オープンソースの創薬

オープンソース創薬（OSDD）は、インド科学産業研究会議（CSIR）が主導するチームインディアコンソーシアムで、世界中から参加しています^{[1] [2] [3] [4] [5]}研究ベースの製薬企業からあまり注目されていないリーシュマニア症などの顧みられない熱帯病に対する共同創薬プラットフォームを提供しています。 ^{[1] [5] [6] [7] [8]} このプログラムには、研究者、学界、学生、産業界、教育機関など、130か国から7500人を超える参加者がいるグローバルコミュニティがあります。^{[7] [9]}オープンソースモードでの顧みられない病気の治療薬の発見に取り組んでいる人なら誰でもプログラムに参加できます。^[10] OSDDは、熱帯感染症に対する手頃な価格の薬の発見と開発に焦点を当てるために、多様なバックグラウンドを持つ専門家を集めて機能します。

CSIR-OSDDは2008年9月に開始されました。^{[9] [11]}このプロジェクトは、CSIR-ゲノム統合生物学研究所の創設所長であるサミール・K・ブラマチャリ教授によって、CSIRの第11次5カ年計画プロジェクトとして考案されました。 ^[12]これはインド政府によって承認され、総支出額は4億5,960万ルピー（約1,200万ドル）でした。^[13] プロジェクトのモットーは「すべての人に手頃な医療を」であり、オープンソースの哲学、クラウドソーシングの概念、共同研究モデルを活用し、^[14] Webベースのツールを活用してイノベーションを促進し、新しい治療法を発見します。^{[13] [15]}コミュニティによって生成されたすべてのデータとリソースは、この目的のために特別に設計されたSysborg 2.0と呼ばれるWebベースのポータルを通じて公開されています。 ^{[5] [16] [17]}

このプロジェクトは、特許とオープンソース研究のポリシーを組み合わせたヘルスケアモデルを採用しており、知的財産の制限なしに新薬をジェネリック医薬品として利用できるようにし、^[18]手頃な価格とアクセス性を確保することを目指しています。^{[1] [5] [19]}

最初の活動は結核菌（Mycobacterium tuberculosis）に対する治療薬の開発でした。^[20]このプロジェクトは2つのフェーズに分かれています。

1. フェーズ I (2008 ～ 2012 年) では、新薬の発見と開発が行われます。
2. フェーズII（2012～2017年）では臨床試験が行われます。

OSDDは、参加機関がウェブサイトのコンテンツに簡単に貢献したり、変更したりできるように、Wikiモデルに基づいたウェブポータルのセットアップから始まりました。アップロードされた情報は、ピアレビューを受けることができます。開発中の新薬はパブリックドメインになります。ジェネリック医薬品は製薬会社によって採用され、適正な価格で商品化されます。^[21]

創薬プロセスは10の作業パッケージに分かれており、^[21]

1. WP1 - 薬物ターゲットの特定。潜在的な薬物ターゲットを特定するためのシステム生物学研究を含む計算活動を促進します。オープンソースに強い関心を持つ学界、機関、業界の参加を促します。
2. WP2 - ターゲットの表現。これには、潜在的な薬物ターゲットに関する実験結果の共有とアッセイの開発が含まれます。
3. WP3 - スクリーン開発。これは、さまざまなターゲット用に開発された特定のアッセイを使用して、大規模な化合物ライブラリをスクリーニングすることを伴います。
4. WP4 - インシリコ ドッキング。これには、最大の効力と最小の毒性が達成されるように、類似体の合成のためのヒット化合物上のターゲットと潜在的なサイトの特定が含まれます。
5. WP5 - 最適な阻害剤を使用したヒト細胞および組織のマイクロアレイ遺伝子発現。これには、宿主細胞の発現プロファイルを変更することなく、ターゲットに対してより高い結合親和性を持つ化合物の特定が含まれます。
6. WP6 - 医薬品化学。これには改良された化合物の合成が含まれます。
7. WP7 - リード最適化。これは、宿主に影響を与えずに望ましい効果を持つリード化合物を生成することです。
8. WP8 - ヒト細胞タンパク質結合を調べるためのプロテオミクスベースのリードアフィニティーカラム
9. WP9 - リード化合物の前臨床毒性
10. WP10 - 新規分子化合物の臨床開発

作業パッケージ 1 ～ 8 はフェーズ I に含まれ、WP9 と 10 はフェーズ II に含まれます。

OSDDは共同プロジェクトであり、CSIRの一部門である。CSIR元事務局長のサミール・K・ブラフマチャリ教授は、オープンソース創薬プロジェクトの「主任メンター」である。ギャン・ビンドゥ・アカデミー会長のM・ヴィジャヤン、インド医学研究評議会（ICMR）事務局長のVM・カトック、ICMR元事務局長のNK・ガングリがメンターである。個々のプロジェクトは参加団体によって取り上げられ、主任研究員によって管理される。^[21]これらのプロジェクトは、CSIRのOSDDプロジェクトディレクターであるサララ・バラチャンドラン博士によって集中的に監督されている。

OSDDの資金の中心はインド政府です。2008年9月から2012年3月まで、インド政府はこのプロジェクトに4億5960万ルピー（約1200万ドル）を割り当てていました。^[22]この資金は、科学プロジェクトへの資金提供、インフラの設置、プロジェクトの継続的な活動のサポートに使用されます。^[23] 2012年まで、OSDDはCSIRの「国立研究所計画」に基づくプロジェクトでした。2013年から2017年の第12次5カ年計画では、計画委員会がCSIRのオープンイノベーション計画の一環としてOSDDの継続を承認しました。

OSDDには世界各地から7,500人の登録参加者が参加しています。約110の研究プロジェクトが実施されています。共同研究により、M. tuberculosisの潜在的な薬物ターゲットが60以上特定されました。調査中のターゲットは7つあります。コンソーシアムの最初の国際出版物は、2009年にM. tuberculosisの統合ゲノミクスマップに関するものでした。^[24]それ以来、10を超える研究が発表されています。^[25] OSDDは現在、OSDD化学アウトリーチプログラム（OSDDChem）を運営しています。このシステムでは、学生が合成化学のトレーニングを受け、OSDDChemセンターの大学、研究所、カレッジで合成された化合物がOSDDChemデータベースに送信され、CSIR-CDRIに送信されます。これらの分子はその後、抗結核および抗マラリア活性についてCSIR-CDRIでスクリーニングされます。^{[26] [27]}

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