マチュー・ブランシェット | |
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| 生まれる | マチュー・ダニエル・ブランシェット |
| 母校 | |
| 受賞歴 |
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| 科学者としてのキャリア | |
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| 論文 | 系統学的フットプリントのアルゴリズム (2002) |
| 博士課程の指導教員 | マーティン・トンパ[2] |
| その他の学術アドバイザー | |
| Webサイト | www.cs.mcgill.ca/~ブランシェム/ |
マチュー・ダニエル・ブランシェットは計算生物学者であり、マギル大学コンピュータサイエンス学部の学部長である。彼の研究は、DNA配列内の機能領域を検出するための新しいアルゴリズムの開発に焦点を当てている。[1] [3] [4] [5] [6] [7] [ 8] [9] [10]
教育
ブランシェットは、モントリオール大学で数学とコンピュータサイエンスを理学士(1997年)レベルで学び、その後、コンピュータサイエンスを理学修士(1998年)レベルで学びました。2002年にワシントン大学でマーティン・トンパの指導の下、博士号を取得しました。 [2] [11]彼の論文「系統学的フットプリントのアルゴリズム」[2] は、遺伝子順序系統発生のための最初の合理的なアルゴリズムを提示し、系統学的フットプリントについて詳しく説明しました。[12]その後、カリフォルニア大学サンタクルーズ校の生体分子科学工学センターで博士研究員として働き、デビッド・ハウスラーと共に働きました。[11] [12]
研究
ブランシェットは2002年にマギル大学コンピュータサイエンス学部の准教授に就任した。彼の研究[1] [4] [5]は、DNA配列の機能領域を検出するための計算方法の開発に焦点を当てている。彼のポスドク研究は、祖先哺乳類のゲノムを再構築するためのアルゴリズムを開発しました。彼の最近の研究はこの道を歩み続けており、特に遺伝子調節を推測するためのアルゴリズムの開発に力を入れています。[3] [12] [13] [14] [15]
受賞と栄誉
ブランシェットは2006年にISCBオーバートン賞を受賞し、「バイオインフォマティクスのいくつかの分野における基礎的かつ頻繁に引用される貢献」が認められた。[12]彼は2007年にスローン研究フェローシップを受賞した。[16]
ブランシェットは、ジャーナル「ゲノムリサーチ」の編集委員を務めており、2014年現在はジャーナル「分子生物学のためのアルゴリズム」の編集委員を務めています。[11] [17]
参考文献
- ^ abc Google Scholarにインデックスされた Mathieu Blanchette の出版物
- ^ abc Blanchette, Mathieu Daniel (2002).系統学的フットプリンティングのアルゴリズム(博士論文). ワシントン大学. ProQuest 305515226.
- ^ ab 「マチュー・ブランシェット - マギル大学コンピューターサイエンス学部助教授」 。 2014年3月2日閲覧。
- ^ DBLP書誌サーバーの Mathieu Blanchette
- ^ ab Blanchette, Mathieu の出版物はScopus書誌データベースに索引付けされています。(サブスクリプションが必要)
- ^ Blanchette, M.; Kent, WJ; Riemer, C.; Elnitski, L.; Smit, AF; Roskin, KM; Baertsch, R.; Rosenbloom, K.; Clawson, H.; Green, ED; Haussler, D.; Miller, W. (2004). 「Threaded Blockset Aligner による複数のゲノム配列のアラインメント」. Genome Research . 14 (4): 708–715. doi : 10.1101/gr.1933104. PMC 383317. PMID 15060014.
- ^ Thomas, JW; Touchman, JW; Blakesley, RW; Bouffard, GG; Beckstrom-Sternberg, SM; Margulies, EH; Blanchette, M; Siepel, AC; Thomas, PJ; McDowell, JC; Maskeri, B; Hansen, NF; Schwartz, MS; Weber, RJ; Kent, WJ; Karolchik, D; Bruen, TC; Bevan, R; Cutler, DJ; Schwartz, S; Elnitski, L; Idol, JR; Prasad, AB; Lee-Lin, SQ; Maduro, VV; Summers, TJ; Portnoy, ME; Dietrich, NL; Akhter, N; et al. (2003). 「標的ゲノム領域からの複数種配列の比較分析」。Nature . 424 ( 6950): 788–93. Bibcode :2003Natur.424..788T. doi :10.1038/nature01858. PMID 12917688. S2CID 2419233.
- ^ Blanchette, M; Tompa, M (2002). 「系統学的フットプリントの計算手法による調節要素の発見」.ゲノム研究. 12 (5): 739–48. doi : 10.1101/gr.6902. PMC 186562. PMID 11997340.
- ^ Guillemette, B; Bataille, AR; Gévry, N; Adam, M; Blanchette, M; Robert, F; Gaudreau, L (2005). 「変異ヒストン H2A.Z は不活性酵母遺伝子のプロモーター全体に局在し、ヌクレオソームの配置を制御する」. PLOS Biology . 3 (12): e384. doi : 10.1371/journal.pbio.0030384 . PMC 1275524. PMID 16248679 .
- ^ Margulies, EH; Blanchette, M; NISC Comparison Sequencing Program; Haussler, D; Green, ED (2003). 「多種多様な保存配列の同定と特徴付け」.ゲノム研究. 13 (12): 2507–18. doi :10.1101/gr.1602203. PMC 403793. PMID 14656959 .
- ^ abc "CompleteCV-2015" (PDF) . 2021年4月26日閲覧。
- ^ abcd Maisel, M. (2006). 「ISCB Honors Michael S. Waterman and Mathieu Blanchette」. PLOS Computational Biology . 2 (8): e105. Bibcode :2006PLSCB...2..105M. doi : 10.1371/journal.pcbi.0020105 . PMC 1526462 .
- ^ Blanchette, M; Green, ED; Miller, W; Haussler, D (2004). 「哺乳類の祖先ゲノムの大規模領域のコンピューターによる再構築」.ゲノム研究. 14 (12): 2412–23. doi :10.1101/gr.2800104. PMC 534665. PMID 15574820 .
- ^ Blanchette, M (2012). 「ヒト転写因子結合部位の予測のための祖先哺乳類ゲノムの活用」BMC Bioinformatics . 13 (Suppl 19): S2. doi : 10.1186/1471-2105-13-S19-S2 . PMC 3526440 . PMID 23281809.
- ^ Chen, X; Blanchette, M (2007). 「ベイジアンネットワークと回帰ツリーを使用した組織特異的シス調節モジュールの予測」BMC Bioinformatics . 8 (Suppl 10): S2. doi : 10.1186/1471-2105-8-S10-S2 . PMC 2230503 . PMID 18269696.
- ^ 「マギル大学が4人のスローン賞受賞」www.mcgill.ca . 2014年3月2日閲覧。
- ^ 「分子生物学のためのアルゴリズム - 編集委員会」www.almob.org 。 2014年3月2日閲覧。
