| イデオウイルス | |
|---|---|
| ウイルスの分類 | |
| (ランク外): | ウイルス |
| 領域: | リボウイルス |
| 王国: | オルタナウイルス科 |
| 門: | キトリノビリコタ |
| クラス: | アルスビリセテス |
| 注文: | マルテリウイルス目 |
| 家族: | マヨウイルス科 |
| 属: | イデオウイルス |
イデオウイルスはプラス鎖ssRNAウイルスの属で、ラズベリーブッシードワーフウイルス(RBDV)とプリベットイデオウイルスの2種が含まれます。 [1] [2] RBDVには2つの宿主依存系統があり、1つはラズベリー用、もう1つはブドウ用です。 [3]感染は農業にとって大きな負担となり、作物の収量と品質を低下させます。 [4] RBDVはラズベリー葉斑ウイルスと相乗関係にあり、共感染すると感染植物のウイルス粒子の濃度が大幅に高まります。 [5]このウイルスはRBDVに感染した花粉粒による受粉によって伝染し、最初に柱頭に感染してから全身感染を引き起こします。 [6]
ウイルス学
RBDVはエンベロープを持たず、直径約33ナノメートルの等尺性タンパク質コートを持っています。 [7]タンパク質コートの内側にはウイルスゲノムがあり、RNA-1とRNA-2と呼ばれるRNA鎖で構成された2つの部分から構成されています。RNA-1は5,449ヌクレオチドの長さで、メチルトランスフェラーゼ、ヘリカーゼ、およびRNA依存性RNAポリメラーゼドメインを持つ複合タンパク質をコードする1つのオープンリーディングフレーム(ORF)を含んでいます。[1] [8] [9] RNA-2は2,231ヌクレオチドの長さで、5'末端と3'末端に1つずつ、合計2つのORFを含んでいます。[9] [10]最初のORFは細胞間移動タンパク質をコードし、2番目のORFはサブゲノムRNA鎖として発現されます。[7] [10]この鎖RNA-3は946ヌクレオチドの長さで、コートタンパク質をコードしています。[11] RNA-3が存在しないか十分に損傷している場合は感染が起こらないことが示されている。[7]
ライフサイクル
ウイルスの複製は細胞質内で行われる。宿主細胞への侵入は宿主細胞への侵入によって達成される。複製はプラス鎖RNAウイルス複製モデルに従う。プラス鎖RNAウイルス転写が転写の手段である。ウイルスは管誘導ウイルス運動によって宿主細胞から出る。植物が自然宿主となる。感染経路は花粉に関連する。[12]
診断
RBDVを検出するために、一段階逆転写ポリメラーゼ連鎖反応が開発されている。[5] [13]ウイルスはPCRマイクロウェル内の抗体によって濃縮され、続いてウイルス粒子が溶解され、その後ウイルスRNAが逆転写される。 [13]逆転写酵素とDNAポリメラーゼをプロセス全体に含めることで、手順を一段階で実行できる。[13]これらの検査は、ウイルスの特定の株を識別するのに十分な感度がある。[5]
処理
RBDVは、感染した新芽にまず温熱療法、次に凍結療法を施す手順で、感染した植物から根絶することができます。[14] [15]感染した植物に熱を加えると、感染した細胞内の液胞が拡大し、これらの細胞はその後の凍結療法で死滅します。[15]凍結療法後にFe-エチレンジアミン四酢酸またはFe-エチレンジアミンジ(o)ヒドロキシフェニル酢酸を添加すると、植物の新芽の再生が促進され、クロロシスの発生を防ぐことができます。 [ 14]この方法を使用すると、約80%の新芽が最初の温熱療法を生き延び、33%が凍結療法を生き延びて再生に成功します。[14]
参考文献
- ^ ab Ziegler, A; Natsuaki, T; Mayo, MA; Jolly, CA; Murant, AF (1992). 「ラズベリーブッシードワーフウイルスのRNA-1のヌクレオチド配列」. The Journal of General Virology . 73 (12): 3213–8. doi : 10.1099/0022-1317-73-12-3213 . PMID 1469359.
- ^ 「ウイルス分類:2020年リリース」。国際ウイルス分類委員会(ICTV) 。 2021年7月5日閲覧。
- ^ Valasevich , N ; Kukharchyk, N; Kvarnheden, A (2011). 「スウェーデンとベラルーシのラズベリーブッシードワーフウイルス分離株の分子特性」。Archives of Virology。156 (3): 369–74。doi : 10.1007 /s00705-010-0912-9。PMID 21253783。S2CID 43135450。
- ^ Malowicki, SM; Martin, R; Qian, MC (2008). 「ラズベリーブッシードワーフウイルス耐性トランスジェニックラズベリーと野生型「ミーカー」(rubus idaeus L.)の糖、酸、揮発性成分の比較」農業食品化学ジャーナル。56 (15): 6648–55。doi :10.1021/jf800253e。PMID 18598047 。
- ^ abc Quito-Avila, DF; Martin, RR (2012). 「ラズベリーブッシードワーフウイルス、ラズベリーリーフモットルウイルスの検出と混合感染における相乗的相互作用の特徴づけのためのリアルタイムRT-PCR」。Journal of Virological Methods。179 ( 1): 38–44。doi :10.1016/j.jviromet.2011.09.016。PMID 21968094。
- ^ 磯貝 正之; 吉田 剛志; 中野渡 千恵子; 吉川 暢 (2014). 「ラズベリーブッシードワーフウイルスが蓄積した花粉管の柱頭への侵入は、母体組織への初期感染と水平伝播に関与している」.ウイルス学. 452–453: 247–53. doi : 10.1016/j.virol.2014.02.001 . PMID 24606702.
- ^ abc MacFarlane, SA; McGavin, WJ (2009). 「ラズベリーブッシードワーフウイルスコートタンパク質によるゲノム活性化」. Journal of General Virology . 90 (Pt 3): 747–53. doi : 10.1099/vir.0.007195-0 . PMID 19218221.
- ^ Ziegler, A; Mayo, MA; Murant, AF (1993). 「二分ゲノムのラズベリーブッシードワーフイデオウイルスの提案された分類、およびブロモウイルス科の三分ゲノムウイルス」。Archives of Virology . 131 (3–4): 483–8. doi : 10.1007/bf01378649 . PMID 8347087. S2CID 31922799.
- ^ ab Quito-Avila, DF; Ibarra, MA; Alvarez, R; Peralta, EL; Martin, RR (2014). 「エクアドル産 Rubus glaucus 由来のラズベリーブッシードワーフウイルス分離株には、RNA-2 の再配列である追加の RNA が含まれています」。Archives of Virology . 159 (9): 2519–21. doi :10.1007/s00705-014-2069-4. PMID 24719196. S2CID 18080015.
- ^ ab Natsuaki, T; Mayo, MA; Jolly, CA; Murant, AF (1991). 「ラズベリーブッシードワーフウイルスRNA-2のヌクレオチド配列:二分ゲノムの二シストロン性成分」。The Journal of General Virology。72 ( 9): 2183–9。doi : 10.1099/0022-1317-72-9-2183。PMID 1895055。
- ^ Mayo, MA; Jolly, CA; Murant, AF; Raschke, JH (1991). 「ラズベリーブッシードワーフウイルスRNA-3のヌクレオチド配列」. The Journal of General Virology . 72 (2): 469–72. doi : 10.1099/0022-1317-72-2-469 . PMID 1993886.
- ^ 「Viral Zone」 ExPASy . 2015年6月15日閲覧。
- ^ abc Kokko, HI; Kivineva, M; Kärenlampi, SO (1996). 「ラズベリーブッシードワーフウイルスの検出におけるシングルステップ免疫捕捉RT-PCR」. BioTechniques . 20 (5): 842–6. doi : 10.2144/96205st03 . PMID 8723929.
- ^ abc Wang, Q; Valkonen, JP (2009). 「ラズベリー(Rubus idaeus L.)の試験管内栽培ストックシュートの温熱療法後の凍結療法処理シュート先端の回復の改善」Cryo Letters 30 ( 3): 170–82. PMID 19750241.
- ^ ab Wang, Q; Cuellar, WJ; Rajamäki, ML; Hirata, Y; Valkonen, JP (2008). 「効率的なウイルス根絶のための温熱療法と凍結療法の併用:シュート先端におけるウイルス分布、細胞内変化、細胞生存、ウイルスRNA分解の関係」分子植物病理学。9 (2): 237–50。doi :10.1111/ j.1364-3703.2007.00456.x。PMC 6640318。PMID 18705855 。
外部リンク
- ウイルスゾーン: イデオウイルス
- ICTV の
