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| プロサー1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 識別子 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| エイリアス | 2810046L04Rik9330161F11プロリンとセリンが豊富 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | HomoloGene : 13463; GeneCards : [1]; OMA :- オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| ウィキデータ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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PROSER1はヒトではPROSER1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[2]
命名法
PROSER1にはC13orf23、KIAA2032、プロリンおよびセリンリッチタンパク質1など、いくつかの別名があります。[3] [4]
遺伝子
位置
PROSER1 は、 13 番染色体のマイナス (逆) 鎖の13q13.3 に位置します。pter から 39,009,865 塩基対まで、pter から 39,038,095 bp まで広がり、サイズは 28,231 塩基です。[5] PROSER1 は、5,185 bp の一次スプライスされていない転写 mRNA に合計 13 のエクソンを持っています。PROSER1 には 2 つのアイソフォームがあり、どちらも 5,000 bp の範囲内にあります。[6]
ジーン地区
STOML3遺伝子とNHLRC3遺伝子は13番染色体上のPROSER1遺伝子に隣接している。[7]
組織分布
PROSER1発現の発現配列タグマッピングは、リンパ、胎児組織、胸腺、子宮部位で特に高い発現を示すことを示している。精巣、喉頭、神経、血液、脂肪組織部位では中程度の発現を示す。[8] ヒトタンパク質アトラスによると、PROSER1は一般的な細胞質発現を示し、すべてのRNA組織カテゴリで発現している。[9]
相同性
パラログ
PROSER1には相同遺伝子は存在しない。[10]
オルソログ
PROSER1は哺乳類の間で高度に保存されています。魚類、鳥類、一部の無脊椎動物でも発見されていますが、それほど高度に保存されているわけではありません。細菌、植物、真菌では発現していません。[11]以下はNCBIからまとめた相同遺伝子の表です。
タンパク質
一般的なプロパティ
翻訳されたPROSER1タンパク質は944アミノ酸長で、その予測分子量は95.7kdalである。[12] PROSER1の等電点は9である。 [13]核に局在すると予測されている。[14]
構成
この配列はプロリンとセリンが豊富であり、他のアミノ酸が特に少ないわけではありません。
ドメイン
PROSER1には、pfam14771の一部であるDUF 4476という機能不明のドメインが1つ含まれています。DUFはアミノ酸26番から121番までの範囲にわたります。[2] DUF 4476の分子量は11.1 kdalです。
二次構造
PROSER1は主にαヘリックス、βシート、コイルから構成されています。タンパク質は大部分がコイル状になっています。DUFは主にαヘリックスとコイルから構成されています。タンパク質全体と比較すると、βシートの数はわずかに少なくなっています。[15]
参考文献
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「GeneCards」。ヒト遺伝子データベース。
- ^ 「BioCompare」. BioCompare.
- ^ 「Ensembl」. Ensembl.
- ^ 「GeneCards」。ヒト遺伝子データベース。
- ^ 「NCBI遺伝子」。NCBI。
- ^ 「NCBI遺伝子」。NCBI。
- ^ 「Uniprot」. Uniprot.
- ^ 「組織アトラス」。ヒトタンパク質アトラス。
- ^ 「Ensembl」. Ensembl.
- ^ 「Ensembl」. Ensembl.
- ^ 「Uniprot」. Uniprot.
- ^ 「Expasy」. Expasy.
- ^ 「PSORT II 予測」。PSORT II。
- ^ 「SDSC 生物学ワークベンチ」。SDSC。