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| OmpA ファミリー | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 トルブ/パル複合体の結晶構造 | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
| シンボル | オムパ | ||||||||
| パム | PF00691 | ||||||||
| インタープロ | IPR006665 | ||||||||
| プロサイト | PDOC00819 | ||||||||
| SCOP2 | 1r1m / スコープ / SUPFAM | ||||||||
| TCDB | 1.B.6 | ||||||||
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分子生物学において、OmpAドメインは、ポリン様膜貫通 タンパク質（ ompAなど）、小さな脂質アンカータンパク質（palなど）、MotBプロトンチャネルなど、多くのグラム陰性細菌外膜タンパク質のC末端領域に見られる、ベータ/アルファ/ベータ/アルファ-ベータ(2)構造を持つ保存されたタンパク質ドメインです。[ 1 ] [ 2] [3] [4]これらのタンパク質のN末端半分は可変ですが、このグループのタンパク質の一部はN末端にOmpA様膜貫通ドメインを持っています。大腸菌由来のOmpAは病原性に必要であり、宿主受容体分子と相互作用することができます。[5] MotB（およびMotA）は大腸菌内で2つの機能を果たしており、MotA（4）-MotB（2）複合体はMotBを介して細胞壁に付着して鞭毛モーターの固定子を形成し、MotA-MotB複合体は細胞膜を横切るイオンの流れを回転子の動きに結合します。[4]
参照
参考文献
- ^ Bouveret E、Benedetti H、Rigal A、Loret E、Lazdunski C (1999 年 10 月)。「ペプチドグリカン関連リポタンパク質 (PAL)-ペプチドグリカンおよび PAL-TolB 相互作用の in vitro 特性評価」。J . Bacteriol . 181 (20): 6306–11. doi :10.1128/JB.181.20.6306-6311.1999. PMC 103764. PMID 10515919 。
- ^ De Mot R、Proost P、Van Damme J、Vanderleyden J (1992 年 2 月)。 「シュードモナス・フルオレセンスOE 28.3の根付着因子と緑膿菌および緑膿菌のポリン Fの相同性」。モル。ジュネット将軍。231 (3): 489–93。土井：10.1007/BF00292721。PMID 1538702。S2CID 7518948 。
- ^ Freudl R、Klose M、Henning U (1990 年 6 月)。「 大腸菌外膜タンパク質 OmpAのエクスポートとソート」。J . Bioenerg. Biomembr . 22 (3): 441–9. doi :10.1007/BF00763176. PMID 2202726. S2CID 22623025.
- ^ ab Hosking ER、Vogt C、Bakker EP、Manson MD (2006 年 12 月)。「大腸菌MotAB プロトン チャネルのプラグが外れた」。J . Mol. Biol . 364 (5): 921–37. doi :10.1016/j.jmb.2006.09.035. PMID 17052729。
- ^ Selvaraj SK、Periandythevar P 、Prasadarao NV (2007 年 4 月)。「大腸菌 K1 の外膜タンパク質 A は、脳微小血管内皮細胞における細胞間接着分子 1 の発現を選択的に促進する」。Microbes Infect。9 ( 5 ) : 547–57。doi :10.1016/ j.micinf.2007.01.020。PMC 1993839。PMID 17368067 。