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擬似キナーゼは、生命界のあらゆるキノームに存在するタンパク質キナーゼの触媒欠損擬似酵素[1]変異体である。擬似キナーゼは、生理学的（シグナル伝達）機能と病態生理学的機能の両方を有する。[2] [3] [4] [5] [6] [7] [8]
歴史
擬似キナーゼという用語は2002年に初めて造られました。[9]その後、それらは異なる「クラス」に細分化されました。[10] [8] [11] [12] [13]ヒトキノームには、キナーゼとユビキチンE3リガーゼシグナル伝達のインターフェースにあるトリブル擬似キナーゼなど、いくつかの擬似キナーゼを含むファミリーが見つかります。[14] [15] [16]
ヒト擬似キナーゼ（およびその擬似ホスファターゼ類似体）は、さまざまな疾患に関与していることが示されており[17] [18] 、潜在的な薬剤ターゲットおよび抗ターゲットとなっている。[19] [20] [21] [22]擬似キナーゼは、真核生物タンパク質キナーゼ（ePK）とePKに関連しない擬似酵素タンパク質（例えば、 ATPに結合し[23] 、α-Cヘリックス内で保存されたグルタミン酸からグルタミンへのスワップによる擬似キナーゼであるFAM20A ）。 [24] FAM20Aは歯周病に関与しており、ゴルジ体で分泌されるタンパク質（ [25]牛乳タンパク質カゼインなど）のリン酸化を制御する重要な生理学的カゼインキナーゼであるFAM20Cの触媒活性を制御する働きをする。
包括的な進化解析により、擬似キナーゼは複数のサブファミリーに分類されることが確認されており、これらは原核生物、古細菌、および注釈付きプロテオームを持つすべての真核生物系統を含む、生命界全体の生物の注釈付きキノームに含まれています。このデータはProKino（http://vulcan.cs.uga.edu/prokino/about/browser）で検索できます。[26]
参照
参考文献
- ^ Murphy JM、Farhan H、 Eyers PA (2017年4 月)。「バイオゾンビ: 生物学における疑似酵素の台頭」。生化学協会誌。45 (2): 537–544。doi :10.1042/BST20160400。PMID 28408493 。
- ^ Jacobsen AV、 Murphy JM (2017年6 月)。「キナーゼの秘密の生活: 擬似キナーゼからの非触媒シグナル伝達機能に関する洞察」。 生化学協会トランザクション。45 (3): 665–681。doi : 10.1042/BST20160331。PMID 28620028。
- ^ Murphy JM、Zhang Q、Young SN、Reese ML、Bailey FP、Eyers PA、Ungureanu D、Hammaren H、Silvennoinen O、Varghese LN、Chen K、Tripaydonis A、Jura N、Fukuda K、Qin J、Nimchuk Z、Mudgett MB、Elowe S、Gee CL、Liu L、Daly RJ、Manning G、Babon JJ、Lucet IS (2014 年 1 月)。「ヌクレオチド結合特性に基づいて擬似キナーゼをサブ分類するための堅牢な方法論」。The Biochemical Journal。457 ( 2 ): 323–34。doi : 10.1042 / BJ20131174。PMC 5679212。PMID 24107129。
- ^ Kannan N, Taylor SS (2008年4月). 「疑似キナーゼの再考」. Cell . 133 (2): 204–5. doi :10.1016/j.cell.2008.04.005. PMC 6226312. PMID 18423189 .
- ^ Mukherjee K, Sharma M, Urlaub H, Bourenkov GP, Jahn R, Südhof TC, Wahl MC (2008 年 4 月). 「CASK は Mg2+ 非依存性ニューレキシンキナーゼとして機能する」. Cell . 133 (2): 328–39. doi :10.1016/j.cell.2008.02.036. PMC 3640377. PMID 18423203 .
- ^ Bailey FP、Byrne DP、Oruganty K、Eyers CE、Novotny CJ、Shokat KM、Kannan N、Eyers PA (2015 年 4 月)。「Tribbles 2 (TRB2) 擬似キナーゼは ATP に結合し、金属非依存的に自己リン酸化します」。The Biochemical Journal。467 ( 1 ) : 47–62。doi : 10.1042 /BJ20141441。PMC 4844368。PMID 25583260。
- ^ Shi F, Telesco SE, Liu Y, Radhakrishnan R, Lemmon MA (2010 年 4 月). 「ErbB3/HER3 細胞内ドメインは ATP に結合し、自己リン酸化を触媒する能力がある」.米国科学アカデミー紀要. 107 (17): 7692–7. Bibcode :2010PNAS..107.7692S. doi : 10.1073/pnas.1002753107 . PMC 2867849. PMID 20351256 .
- ^ ab Zeqiraj E, Filippi BM, Deak M, Alessi DR, van Aalten DM (2009年12月). 「LKB1-STRAD-MO25複合体の構造はキナーゼ活性化のアロステリック機構を明らかにする」. Science . 326 (5960): 1707–11. Bibcode :2009Sci...326.1707Z. doi :10.1126/science.11 78377. PMC 3518268. PMID 19892943 .
- ^ Manning G 、Whyte DB、Martinez R、Hunter T 、Sudarsanam S (2002 年 12 月)。「ヒトゲノムのタンパク質キナーゼ補完」。Science。298 ( 5600): 1912–34。Bibcode : 2002Sci ... 298.1912M。doi :10.1126/science.1075762。PMID 12471243。S2CID 26554314。
- ^ Boudeau J、Miranda-Saavedra D、Barton GJ、Alessi DR (2006 年 9 月)。「擬似キナーゼの新たな役割」。Trends in Cell Biology 16 ( 9): 443–52。doi : 10.1016 /j.tcb.2006.07.003。PMID 16879967 。
- ^ Zeqiraj E、van Aalten DM (2010 年 12 月)。「擬似キナーゼ - 進化の名残か、それとも重要なアロステリック調節因子か?」Current Opinion in Structural Biology 20 ( 6): 772–81. doi :10.1016/j.sbi.2010.10.001. PMC 3014569 . PMID 21074407.
- ^ Scheeff ED、Eswaran J、Bunkoczi G、Knapp S、Manning G (2009 年 1 月)。「擬似キナーゼ VRK3 の構造は、分解された触媒部位、高度に保存されたキナーゼフォールド、および推定される調節結合部位を明らかにする」。構造 。17 ( 1 ): 128–38。doi :10.1016/ j.str.2008.10.018。PMC 2639636。PMID 19141289。
- ^ Eyers PA、Murphy JM (2013 年8 月)。「死者の夜明け: タンパク質擬似キナーゼが細胞生物学の新たな冒険を告げる」。生化学協会誌。41 (4): 969–74。doi : 10.1042 /BST20130115。PMID 23863165 。
- ^ Eyers PA、Keeshan K、 Kannan N (2017 年 4 月)。「21 世紀のトリブル: 生物学と疾患におけるトリブル擬似キナーゼの進化する役割」。Trends in Cell Biology。27 (4): 284–298。doi :10.1016/ j.tcb.2016.11.002。PMC 5382568。PMID 27908682。
- ^ Foulkes DM、Byrne DP、Yeung W、Shrestha S、Bailey FP、Ferries S、Eyers CE、Keeshan K、Wells C、Drewry DH、Zuercher WJ、Kannan N、Eyers PA（2018年9月）。「EGFRファミリータンパク質キナーゼの共有結合阻害剤は、がん細胞におけるヒトTribbles 2（TRIB2）擬似キナーゼの分解を誘導する」。Science Signaling。11 （549）： eaat7951。doi ：10.1126 / scisignal.aat7951。PMC 6553640。PMID 30254057。
- ^ Jamieson SA、Ruan Z、Burgess AE、Curry JR、McMillan HD、Brewster JL、Dunbier AK、Axtman AD、Kannan N、Mace PD（2018年9月）。「基質結合は擬似キナーゼTRIB1の自己阻害をアロステリックに緩和する」。Science Signaling。11 （ 549 ）： eaau0597。doi ：10.1126 / scisignal.aau0597。PMC 6553639。PMID 30254053。
- ^ Reiterer V、Eyers PA、Farhan H (2014 年 9 月)。「死者の日: 生理学と疾患における擬似キナーゼと擬似ホスファターゼ」。Trends in Cell Biology 24 ( 9): 489–505. doi :10.1016/j.tcb.2014.03.008. PMID 24818526。
- ^ Chen MJ、 Dixon JE、Manning G (2017年4 月)。「タンパク質ホスファターゼのゲノミクスと進化」。Science Signaling。10 ( 474): eaag1796。doi : 10.1126 /scisignal.aag1796。PMID 28400531。S2CID 41041971。
- ^ Byrne DP、 Foulkes DM 、 Eyers PA（2017年1月）。「擬似キナーゼ：その機能と新薬ターゲットとしての評価の最新情報」Future Medicinal Chemistry。9（2）：245–265。doi ： 10.4155/ fmc -2016-0207。PMID 28097887。
- ^ Bailey FP、 Byrne DP 、McSkimming D、Kannan N、 Eyers PA（2015年1月）。「Going for broke：ヒト癌擬似キノームを標的とする」。生化学ジャーナル。465 （2）：195–211。doi ：10.1042/BJ20141060。PMID 25559089。
- ^ Cowan-Jacob SW、Jahnke W、 Knapp S (2014 年 4 月)。「キナーゼを標的とする新しいアプローチ: アロステリック阻害、アロステリック活性化、擬似キナーゼ」。Future Medicinal Chemistry。6 ( 5 ): 541–61。doi :10.4155/fmc.13.216。PMID 24649957。
- ^ Foulkes DM、Byrne DP、Bailey FP、Eyers PA（2015年10月）。「トリブル擬似キナーゼ：化学生物学と創薬の新たなターゲット？」生化学協会誌。43 （5）：1095–103。doi ： 10.1042 /BST20150109。PMID 26517930 。
- ^ Cui J、Zhu Q、Zhang H 、Cianfrocco MA、 Leschziner AE、Dixon JE、Xiao J (2017 年 4 月)。「Fam20A の構造は、ユニークなジスルフィドパターンと反転した ATP 結合を特徴とする擬似キナーゼを明らかにする」 。eLife。6。doi : 10.7554 / eLife.23990。PMC 5413348。PMID 28432788。
- ^ Cui J、Xiao J、Tagliabracci VS、Wen J、Rahdar M、Dixon JE (2015 年 3 月)。「分泌キナーゼ複合体が細胞外タンパク質のリン酸化を制御する」。eLife . 4 : e06120. doi : 10.7554/eLife.06120 . PMC 4421793 . PMID 25789606。
- ^ Tagliabracci VS、Wiley SE、Guo X、Kinch LN、Durrant E、Wen J、Xiao J、Cui J、Nguyen KB、Engel JL、Coon JJ、Grishin N、Pinna LA、Pagliarini DJ、Dixon JE (2015 年 6 月)。 「単一のキナーゼが分泌されたリンプロテオームの大部分を生成する」。セル。161 (7): 1619–32。土井：10.1016/j.cell.2015.05.028。PMC 4963185。PMID 26091039。
- ^ Kwon A、Scott S、Taujale R、Yeung W、Kochut KJ、Eyers PA、Kannan N (2019年4月)。「生命の樹全体にわたる擬似キナーゼの起源と進化の追跡」。Science Signaling。12 ( 578 ) : eaav3810。doi : 10.1126/scisignal.aav3810。PMC 6997932。PMID 31015289。
さらに読む
外部リンク
- 「パトリック・アイアーズ教授 - リバプール大学キノームアッセイおよびスクリーニング施設」Liverpool.ac.uk 。 2017年1月16日閲覧。
- 「Kinome の詳細と KinBase へのアクセス」 。2017年 1 月 16 日閲覧。
- 「キナーゼ部位の保全を分析するための Prokino ソフトウェア」 。2017年 1 月 16 日閲覧。
- 「ヒト擬似キノームwiki」。2017年1月16日閲覧。