メタノカルドコッカス・ヤナシイ

メタノカルドコッカス・ヤナシイ
科学的分類
ドメイン：	古細菌
王国：	ユーリアキオータ
門:	ユーリアキオータ
クラス：	メタノコッカス
注文：	メタノコッカス
家族：	メタノカルドコッカス科
属:	メタノカルドコッカス
種：	M. ヤナシイ
二名法名
	メタノカルドコッカス・ヤナシイ;
同義語
	メタノコッカス・ジャナシイ（ジョーンズ 1983）;

メタノカルドコッカス・ジャンナスキイ（旧称メタノコッカス・ジャンナスキイ）は、メタノコッカス綱に属する好熱性メタン生成古細菌である。ゲノム全体が解読された最初の古細菌であり、3番目にゲノムが解読された生物である。^[1]解読により、古細菌に特有の遺伝子が多数特定された。メタン生成補因子の合成経路の多くは、この生物において生化学的に解明されており、^[2]他の古細菌特有の代謝経路もいくつか解明されている。

歴史

メタノカルドコッカス・ジャンナスキイは、ウッズホール海洋研究所の海底熱水噴出孔から分離されました。^[3]この熱水噴出孔は、メキシコ西海岸近くの東太平洋海膨の深さ 2600 メートルに位置していました。表面物質は「ホワイトスモーカー」煙突で収集され、48 - 94 °C のこの極端な生息地にメタノカルドコッカス・ジャンナスキイが生息している証拠が明らかになりました。多くの種類の極限環境微生物と同様に、M. ジャンナスキイは高温、高圧、中程度の塩分濃度に適応する能力を持っています。^[4]

シーケンシング

メタノカルドコッカス・ジャンナスキイは、 TIGRのクレイグ・ベンター率いるグループ^[5]によって全ゲノムショットガンシーケンシング法を用いて配列決定された。M . ジャンナスキイは、ゲノムが配列決定された最初の古細菌である。ベンターによれば、ゲノムのユニークな特徴は、生命に3つのドメインがあるという強力な証拠を提供した。^[5]M. ジャンナスキイが全ゲノムランダムシーケンシング法を用いて配列決定された後、いくつかの興味深い特徴が判明した。メタノカルドコッカスは、長さ1.66メガ塩基対、G+C含有量31.4%の大きな環状染色体を持つ。この種には、大きな環状外染色体と小さな環状外染色体もある。^[6]

分類

Methanocaldoccus jannaschiiはMethanocaldococcus属（以前はMethanococcusの一部）に属しており、そのため「クラス I」メタン生成菌と呼ばれることもあります（例 [1]）。

生物学と生化学

メタノカルドコッカス・ジャンナスキイは好熱性メタン生成菌であり、代謝副産物としてメタンを作りながら増殖する。他の多くのメタノコッカス（メタノコッカス・マリパルディスなど）がギ酸も主要エネルギー源として利用できるのとは異なり、この菌は二酸化炭素と水素を主要エネルギー源としてのみ増殖することができる。 [ ^3]ゲノムには、5,10-メテニルテトラヒドロメタノプテリンヒドロゲナーゼ、^[7]フェレドキシンヒドロゲナーゼ（EHA）、補酵素F420ヒドロゲナーゼなど、多くのヒドロゲナーゼが含まれている。^[8]

プロテオーム研究により、M. jannaschiiには多数のインテインが含まれていることが示され、ある研究では19種類のインテインが発見されました。^[9]

M. jannaschiiでは、多くの新しい代謝経路が解明されており、その中には多くのメタン生成補因子の合成経路^[2] 、リボフラビン^[10]、新しいアミノ酸合成経路などがある。^{[要出典]この生物では、古細菌特異的}DNA ポリメラーゼファミリー^[11]など、多くの情報処理経路も研究されている。M . jannaschiiの1 回膜貫通型タンパク質に関する情報は、 Membranome データベースにまとめられている。^[^要出典^]

参考文献

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さらに読む

Gao, Yongxiang (2013 年 11 月)。「Methanocaldococcus jannaschii 由来のアデニル酸キナーゼ MJ0458の結晶化と予備的 X 線回折分析」。Acta Crystallographica Section F 。69 ( 11 ): 1272– 1274。doi : 10.1107/S1744309113026638。PMC 3818051。PMID 24192367。
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外部リンク

Methano(caldo)coccus jannaschii の微生物 wiki エントリ
Methanocaldococcus jannaschii の UCSD ゲノムブラウザーエントリ
Methanocaldococcus jannaschii の KEGG エントリ
BacDive の Methanocaldococcus jannaschii の標準株 - 細菌多様性メタデータ

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シーケンシング

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生物学と生化学

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参考文献

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