10.1016/S0168-9452(03)00339-X。ISSN 0168-9452。