パルスネット

PulseNetは、米国疾病予防管理センター（CDC）が運営するネットワークで、米国全土の公衆衛生と食品規制当局の研究所を結集しています。^[1]このネットワークを通じて、協力グループは、大腸菌（O157:H7および非O157）、サルモネラ菌、赤痢菌、リステリア菌、カンピロバクター菌、コレラ菌、腸炎ビブリオ菌などの菌株を区別するための指紋として機能する次世代シーケンシング（NGS）の結果を共有できます。このようにして、感染症の発生と闘う取り組みが強化されます。具体的には、結果を共有することで、大規模な発生を特定しやすくなります。たとえば、大腸菌の発生が国内の離れた2つの地域で発生した場合、PulseNetは2つの地域間のつながりを証明するのに役立つ可能性があります。このような場合、病原体は両方の場所で同じ遺伝子指紋を持つことになります。

1996年の設立以来、Pulsenet USAは成功を収めており、カナダ（2000年）、アジア太平洋（2002年）、ヨーロッパ（2003年） ^[2] 、ラテンアメリカ（2003年）^[3] 、中東（2006年）など、国際的に同様のネットワークが設立されました。これらのネットワークは、PulseNet Internationalの傘下で連携しています。^[4] PulseNetの参加者は、データベースのメンテナンス、TIFF画像の正規化、分析およびパターン比較にBioNumericsソフトウェアスイートを使用しています。 ^[5]

PulseNet International の目的は、世界中の公衆衛生研究所と提携し、食品媒介病原体の分子監視能力を構築することにより、国際的な発生の検出と調査を容易にするために、世界レベルで食品媒介疾患の分子監視を実行することです。

さらに、参加者は、ネットワークで使用される国際的に標準化されたサブタイプ分類方法の開発、検証、実装に協力し、食中毒病原体のさまざまなクローンの地理的分布と拡散に関する共同研究を実施します。

参照

参考文献

^ 「PulseNet」。米国疾病予防管理センター。2021年10月。
^ “パルスネットヨーロッパ”.パルスネットヨーロッパ。
^ 「PulseNet Latin America」。PulseNet Latin America (スペイン語)。2008年2月24日時点のオリジナルよりアーカイブ。2008年3月13日閲覧。{{cite web}}: CS1 メンテナンス: 不適切 URL (リンク)
^ “パルスネット・インターナショナル”.パルスネットインターナショナル。
^ Hunter SB、Vauterin P、Lambert-Fair MA、Van Duyne MS、Kubota K、Graves L、Wrigley D、Barrett T、Ribot E (2005)。「PulseNet 標準化パルスフィールドゲル電気泳動プロトコルで使用するためのユニバーサルサイズ標準株の確立: 全国データベースを新しいサイズ標準に変換する」。J . Clin. Microbiol . 43 (3): 1045–1050. doi :10.1128/JCM.43.3.1045-1050.2005. PMC 1081233. PMID 15750058 。

[1] 「PulseNet」。米国疾病予防管理センター。2021年10月。

[2] “パルスネットヨーロッパ”.パルスネットヨーロッパ。

[3] 「PulseNet Latin America」。PulseNet Latin America (スペイン語)。2008年2月24日時点のオリジナルよりアーカイブ。2008年3月13日閲覧。{{cite web}}: CS1 メンテナンス: 不適切 URL (リンク)

[4] “パルスネット・インターナショナル”.パルスネットインターナショナル。

[5] Hunter SB、Vauterin P、Lambert-Fair MA、Van Duyne MS、Kubota K、Graves L、Wrigley D、Barrett T、Ribot E (2005)。「PulseNet 標準化パルスフィールドゲル電気泳動プロトコルで使用するためのユニバーサルサイズ標準株の確立: 全国データベースを新しいサイズ標準に変換する」。J . Clin. Microbiol . 43 (3): 1045–1050. doi :10.1128/JCM.43.3.1045-1050.2005. PMC 1081233. PMID 15750058 。