根井正俊

根井正俊
2013年の正俊
生まれる	( 1931-01-02 )1931年1月2日 宮崎県、日本
死亡	2023年5月18日(2023-05-18)（享年92歳） モリスタウン、ニュージャージー州、米国
国籍	アメリカ人
母校	京都大学 宮崎大学
知られている	分子進化の統計理論と突然変異駆動進化理論の発展
受賞歴	ジョン・スコット・メダル（2017年） 京都賞（2013年） トーマス・ハント・モーガン・メダル（2006年） 国際生物学賞（2002年）
科学者としてのキャリア
フィールド	進化生物学
機関	テンプル大学 ペンシルベニア州立大学 テキサス大学ヒューストン健康科学センター ブラウン大学 放射線医学総合研究所 京都大学
論文	統計遺伝学育種への応用に関する研究 (1959年)
博士課程の指導教員	赤戸 勝美
博士課程の学生	ダン・グラウル マーガレット・キッドウェル・アラヴィンダ ・チャクラヴァルティ・ スディール・クマール (研究者)
Webサイト	igem.temple.edu/labs/nei

根井正利（ねい まさとし、1931年1月2日 - 2023年5月18日）は、日本生まれのアメリカの進化生物学者。

根井正敏は1931年に日本の九州の宮崎県で生まれました。

1953年に宮崎大学で理学士号を取得し、同年、植物育種の数学に関する最初の論文を発表しました。^[1] 1959年に京都大学で作物改良のための量的遺伝学の博士号を取得しました。^[1]

その後10年間、根井は放射線医学総合研究所の研究員として勤務するなど日本で働き、1969年に米国に移住した。^[1]

ネイは、1969年から1972年までブラウン大学の生物学の准教授および教授を務め、 1972年から1990年までテキサス大学ヒューストン健康科学センター（UTHealth）の人口統計および人口遺伝学センターで集団遺伝学の教授を務めた。

彼は後にペンシルベニア州立大学のエヴァン・ピュー生物学教授となり、1990年から2015年まで分子進化遺伝学研究所の所長を務めた。

2015年より、ネイ氏はテンプル大学生物学部のローラ・H・カーネル非常勤教授として勤務しました。

彼は単独で、あるいは学生たちと共同で、分子生物学の発見を考慮に入れた分子進化を研究するための統計的手法を継続的に開発してきた。また、進化論の概念を発展させ、突然変異駆動型進化の理論を発展させた。^[1]

ネイはウォルター・フィッチとともに、 1983年に雑誌「分子生物学と進化」を共同設立し、 1993年には分子生物学と進化学会を設立した。 ^[2]

ネイは、遺伝子相互作用がある場合、自然選択は常に遺伝子座間の連鎖強度を高めるか、同じ連鎖関係を維持する傾向があることを数学的に初めて示した。^[3]彼は次に、ゲノムあたりの平均組換え値は、一般的に高等生物の方が下等生物よりも低いことを観察し、この観察を連鎖修正の理論に帰した。^[4]最近の分子データによると、Hox 遺伝子、免疫グロブリン遺伝子、ヒストン遺伝子などの相互作用する遺伝子の多くのセットは、進化の長い期間にわたって遺伝子クラスターとして存在してきたことが多い。この観察も、彼の連鎖修正の理論によって説明できる。彼はまた、RA フィッシャーの議論とは異なり、有限の集団では有害な突然変異がY 染色体または重複遺伝子にかなり急速に蓄積する可能性があることを示した。 ^{[5] [6]}

1969年、アミノ酸の置換、遺伝子の重複、遺伝子の不活性化の速度を考慮して、高等生物には多数の重複遺伝子と機能しない遺伝子（現在では疑似遺伝子と呼ばれている）が含まれていると予測した。^[7]この予測は、1980年代と1990年代に多くの多重遺伝子ファミリーと疑似遺伝子が発見されたときに正しいことが証明された。

1970年代初頭の彼の注目すべき貢献は、集団間の遺伝的距離（ネイの距離）の新しい尺度を提案し、それを集団または近縁種の進化的関係の研究に使用したことである。 ^[8]彼は後に、集団の系統樹のトポロジーを見つけるのに適したD _{Aと呼ばれる別の距離尺度を開発した。} ^{[9]彼はまた、} G _ST尺度を使用して、あらゆるタイプの交配システムの集団分化の程度を測定する統計を開発した。^[10] 1975年、彼と共同研究者は集団ボトルネック効果の数学的定式化を提示し、ボトルネック効果の遺伝学的意味を明らかにした。^{[11] 1979年、彼は}ヌクレオチド多様性と呼ばれる統計尺度を提案した。^[12]これは現在、ヌクレオチド多型の程度の測定に広く使用されている。彼はまた、いくつかの異なる種分化モデルを開発し、種間の生殖隔離は種間不適合性突然変異の蓄積の受動的なプロセスとして発生すると結論付けた^{[13] [14]}

1960年代初頭から1970年代にかけて、タンパク質の進化のメカニズムとタンパク質多型の維持について大きな論争がありました。ネイと彼の協力者は、多型データを使用して分子進化の中立理論をテストするためのさまざまな統計的手法を開発しました。対立遺伝子頻度分布、平均ヘテロ接合性と種間のタンパク質の多様性の関係などの分析により、タンパク質多型の大部分は中立理論で説明できることが示されました。^{[15] [16]}唯一の例外は、異常に高い多型性を示す主要組織適合遺伝子複合体（MHC）遺伝子座でした。これらの理由から、彼は中立進化理論を受け入れました。^{[16] [17]}

彼とAKロイチョウドリーは、遺伝的距離理論を用いて、ヨーロッパ人、アジア人、アフリカ人の間の遺伝的変異は、人類全体の遺伝的変異のわずか11パーセント程度であることを示した。彼らは、ヨーロッパ人とアジア人が分岐したのは約55,000年前、これら2つの集団がアフリカ人から分岐したのは約115,000年前であると推定した。^{[18] [ 19]}この結論は、より多くの遺伝子と集団を用いたその後の多くの研究によって裏付けられ、推定値は今でもおおよそ正しいと思われる。この発見は、人類起源説のアフリカ起源説の初期の兆候とみなすことができる。^[要出典]

1980年頃、根井と彼の学生は距離データに基づく系統樹の推定の研究を始めた。1985年に彼らは内部の枝の長さの統計的有意性を調べることによって系統樹の精度をテストするための統計的手法を開発した。その後、彼らは樹木の推定のための近隣結合法と最小進化法を開発した。^{[20] [21]} 彼らはまた、分子系統樹から進化時間を推定するための統計的手法も開発した。彼はスディール・クマールと田村耕一郎と共同で、系統解析用の広く使用されているコンピュータプログラムパッケージMEGAを開発した。^[22]

ネイらは、同義ヌクレオチド置換と非同義ヌクレオチド置換の数を比較することで、陽性ダーウィン選択を検出する簡単な統計的手法を発明した。 ^[23]この手法を適用して、MHC遺伝子座における異常に高い程度の配列多型は、優性選択によって引き起こされることを示した。 [ ^24]その後、このテストのためのさまざまな統計的手法が開発されましたが、元の手法は今でも広く使用されています。^[25]

ネイと彼の学生は、多数の多重遺伝子ファミリーの進化パターンを研究し、それらが一般に誕生と死のプロセスのモデルに従って進化することを示した。^[26]一部の遺伝子ファミリーでは、このプロセスは非常に速く、遺伝子重複と遺伝子欠失のランダムなイベントによって引き起こされ、遺伝子コピー数のゲノムドリフトを生成します。ネイは長い間、進化の原動力はあらゆる種類のDNA変化（ヌクレオチド変化、染色体変化、ゲノム重複）を含む突然変異であり、自然選択は主に適応度の低い遺伝子型を排除する力であるという見解を維持してきました（つまり、突然変異駆動型進化理論）。^{[16] [25]}彼は、免疫や嗅覚受容などの表現型形質を制御する遺伝子の進化の統計的分析を行い、この理論を裏付ける証拠を得ました。^[25]

根井正敏は1931年に日本で生まれ、生涯にわたる生物学と遺伝学への関心は、農家の家庭で育ったことに由来していると思われる。^[1]根井は日本で学士号と博士号を取得した後、1969年に米国に移住した。^[1]根井は結婚して2人の子供と2人の孫がおり、クラシック音楽を聴いたり、トピアリー彫刻を楽しんだ。^[1] 2014年に脳卒中を患い、ペンシルベニア州立大学を退職後、ニュージャージー州に移住した。^{[1]根井は2023年5月18日に}ニュージャージー州モリスタウンで92歳で亡くなった。^{[27] [28] [1]}

• 2017年：ジョン・スコット・メダル^[29]
• 2013年：京都基礎科学賞^[30]
• 2006年:トーマス・ハント・モーガン・メダル
• 2002年：宮崎大学名誉博士号
• 2002年:日本学術振興会国際生物学賞
• 1997年:米国科学アカデミー会員

• Nei, M. (2020)分子進化学者としての私の人生。Blurb、自費出版。
• Nei, M.(2013) 「突然変異駆動型進化」オックスフォード大学出版局、オックスフォード。
• Nei, M.、およびS. Kumar (2000) 「分子進化と系統学」オックスフォード大学出版局、オックスフォード。
• 全米研究会議（1996年）「DNA法医学的証拠の評価」全米アカデミー出版、ワシントンDC
• Roychoudhury, AK、M. Nei (1988) 「ヒト多型遺伝子：世界の分布」オックスフォード大学出版局、オックスフォードおよびニューヨーク。
• Nei, M. (1987)分子進化遺伝学、コロンビア大学出版局、ニューヨーク。
• Nei, M.、RK Koehn (編) (1983)遺伝子とタンパク質の進化Sinauer Assoc.、サンダーランド、マサチューセッツ州。
• Nei, M. (1975)分子集団遺伝学と進化.北ホラント、アムステルダム、ニューヨーク。

Scholia には、Masatoshi Neiの著者プロフィールがあります。

• 公式サイト