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モラーは1547年にリースニッツ（現在のザクセン＝アンハルト州ヴィッテンベルク近郊のクロプシュテット）で生まれ、1568年に下シレジア のレーヴェンベルクで聖歌隊長となった。大学に通ったことはなかったが、1572年に叙任され、ケッセルドルフ、レーヴェンベルク、シュプロッタウで牧師と助祭を務めた。1600年にゲルリッツに移り、そこでヤーコプ・ベーメが彼の教会員であった。ベーメはモラーが自宅で開催する礼拝に熱心に出席していたが、1606年にモラーがゲルリッツで亡くなった後になって初めて、ベーメはゲルリッツの聖職者たちと対立し始めた。
モラーの著作は、彼がベーメのように対立を煽るような神学者ではなく、むしろ融和的な神学者であったことを示している。彼にとって重要だったのは、教義ではなく実践的なキリスト教であった。この点において、彼はヨハン・アルントの先駆者とみなすことができる。
1601年に『福音実践』を出版した後、彼は隠れカルヴァン主義に共感していると疑われ、これらの主張を否定するためにほとんど何もしなかった。モラーが書いた他の有名な宗教文学作品には、『聖人の瞑想』（1584～1591年）、『イエス・キリストの受難についての独白』（1587年）、『大いなる神秘』 （1597年）などがある。これらの作品はすべて、モラーが神秘主義とつながりのある別のドイツ人神学者、ヴァレリウス・ヘルベルガーから影響を受けていたことを明確に示している。
彼はまた、いくつかの賛美歌も作詞しており、そのうち4曲は今日のドイツのプロテスタント賛美歌集に収録されている。しかし、彼は他の賛美歌作家にとっての源泉としてより重要な存在である。彼の『聖人の瞑想録』は、アウグスティヌス、クレルヴォーのベルナルドゥス、カンタベリーのアンセルムスの著作に基づいているとされる2部構成の祈りのコレクションである（実際にはこれらのテキストはおそらく偽アウグスティヌスおよび偽ベルナルドゥスであり、ずっと後に教父の様式で書かれたものであった）。この著作は、ヨハン・ヘールマンが『心の音楽への祈り』に収録した多くの賛美歌の基礎となった。
ヨハン・ゼバスティアン・バッハは、モーラーの賛美歌、またはモーラー作とされる2 つのコラール カンタータ、「 Ach Gott, wie manches Herzeleid , BWV 3」と、「Nimm von uns, Herr, du treuer Gott , BWV 101 」を書きました。