アウトロン

アウトロンは、遺伝子の一次転写産物の5'末端にあるヌクレオチド配列であり、最終的なRNA産物の成熟中に特殊な形態のRNAスプライシングによって除去される。 ^[1]イントロン配列は遺伝子の内側に位置するが、アウトロン配列は遺伝子の外側に位置する。^[2]

特徴

アウトロンは、G + C含有量^[3]やトランススプライシングのシグナルとなるスプライスアクセプター部位などの類似した特性を持つイントロンのような配列です。^[4]^[5]このようなトランススプライス部位は、基本的に上流のドナー（5'）スプライス部位のないアクセプター（3'）スプライス部位として定義されます。

ユーグレノゾア、渦鞭毛藻類、海綿動物、線虫、刺胞動物、有櫛動物、扁形動物、甲殻類、毛顎動物、ワムシ類、ホヤ類などの真核生物では、スプライスリーダー（SL）アウトロンの長さは30～102ヌクレオチド（nt）の範囲であり、SLエクソンの長さは16～51 ntの範囲であり、完全なSL RNAの長さは46～141 ntの範囲である。^[3]

処理

標準的なシススプライシングでは、上流位置のドナースプライス部位は、同じプレRNA分子の下流位置にあるアクセプター部位とともに必要である。対照的に、SLトランススプライシングは、アウトロン上の3'アクセプタースプライス部位と、別のRNA分子であるSL RNA上に位置する5'ドナースプライス部位（GUジヌクレオチド）に依存する。^[3] さらに、未熟mRNAのアウトロンには、分岐点アデノシン（その後に下流ポリピリミジン領域が続く）が含まれており、これがSL RNAのイントロン様部分と相互作用して、イントロンスプライシング中に形成されるラッソ構造を彷彿とさせる「Y」分岐副産物を形成する。次に、核機構がSL RNA配列をプレmRNAの3'トランススプライスアクセプター部位（AGジヌクレオチド）にトランススプライシングすることにより、この「Y」分岐構造を解決します。 ^[2]

アウトロンが処理されると、SLエクソンはポリシストロニックプレmRNAの各オープンリーディングフレームに隣接する、異なる対になっていない下流アクセプター部位にトランススプライスされ、異なる成熟したキャップ付き転写産物が生成されます。 ^[6]^[7]^[8]

参照

エクソン – 最終的な機能的なmRNA分子に存在する転写された遺伝子の領域
メッセンジャーRNA – リボソームによって読み取られてタンパク質を生成するRNA

参考文献

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[4] 「オックスフォードリファレンス - Outron」。2019年9月26日閲覧。

[5] 「MISO シーケンスオントロジーブラウザ — Outron (SO:0001475)」。2019年9月26日閲覧。

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