OLE RNA

OLE RNA（Ornate Large Extremophilic RNA）は、特定の細菌に存在する保存されたRNA構造です。^[¹^] このRNAは平均して約610ヌクレオチドの長さです。OLE RNAよりも長いことが知られているRNAは、グループIIイントロンやリボソームRNAなどのリボザイムのみです。OLE RNAの並外れた長さと高度に保存された構造から、OLE RNAはリボザイムである、あるいは複雑な生化学的タスクを実行する可能性があるという仮説が立てられました。

OLE RNAは主にクロストリジウム目に属する細菌に多く見られますが、他の種類のバチルス属細菌にもOLE RNAが含まれています。OLE RNAを含む生物は、主に極限環境微生物や嫌気性生物です。

OLE RNAはRNAとして転写され、Bacillus haloduransでの実験では、他の10個の遺伝子とともに mRNAとして転写されることが示されている。OLE RNAを含むほとんどの種では、隣接する遺伝子はOLE RNAの近傍で保存されているが、Desulfitobacterium hafnienseでは染色体の別の場所に位置している。OLE RNAは、より大きな転写産物から、保存された約610ヌクレオチドの構造にほぼ対応するより短いRNAに処理される。機能不明のタンパク質クラスをコードする遺伝子は、通常OLE RNAのすぐ下流に位置しており、このタンパク質クラスの存在は、OLE RNAの存在と種内で相関している。この相関は、RNAとタンパク質の間に機能的な関連性がある可能性を示唆している。

X線構造解析により、バチルス・ハロデュランス中のOapBタンパク質を特異的に認識するのに役立つ重要な要素が明らかになった。^{[ 2 ]}

参考文献

↑ Puerta-Fernandez E、Barrick JE 、 Roth A 、Breaker RR (2006 年 12 月)。「極限環境細菌における大型非コード RNA の同定」。米国科学アカデミー紀要。103 ( 51 ): 19490–19495。Bibcode : 2006PNAS..10319490P。doi : 10.1073/ pnas.0607493103。PMC 1748253。PMID 17164334。
↑ Yang, Yang; Harris, Kimberly A.; Widner, Danielle L.; Breaker, Ronald R. (2021-03-02). "細菌OapBタンパク質とそのOLE RNA標的の構造はOLEリボヌクレオタンパク質複合体の構造に関する知見をもたらす" . Proceedings of the National Academy of Sciences . 118 (9) e2020393118. Bibcode : 2021PNAS..11820393Y . doi : 10.1073/pnas.2020393118 . ISSN 0027-8424 . PMC 7936274 . PMID 33619097 .

外部リンク

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[1] Puerta-Fernandez E、Barrick JE 、 Roth A 、Breaker RR (2006 年 12 月)。「極限環境細菌における大型非コード RNA の同定」。米国科学アカデミー紀要。103 ( 51 ): 19490–19495。Bibcode : 2006PNAS..10319490P。doi : 10.1073/ pnas.0607493103。PMC 1748253。PMID 17164334。

[2] Yang, Yang; Harris, Kimberly A.; Widner, Danielle L.; Breaker, Ronald R. (2021-03-02). "細菌OapBタンパク質とそのOLE RNA標的の構造はOLEリボヌクレオタンパク質複合体の構造に関する知見をもたらす" . Proceedings of the National Academy of Sciences . 118 (9) e2020393118. Bibcode : 2021PNAS..11820393Y . doi : 10.1073/pnas.2020393118 . ISSN 0027-8424 . PMC 7936274 . PMID 33619097 .

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