ポリピリミジン管

必須のスプライソソーム構成要素 U2AF は短いポリピリミジン RNA 断片に結合しました。

ポリピリミジン領域は、転写後修飾の過程でRNAスプライシングを行うために特化したタンパク質複合体であるスプライソソームの組み立てを促進するプレメッセンジャーRNA （mRNA）の領域です。この領域はピリミジンヌクレオチド、特にウラシルが豊富で、通常15～20塩基対の長さで、スプライシングされるイントロンの3'末端の約5～40塩基対前に位置しています。^[1]

ポリピリミジントラクトには、スプライソソーム成分 U2AF や、選択的スプライシングの調節的役割を果たすポリピリミジントラクト結合タンパク質(PTB) など、多数のタンパク質因子が結合または会合する。PTB の主な機能はエクソンサイレンシングであり、これにより、成熟 mRNA に通常スプライシングされる特定のエクソン領域が省略され、 mRNA がコードするタンパク質のアイソフォームが発現する。PTB は多くの高等真核生物で普遍的に発現するため、スプライスサイトが明確に定義されていない「弱い」エクソンの組み込みを抑制すると考えられている。^[2] しかし、PTB 結合だけでは「強力な」エクソンの抑制には不十分である。^[3]

エクソンの抑制または選択は、組織特異的なアイソフォームの適切な発現に重要です。例えば、平滑筋と骨格筋は、 αトロポミオシンの相互排他的エクソン選択によって区別される代替アイソフォームを発現します。^[4]

参考文献

^ Lodish H, Berk A, Matsudaira P, Kaiser CA, Krieger M, Scott MP, Zipursky SL, Darnell J. (2004).分子細胞生物学. WH Freeman: ニューヨーク、NY. 第5版.
^ Wagner EJ、Garcia-Blanco MA. (2001)。ポリピリミジントラクト結合タンパク質がエクソン定義に拮抗する。Mol Cell Biol 21(10):3281-3288。
^ Gooding C、Roberts GC、Smith CW. (1998)。制御されたαトロポミオシンエクソンの抑制における阻害性ピリミジン要素とポリピリミジントラクト結合タンパク質の役割。RNA 4 :85-100。
^ Gooding C, Roberts GC, Moreau G, Nadal-Ginard B, Smith CW. (1994). 強いデフォルトエクソンの特異的阻害による、平滑筋特異的なαトロポミオシン相互排他的エクソン選択の切り替え。EMBO J 13(16):3861-72。

[Lodish-1] Lodish H, Berk A, Matsudaira P, Kaiser CA, Krieger M, Scott MP, Zipursky SL, Darnell J. (2004).分子細胞生物学. WH Freeman: ニューヨーク、NY. 第5版.

[Wagner-2] Wagner EJ、Garcia-Blanco MA. (2001)。ポリピリミジントラクト結合タンパク質がエクソン定義に拮抗する。Mol Cell Biol 21(10):3281-3288。

[Gooding-3] Gooding C、Roberts GC、Smith CW. (1998)。制御されたαトロポミオシンエクソンの抑制における阻害性ピリミジン要素とポリピリミジントラクト結合タンパク質の役割。RNA 4 :85-100。

[Gooding2-4] Gooding C, Roberts GC, Moreau G, Nadal-Ginard B, Smith CW. (1994). 強いデフォルトエクソンの特異的阻害による、平滑筋特異的なαトロポミオシン相互排他的エクソン選択の切り替え。EMBO J 13(16):3861-72。